Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPV3

E130208F15Rik, RIKEN cDNA E130208F15 gene, mousemouse

Predictions only

Length 143 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E130208F15RikQ3UPV3 Gm13292-201ENSMUST00000120014 1000 ntBASIC9.15□□□□□ -0.94
E130208F15RikQ3UPV3 Gm12403-201ENSMUST00000121384 959 ntBASIC9.15□□□□□ -0.94
E130208F15RikQ3UPV3 Gm13185-201ENSMUST00000131044 944 ntTSL 3 BASIC9.15□□□□□ -0.94
E130208F15RikQ3UPV3 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
E130208F15RikQ3UPV3 Rab10os-207ENSMUST00000179924 823 ntTSL 5 BASIC9.15□□□□□ -0.94
E130208F15RikQ3UPV3 Gm10359-201ENSMUST00000180167 1002 ntBASIC9.15□□□□□ -0.94
E130208F15RikQ3UPV3 Gm12033-201ENSMUST00000180654 1002 ntBASIC9.15□□□□□ -0.94
E130208F15RikQ3UPV3 Gm5559-201ENSMUST00000180755 1002 ntBASIC9.15□□□□□ -0.94
E130208F15RikQ3UPV3 Gm4335-201ENSMUST00000182581 1004 ntBASIC9.15□□□□□ -0.94
E130208F15RikQ3UPV3 Gm38223-201ENSMUST00000194484 695 ntBASIC9.15□□□□□ -0.94
E130208F15RikQ3UPV3 Gm18018-201ENSMUST00000198273 408 ntBASIC9.15□□□□□ -0.94
E130208F15RikQ3UPV3 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
E130208F15RikQ3UPV3 1810059H22Rik-208ENSMUST00000204941 642 ntTSL 2 BASIC9.15□□□□□ -0.94
E130208F15RikQ3UPV3 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC9.15□□□□□ -0.94
E130208F15RikQ3UPV3 Dkkl1-204ENSMUST00000210741 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.15□□□□□ -0.94
E130208F15RikQ3UPV3 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
E130208F15RikQ3UPV3 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC9.15□□□□□ -0.94
E130208F15RikQ3UPV3 Cby3-201ENSMUST00000052596 703 ntTSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
E130208F15RikQ3UPV3 Gm5129-201ENSMUST00000065372 300 ntAPPRIS P1 BASIC9.15□□□□□ -0.94
E130208F15RikQ3UPV3 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
E130208F15RikQ3UPV3 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
E130208F15RikQ3UPV3 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC9.15□□□□□ -0.94
E130208F15RikQ3UPV3 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.15□□□□□ -0.94
E130208F15RikQ3UPV3 Cpne1-201ENSMUST00000079312 1683 ntTSL 5 BASIC9.15□□□□□ -0.94
E130208F15RikQ3UPV3 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC9.15□□□□□ -0.94
E130208F15RikQ3UPV3 Gm12280-201ENSMUST00000155836 1624 ntTSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
E130208F15RikQ3UPV3 Miat-205ENSMUST00000182953 9163 ntTSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
E130208F15RikQ3UPV3 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.95
E130208F15RikQ3UPV3 4933434M16Rik-202ENSMUST00000153429 1940 ntTSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.95
E130208F15RikQ3UPV3 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.95
E130208F15RikQ3UPV3 Atg7-207ENSMUST00000182428 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.15□□□□□ -0.95
E130208F15RikQ3UPV3 Sema4a-214ENSMUST00000166237 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.95
E130208F15RikQ3UPV3 Rnf40-202ENSMUST00000205694 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.95
E130208F15RikQ3UPV3 Ciz1-202ENSMUST00000113331 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.15□□□□□ -0.95
E130208F15RikQ3UPV3 Ptgdr2-201ENSMUST00000037261 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.95
E130208F15RikQ3UPV3 Prg4-207ENSMUST00000162367 1480 ntTSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.95
E130208F15RikQ3UPV3 Cluh-201ENSMUST00000092915 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
E130208F15RikQ3UPV3 Ralgapb-203ENSMUST00000109486 8383 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
E130208F15RikQ3UPV3 Stpg2-202ENSMUST00000106239 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.14□□□□□ -0.95
E130208F15RikQ3UPV3 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.14□□□□□ -0.95
E130208F15RikQ3UPV3 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
E130208F15RikQ3UPV3 Pfkl-201ENSMUST00000020522 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
E130208F15RikQ3UPV3 Hnrnpc-211ENSMUST00000228748 1691 ntAPPRIS P5 BASIC9.14□□□□□ -0.95
E130208F15RikQ3UPV3 Rhog-202ENSMUST00000106923 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.14□□□□□ -0.95
E130208F15RikQ3UPV3 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC9.14□□□□□ -0.95
E130208F15RikQ3UPV3 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
E130208F15RikQ3UPV3 Emp1-206ENSMUST00000205156 2911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.14□□□□□ -0.95
E130208F15RikQ3UPV3 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
E130208F15RikQ3UPV3 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
E130208F15RikQ3UPV3 Agpat4-201ENSMUST00000024594 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
E130208F15RikQ3UPV3 Tomm5-204ENSMUST00000107810 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
E130208F15RikQ3UPV3 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
E130208F15RikQ3UPV3 Tagln2-201ENSMUST00000111228 716 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.14□□□□□ -0.95
E130208F15RikQ3UPV3 Gm15371-201ENSMUST00000117057 784 ntBASIC9.14□□□□□ -0.95
E130208F15RikQ3UPV3 Gm13134-202ENSMUST00000144347 387 ntTSL 2 BASIC9.14□□□□□ -0.95
E130208F15RikQ3UPV3 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
E130208F15RikQ3UPV3 Smim17-203ENSMUST00000161855 664 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.14□□□□□ -0.95
E130208F15RikQ3UPV3 Tnfrsf12a-202ENSMUST00000167059 858 ntTSL 2 BASIC9.14□□□□□ -0.95
E130208F15RikQ3UPV3 Gm26894-201ENSMUST00000180828 1134 ntTSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
E130208F15RikQ3UPV3 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
E130208F15RikQ3UPV3 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC9.14□□□□□ -0.95
E130208F15RikQ3UPV3 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
E130208F15RikQ3UPV3 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC9.14□□□□□ -0.95
E130208F15RikQ3UPV3 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
E130208F15RikQ3UPV3 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
E130208F15RikQ3UPV3 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
E130208F15RikQ3UPV3 Zyx-202ENSMUST00000164375 3188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
E130208F15RikQ3UPV3 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
E130208F15RikQ3UPV3 Kcnk13-201ENSMUST00000049788 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
E130208F15RikQ3UPV3 Slc38a10-204ENSMUST00000103018 4578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
E130208F15RikQ3UPV3 Gm15684-201ENSMUST00000160605 1814 ntTSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
E130208F15RikQ3UPV3 Mark2-215ENSMUST00000168872 2124 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.14□□□□□ -0.95
E130208F15RikQ3UPV3 Abat-203ENSMUST00000115839 2414 ntTSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
E130208F15RikQ3UPV3 Stxbp1-202ENSMUST00000077458 3616 ntTSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
E130208F15RikQ3UPV3 Gnas-204ENSMUST00000087877 3947 ntTSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
E130208F15RikQ3UPV3 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
E130208F15RikQ3UPV3 Gdf6-201ENSMUST00000057613 3532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
E130208F15RikQ3UPV3 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
E130208F15RikQ3UPV3 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
E130208F15RikQ3UPV3 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
E130208F15RikQ3UPV3 Cacna1g-206ENSMUST00000107788 8050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.14□□□□□ -0.95
E130208F15RikQ3UPV3 Cacna1g-211ENSMUST00000107793 8071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.14□□□□□ -0.95
E130208F15RikQ3UPV3 Ebf1-202ENSMUST00000101326 3422 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
E130208F15RikQ3UPV3 Glod4-201ENSMUST00000017430 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
E130208F15RikQ3UPV3 Tmem215-202ENSMUST00000179526 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
E130208F15RikQ3UPV3 Emc3-201ENSMUST00000032425 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
E130208F15RikQ3UPV3 Gm39377-201ENSMUST00000214587 2533 ntTSL 5 BASIC9.13□□□□□ -0.95
E130208F15RikQ3UPV3 Mllt6-201ENSMUST00000044730 7274 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
E130208F15RikQ3UPV3 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
E130208F15RikQ3UPV3 Ugt1a5-201ENSMUST00000097659 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
E130208F15RikQ3UPV3 Snph-201ENSMUST00000028951 4730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
E130208F15RikQ3UPV3 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
E130208F15RikQ3UPV3 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
E130208F15RikQ3UPV3 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
E130208F15RikQ3UPV3 Pdcd6-203ENSMUST00000222759 1376 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC9.13□□□□□ -0.95
E130208F15RikQ3UPV3 Stau2-215ENSMUST00000162435 2735 ntTSL 5 BASIC9.13□□□□□ -0.95
E130208F15RikQ3UPV3 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
E130208F15RikQ3UPV3 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
E130208F15RikQ3UPV3 Syngap1-201ENSMUST00000081285 4315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.13□□□□□ -0.95
E130208F15RikQ3UPV3 Cttnbp2nl-202ENSMUST00000098763 4834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.8 ms