Protein–RNA interactions for Protein: Q3UW13

D130052B06Rik, RIKEN cDNA D130052B06 gene, mousemouse

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D130052B06RikQ3UW13 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
D130052B06RikQ3UW13 Cdh20-201ENSMUST00000062528 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
D130052B06RikQ3UW13 Tbc1d17-201ENSMUST00000047085 8750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
D130052B06RikQ3UW13 Cit-212ENSMUST00000141101 6794 ntTSL 5 BASIC9.15□□□□□ -0.94
D130052B06RikQ3UW13 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.95
D130052B06RikQ3UW13 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.95
D130052B06RikQ3UW13 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC9.15□□□□□ -0.95
D130052B06RikQ3UW13 Dlgap1-214ENSMUST00000155016 4712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.95
D130052B06RikQ3UW13 C2cd5-203ENSMUST00000171349 4292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.15□□□□□ -0.95
D130052B06RikQ3UW13 Rin3-201ENSMUST00000056950 3892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.95
D130052B06RikQ3UW13 Tcf12-218ENSMUST00000184783 3489 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.15□□□□□ -0.95
D130052B06RikQ3UW13 Lcmt2-202ENSMUST00000110674 3056 ntAPPRIS P1 BASIC9.15□□□□□ -0.95
D130052B06RikQ3UW13 Pphln1-202ENSMUST00000068457 3816 ntTSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.95
D130052B06RikQ3UW13 Tex2-201ENSMUST00000042780 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.95
D130052B06RikQ3UW13 Frmd8-201ENSMUST00000025728 4504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.95
D130052B06RikQ3UW13 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.95
D130052B06RikQ3UW13 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC9.15□□□□□ -0.95
D130052B06RikQ3UW13 Rbm10-202ENSMUST00000082089 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.15□□□□□ -0.95
D130052B06RikQ3UW13 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.95
D130052B06RikQ3UW13 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.95
D130052B06RikQ3UW13 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.95
D130052B06RikQ3UW13 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
D130052B06RikQ3UW13 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
D130052B06RikQ3UW13 Gpa33-202ENSMUST00000060833 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
D130052B06RikQ3UW13 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.14□□□□□ -0.95
D130052B06RikQ3UW13 Polr2a-201ENSMUST00000058470 6740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
D130052B06RikQ3UW13 1200007C13Rik-201ENSMUST00000143649 2455 ntTSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
D130052B06RikQ3UW13 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
D130052B06RikQ3UW13 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
D130052B06RikQ3UW13 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
D130052B06RikQ3UW13 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC9.14□□□□□ -0.95
D130052B06RikQ3UW13 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
D130052B06RikQ3UW13 Psen1-201ENSMUST00000041806 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
D130052B06RikQ3UW13 Hspa5-201ENSMUST00000028222 3672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
D130052B06RikQ3UW13 Mzf1-205ENSMUST00000182515 3340 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
D130052B06RikQ3UW13 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
D130052B06RikQ3UW13 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
D130052B06RikQ3UW13 Zfp174-201ENSMUST00000041778 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
D130052B06RikQ3UW13 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
D130052B06RikQ3UW13 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC9.14□□□□□ -0.95
D130052B06RikQ3UW13 Sema3g-201ENSMUST00000090180 4540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
D130052B06RikQ3UW13 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
D130052B06RikQ3UW13 Prx-202ENSMUST00000098644 4841 ntTSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
D130052B06RikQ3UW13 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
D130052B06RikQ3UW13 Trak1-213ENSMUST00000211439 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
D130052B06RikQ3UW13 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
D130052B06RikQ3UW13 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
D130052B06RikQ3UW13 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC9.14□□□□□ -0.95
D130052B06RikQ3UW13 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC9.14□□□□□ -0.95
D130052B06RikQ3UW13 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
D130052B06RikQ3UW13 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
D130052B06RikQ3UW13 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC9.14□□□□□ -0.95
D130052B06RikQ3UW13 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
D130052B06RikQ3UW13 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC9.14□□□□□ -0.95
D130052B06RikQ3UW13 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC9.14□□□□□ -0.95
D130052B06RikQ3UW13 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC9.14□□□□□ -0.95
D130052B06RikQ3UW13 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC9.14□□□□□ -0.95
D130052B06RikQ3UW13 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC9.14□□□□□ -0.95
D130052B06RikQ3UW13 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC9.14□□□□□ -0.95
D130052B06RikQ3UW13 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
D130052B06RikQ3UW13 Atg2a-201ENSMUST00000045351 6371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
D130052B06RikQ3UW13 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
D130052B06RikQ3UW13 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
D130052B06RikQ3UW13 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
D130052B06RikQ3UW13 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
D130052B06RikQ3UW13 9030624J02Rik-202ENSMUST00000059390 5097 ntTSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
D130052B06RikQ3UW13 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
D130052B06RikQ3UW13 Fgl2-201ENSMUST00000035799 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
D130052B06RikQ3UW13 Kcnh5-201ENSMUST00000042299 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
D130052B06RikQ3UW13 Eps15l1-201ENSMUST00000163643 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
D130052B06RikQ3UW13 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC9.14□□□□□ -0.95
D130052B06RikQ3UW13 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
D130052B06RikQ3UW13 9430038I01Rik-203ENSMUST00000120340 4643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
D130052B06RikQ3UW13 Sema4a-215ENSMUST00000169222 3084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.14□□□□□ -0.95
D130052B06RikQ3UW13 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC9.14□□□□□ -0.95
D130052B06RikQ3UW13 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
D130052B06RikQ3UW13 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
D130052B06RikQ3UW13 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
D130052B06RikQ3UW13 Ccdc162-208ENSMUST00000179614 2739 ntTSL 5 BASIC9.14□□□□□ -0.95
D130052B06RikQ3UW13 Dner-201ENSMUST00000049126 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
D130052B06RikQ3UW13 Unc45a-201ENSMUST00000032748 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
D130052B06RikQ3UW13 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC9.14□□□□□ -0.95
D130052B06RikQ3UW13 Astn1-202ENSMUST00000170718 2927 ntTSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
D130052B06RikQ3UW13 Prodh-205ENSMUST00000136776 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.14□□□□□ -0.95
D130052B06RikQ3UW13 Rbm47-205ENSMUST00000167950 4895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
D130052B06RikQ3UW13 Txlna-201ENSMUST00000046425 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
D130052B06RikQ3UW13 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
D130052B06RikQ3UW13 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC9.14□□□□□ -0.95
D130052B06RikQ3UW13 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
D130052B06RikQ3UW13 Cacnb2-203ENSMUST00000114723 3945 ntTSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
D130052B06RikQ3UW13 Timeless-201ENSMUST00000055539 4457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
D130052B06RikQ3UW13 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.13□□□□□ -0.95
D130052B06RikQ3UW13 Slc6a13-201ENSMUST00000064580 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
D130052B06RikQ3UW13 Slc34a3-201ENSMUST00000006638 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
D130052B06RikQ3UW13 Son-204ENSMUST00000119368 7529 ntTSL 5 BASIC9.13□□□□□ -0.95
D130052B06RikQ3UW13 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
D130052B06RikQ3UW13 Ermard-202ENSMUST00000061688 2120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
D130052B06RikQ3UW13 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC9.13□□□□□ -0.95
D130052B06RikQ3UW13 Trpv3-201ENSMUST00000049676 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
D130052B06RikQ3UW13 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms