Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPR8

D13Ertd608e, D13Ertd608e protein, mousemouse

Predictions only

Length 151 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D13Ertd608eQ3UPR8 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
D13Ertd608eQ3UPR8 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
D13Ertd608eQ3UPR8 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
D13Ertd608eQ3UPR8 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
D13Ertd608eQ3UPR8 Myo6-204ENSMUST00000113268 7927 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
D13Ertd608eQ3UPR8 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
D13Ertd608eQ3UPR8 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
D13Ertd608eQ3UPR8 Tbc1d2-201ENSMUST00000084621 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
D13Ertd608eQ3UPR8 Dysf-216ENSMUST00000204987 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
D13Ertd608eQ3UPR8 Hdac5-201ENSMUST00000008999 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
D13Ertd608eQ3UPR8 Matn2-203ENSMUST00000226766 3252 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm8108-202ENSMUST00000170207 1961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
D13Ertd608eQ3UPR8 Add2-202ENSMUST00000203196 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
D13Ertd608eQ3UPR8 Hnrnpdl-202ENSMUST00000128187 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
D13Ertd608eQ3UPR8 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
D13Ertd608eQ3UPR8 Naaa-201ENSMUST00000113102 2414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
D13Ertd608eQ3UPR8 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
D13Ertd608eQ3UPR8 Pdxdc1-204ENSMUST00000115804 2880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
D13Ertd608eQ3UPR8 Arhgap22-202ENSMUST00000111956 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
D13Ertd608eQ3UPR8 Csf1-202ENSMUST00000118593 3058 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
D13Ertd608eQ3UPR8 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
D13Ertd608eQ3UPR8 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.19□□□□□ -0.46
D13Ertd608eQ3UPR8 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC12.19□□□□□ -0.46
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
D13Ertd608eQ3UPR8 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.19□□□□□ -0.46
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC12.19□□□□□ -0.46
D13Ertd608eQ3UPR8 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
D13Ertd608eQ3UPR8 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
D13Ertd608eQ3UPR8 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
D13Ertd608eQ3UPR8 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC12.19□□□□□ -0.46
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm37472-201ENSMUST00000192342 4052 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
D13Ertd608eQ3UPR8 Mier1-205ENSMUST00000106858 4830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
D13Ertd608eQ3UPR8 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
D13Ertd608eQ3UPR8 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
D13Ertd608eQ3UPR8 9130019O22Rik-202ENSMUST00000164345 2735 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
D13Ertd608eQ3UPR8 Klhl38-201ENSMUST00000022985 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
D13Ertd608eQ3UPR8 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
D13Ertd608eQ3UPR8 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
D13Ertd608eQ3UPR8 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
D13Ertd608eQ3UPR8 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
D13Ertd608eQ3UPR8 Adcyap1r1-201ENSMUST00000070736 3695 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
D13Ertd608eQ3UPR8 Zfp536-201ENSMUST00000056338 4621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm15459-201ENSMUST00000117405 1941 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm8355-201ENSMUST00000177767 1941 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
D13Ertd608eQ3UPR8 Slc7a15-201ENSMUST00000036938 1907 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
D13Ertd608eQ3UPR8 Pfn4-204ENSMUST00000219503 4775 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
D13Ertd608eQ3UPR8 Gpr35-205ENSMUST00000186298 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
D13Ertd608eQ3UPR8 Msh4-201ENSMUST00000005630 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
D13Ertd608eQ3UPR8 Klhl30-201ENSMUST00000027533 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm14342-201ENSMUST00000137629 2119 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
D13Ertd608eQ3UPR8 Fbxo48-201ENSMUST00000061327 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
D13Ertd608eQ3UPR8 Kif13b-201ENSMUST00000100473 5603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
D13Ertd608eQ3UPR8 Dnpep-209ENSMUST00000187836 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
D13Ertd608eQ3UPR8 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
D13Ertd608eQ3UPR8 Ripk4-202ENSMUST00000113743 3743 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
D13Ertd608eQ3UPR8 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
D13Ertd608eQ3UPR8 Fam198a-202ENSMUST00000213773 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
D13Ertd608eQ3UPR8 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
D13Ertd608eQ3UPR8 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
D13Ertd608eQ3UPR8 Egfl6-201ENSMUST00000000412 2704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
D13Ertd608eQ3UPR8 Kcnj12-203ENSMUST00000108717 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
D13Ertd608eQ3UPR8 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
D13Ertd608eQ3UPR8 Psd-210ENSMUST00000225323 3398 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.18□□□□□ -0.46
D13Ertd608eQ3UPR8 Terf2ip-201ENSMUST00000052138 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
D13Ertd608eQ3UPR8 Zfp207-201ENSMUST00000017567 2245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
D13Ertd608eQ3UPR8 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
D13Ertd608eQ3UPR8 Sec14l2-201ENSMUST00000003681 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
D13Ertd608eQ3UPR8 Calcoco1-201ENSMUST00000023818 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
D13Ertd608eQ3UPR8 Golga4-201ENSMUST00000084820 7583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
D13Ertd608eQ3UPR8 Pgghg-204ENSMUST00000164580 3001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
D13Ertd608eQ3UPR8 Gad1-205ENSMUST00000130998 1705 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
D13Ertd608eQ3UPR8 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC12.18□□□□□ -0.46
D13Ertd608eQ3UPR8 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.18□□□□□ -0.46
D13Ertd608eQ3UPR8 Smim17-203ENSMUST00000161855 664 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.18□□□□□ -0.46
D13Ertd608eQ3UPR8 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
D13Ertd608eQ3UPR8 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
D13Ertd608eQ3UPR8 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
D13Ertd608eQ3UPR8 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
D13Ertd608eQ3UPR8 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm18934-201ENSMUST00000216671 1044 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
D13Ertd608eQ3UPR8 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
D13Ertd608eQ3UPR8 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
D13Ertd608eQ3UPR8 Rnf17-202ENSMUST00000223627 2077 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
D13Ertd608eQ3UPR8 Eps15l1-203ENSMUST00000212121 2686 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
D13Ertd608eQ3UPR8 Setdb1-201ENSMUST00000015841 4658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
D13Ertd608eQ3UPR8 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
D13Ertd608eQ3UPR8 Limch1-204ENSMUST00000118242 5050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm45740-201ENSMUST00000212103 2003 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
D13Ertd608eQ3UPR8 F630040K05Rik-202ENSMUST00000180558 2633 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
D13Ertd608eQ3UPR8 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
D13Ertd608eQ3UPR8 Ilvbl-212ENSMUST00000220430 2350 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
D13Ertd608eQ3UPR8 Bcl2l13-201ENSMUST00000009256 6925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
D13Ertd608eQ3UPR8 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
D13Ertd608eQ3UPR8 Ahi1-201ENSMUST00000105525 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm26651-201ENSMUST00000181851 2325 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.7 ms