Protein–RNA interactions for Protein: Q3US59

Gm28047, Predicted gene, 28047, mousemouse

Predictions only

Length 414 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28047Q3US59 Dnmt1-207ENSMUST00000216540 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm28047Q3US59 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm28047Q3US59 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm28047Q3US59 Col9a3-201ENSMUST00000103059 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm28047Q3US59 Syngap1-201ENSMUST00000081285 4315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm28047Q3US59 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm28047Q3US59 Tbx6-202ENSMUST00000172352 1529 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm28047Q3US59 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Gm28047Q3US59 Micu1-201ENSMUST00000020311 2336 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Gm28047Q3US59 Hmga2-203ENSMUST00000159699 3810 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Gm28047Q3US59 Aspg-201ENSMUST00000079400 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Gm28047Q3US59 Atp6ap1-202ENSMUST00000114171 2157 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Gm28047Q3US59 Ucp3-201ENSMUST00000032958 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Gm28047Q3US59 Cnot3-201ENSMUST00000038913 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Gm28047Q3US59 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm28047Q3US59 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm28047Q3US59 Glrx3-203ENSMUST00000211496 3440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm28047Q3US59 Engase-202ENSMUST00000135383 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm28047Q3US59 Gm15336-201ENSMUST00000128894 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm28047Q3US59 Nudt18-201ENSMUST00000089049 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm28047Q3US59 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm28047Q3US59 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm28047Q3US59 Inpp4b-215ENSMUST00000217122 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm28047Q3US59 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm28047Q3US59 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm28047Q3US59 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm28047Q3US59 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm28047Q3US59 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm28047Q3US59 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm28047Q3US59 Gm15317-201ENSMUST00000129569 699 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm28047Q3US59 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm28047Q3US59 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm28047Q3US59 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm28047Q3US59 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm28047Q3US59 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm28047Q3US59 Slc16a3-208ENSMUST00000168579 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm28047Q3US59 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm28047Q3US59 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm28047Q3US59 Acad12-202ENSMUST00000111776 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm28047Q3US59 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm28047Q3US59 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm28047Q3US59 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm28047Q3US59 Lypla1-201ENSMUST00000027036 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm28047Q3US59 Gm44401-201ENSMUST00000204462 2375 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm28047Q3US59 Myc-205ENSMUST00000161976 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm28047Q3US59 Myc-201ENSMUST00000022971 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm28047Q3US59 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm28047Q3US59 Gm12280-201ENSMUST00000155836 1624 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm28047Q3US59 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm28047Q3US59 Rasgrp2-207ENSMUST00000113475 573 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm28047Q3US59 Gm13185-201ENSMUST00000131044 944 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm28047Q3US59 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm28047Q3US59 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm28047Q3US59 AC073947.2-201ENSMUST00000215888 1130 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm28047Q3US59 AC192088.1-201ENSMUST00000227561 301 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm28047Q3US59 S100a8-201ENSMUST00000069927 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm28047Q3US59 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm28047Q3US59 Cbs-203ENSMUST00000118504 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm28047Q3US59 Timp3-201ENSMUST00000020234 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm28047Q3US59 4930453N24Rik-201ENSMUST00000076991 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm28047Q3US59 Exd2-201ENSMUST00000038185 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm28047Q3US59 Triml2-203ENSMUST00000209872 1395 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm28047Q3US59 Lctl-201ENSMUST00000034969 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm28047Q3US59 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm28047Q3US59 Gm29724-201ENSMUST00000214688 3062 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm28047Q3US59 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm28047Q3US59 Rtl6-201ENSMUST00000069476 4426 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm28047Q3US59 Cd34-202ENSMUST00000110815 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm28047Q3US59 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm28047Q3US59 Fbxo48-201ENSMUST00000061327 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm28047Q3US59 Ispd-205ENSMUST00000221895 4022 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm28047Q3US59 Cxadr-202ENSMUST00000114229 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm28047Q3US59 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm28047Q3US59 Mier3-203ENSMUST00000109272 5279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm28047Q3US59 Gm26577-201ENSMUST00000180680 2184 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm28047Q3US59 Rnf185-201ENSMUST00000064364 2906 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm28047Q3US59 Kdm2b-204ENSMUST00000118027 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm28047Q3US59 Tspan12-201ENSMUST00000031678 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm28047Q3US59 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm28047Q3US59 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm28047Q3US59 Cntf-201ENSMUST00000112933 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm28047Q3US59 Gm6161-201ENSMUST00000121942 1102 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm28047Q3US59 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm28047Q3US59 Gm16046-203ENSMUST00000150889 1001 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm28047Q3US59 Hnrnpa3-207ENSMUST00000164947 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm28047Q3US59 Gm6254-201ENSMUST00000168178 1072 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm28047Q3US59 Gm6153-201ENSMUST00000172004 1058 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm28047Q3US59 Gm9242-201ENSMUST00000177820 1074 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm28047Q3US59 1600014C23Rik-201ENSMUST00000178179 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm28047Q3US59 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm28047Q3US59 Gm5641-202ENSMUST00000198699 1080 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm28047Q3US59 3830422I06Rik-201ENSMUST00000200199 1181 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm28047Q3US59 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm28047Q3US59 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm28047Q3US59 CT573086.1-201ENSMUST00000227202 1074 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm28047Q3US59 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm28047Q3US59 Irak2-202ENSMUST00000089022 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm28047Q3US59 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm28047Q3US59 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm28047Q3US59 Ppil2-212ENSMUST00000164458 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.4 ms