Protein–RNA interactions for Protein: Q3UNB8

Tmem253, Transmembrane protein 253, mousemouse

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Length 204 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem253Q3UNB8 Asphd2-201ENSMUST00000031291 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Tmem253Q3UNB8 Bmp7-201ENSMUST00000009143 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Tmem253Q3UNB8 Runx1t1-204ENSMUST00000105566 6090 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Tmem253Q3UNB8 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Tmem253Q3UNB8 Thap1-201ENSMUST00000036807 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Tmem253Q3UNB8 Ank3-201ENSMUST00000047061 2517 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Tmem253Q3UNB8 Fhl4-202ENSMUST00000216889 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Tmem253Q3UNB8 Fgd2-201ENSMUST00000024810 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Tmem253Q3UNB8 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Tmem253Q3UNB8 Patj-201ENSMUST00000030290 2495 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Tmem253Q3UNB8 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Tmem253Q3UNB8 Tmem181a-201ENSMUST00000088940 4405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Tmem253Q3UNB8 Usp19-204ENSMUST00000178075 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Tmem253Q3UNB8 Usp19-202ENSMUST00000085044 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Tmem253Q3UNB8 Erlin1-206ENSMUST00000170801 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Tmem253Q3UNB8 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Tmem253Q3UNB8 Klk2-ps-202ENSMUST00000206865 2684 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Tmem253Q3UNB8 Bcl6-201ENSMUST00000023151 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Tmem253Q3UNB8 Fam198a-203ENSMUST00000214536 2789 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Tmem253Q3UNB8 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Tmem253Q3UNB8 E2f7-209ENSMUST00000174857 2865 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Tmem253Q3UNB8 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Tmem253Q3UNB8 Slc22a15-201ENSMUST00000106928 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Tmem253Q3UNB8 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Tmem253Q3UNB8 Tmtc3-201ENSMUST00000058154 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Tmem253Q3UNB8 Pigh-201ENSMUST00000072154 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Tmem253Q3UNB8 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Tmem253Q3UNB8 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Tmem253Q3UNB8 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Tmem253Q3UNB8 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Tmem253Q3UNB8 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Tmem253Q3UNB8 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Tmem253Q3UNB8 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Tmem253Q3UNB8 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Tmem253Q3UNB8 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Tmem253Q3UNB8 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Tmem253Q3UNB8 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Tmem253Q3UNB8 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Tmem253Q3UNB8 Pnpla6-211ENSMUST00000207941 4263 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Tmem253Q3UNB8 Sema4a-202ENSMUST00000107531 2897 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Tmem253Q3UNB8 Tgm1-202ENSMUST00000168729 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Tmem253Q3UNB8 Pygm-201ENSMUST00000035269 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Tmem253Q3UNB8 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Tmem253Q3UNB8 Gpa33-202ENSMUST00000060833 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Tmem253Q3UNB8 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Tmem253Q3UNB8 Hnrnpr-201ENSMUST00000084219 2647 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Tmem253Q3UNB8 Dcaf10-204ENSMUST00000155551 7250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Tmem253Q3UNB8 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Tmem253Q3UNB8 Gm38385-201ENSMUST00000194454 2351 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Tmem253Q3UNB8 Nr3c1-203ENSMUST00000115567 6436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Tmem253Q3UNB8 Bace1-201ENSMUST00000034591 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Tmem253Q3UNB8 Atp8a1-201ENSMUST00000037380 8178 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Tmem253Q3UNB8 Lrrc20-201ENSMUST00000049242 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Tmem253Q3UNB8 Pcid2-201ENSMUST00000164416 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Tmem253Q3UNB8 Shroom1-202ENSMUST00000093114 2886 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Tmem253Q3UNB8 Sertad2-203ENSMUST00000109586 5515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Tmem253Q3UNB8 C1qtnf6-201ENSMUST00000023075 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Tmem253Q3UNB8 Stxbp1-202ENSMUST00000077458 3616 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Tmem253Q3UNB8 Gpd1l-202ENSMUST00000129305 2543 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Tmem253Q3UNB8 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Tmem253Q3UNB8 Irak1-203ENSMUST00000101458 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Tmem253Q3UNB8 Ajuba-201ENSMUST00000054487 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Tmem253Q3UNB8 Calcoco1-201ENSMUST00000023818 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Tmem253Q3UNB8 Urgcp-203ENSMUST00000118076 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Tmem253Q3UNB8 Ano6-208ENSMUST00000227791 3149 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
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Tmem253Q3UNB8 Ankrd17-201ENSMUST00000014421 10458 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Tmem253Q3UNB8 Chst3-201ENSMUST00000068690 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Tmem253Q3UNB8 Parp3-202ENSMUST00000112479 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Tmem253Q3UNB8 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
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Tmem253Q3UNB8 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Tmem253Q3UNB8 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Tmem253Q3UNB8 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Tmem253Q3UNB8 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Tmem253Q3UNB8 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Tmem253Q3UNB8 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Tmem253Q3UNB8 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Tmem253Q3UNB8 Cdkl2-204ENSMUST00000113143 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Tmem253Q3UNB8 Pik3r6-201ENSMUST00000060441 3237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Tmem253Q3UNB8 Psmd8-207ENSMUST00000209034 1983 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Tmem253Q3UNB8 Tspan1-201ENSMUST00000030465 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Tmem253Q3UNB8 Ero1lb-201ENSMUST00000071973 4239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Tmem253Q3UNB8 Hnrnpdl-202ENSMUST00000128187 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Tmem253Q3UNB8 Hnf1b-201ENSMUST00000021016 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Tmem253Q3UNB8 Tcf12-218ENSMUST00000184783 3489 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Tmem253Q3UNB8 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Tmem253Q3UNB8 Rfc2-201ENSMUST00000023867 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Tmem253Q3UNB8 Msh4-201ENSMUST00000005630 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Tmem253Q3UNB8 Vps4b-202ENSMUST00000112736 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Tmem253Q3UNB8 Nfasc-207ENSMUST00000187861 4927 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Tmem253Q3UNB8 Apc2-202ENSMUST00000105359 9173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Tmem253Q3UNB8 Ak4-202ENSMUST00000106945 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Tmem253Q3UNB8 Plxdc1-201ENSMUST00000017561 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Tmem253Q3UNB8 Rpl9-204ENSMUST00000127874 2690 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Tmem253Q3UNB8 5930412G12Rik-203ENSMUST00000134673 2087 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Tmem253Q3UNB8 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Tmem253Q3UNB8 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Tmem253Q3UNB8 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Tmem253Q3UNB8 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.8 ms