Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJB0

Sf3b2, Splicing factor 3b, subunit 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 878 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3b2Q3UJB0 Gm37737-201ENSMUST00000195013 1638 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Sf3b2Q3UJB0 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sf3b2Q3UJB0 Tmub1-203ENSMUST00000115036 1455 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sf3b2Q3UJB0 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sf3b2Q3UJB0 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sf3b2Q3UJB0 Limd2-203ENSMUST00000106875 936 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sf3b2Q3UJB0 Gm6335-201ENSMUST00000118081 1194 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Sf3b2Q3UJB0 Gm7816-201ENSMUST00000119884 1194 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Sf3b2Q3UJB0 Gm15542-201ENSMUST00000121585 1194 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Sf3b2Q3UJB0 Retn-201ENSMUST00000012849 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sf3b2Q3UJB0 Itpr3os-201ENSMUST00000143605 794 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sf3b2Q3UJB0 Erdr1-201ENSMUST00000177591 774 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sf3b2Q3UJB0 Gm28694-201ENSMUST00000190681 722 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sf3b2Q3UJB0 Rassf4-202ENSMUST00000203029 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sf3b2Q3UJB0 Acsm5-207ENSMUST00000207813 1084 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sf3b2Q3UJB0 Gm42067-201ENSMUST00000209642 647 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sf3b2Q3UJB0 Gm33104-201ENSMUST00000214178 1010 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sf3b2Q3UJB0 1700027J07Rik-202ENSMUST00000215747 1060 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sf3b2Q3UJB0 Abracl-204ENSMUST00000220110 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sf3b2Q3UJB0 Gm8712-201ENSMUST00000221090 701 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Sf3b2Q3UJB0 AC113031.8-201ENSMUST00000227856 631 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Sf3b2Q3UJB0 Riiad1-201ENSMUST00000029785 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sf3b2Q3UJB0 Asb9-201ENSMUST00000033756 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sf3b2Q3UJB0 Olfr1423-201ENSMUST00000087831 933 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sf3b2Q3UJB0 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sf3b2Q3UJB0 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sf3b2Q3UJB0 Ugt1a6a-201ENSMUST00000014263 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sf3b2Q3UJB0 Adh6a-202ENSMUST00000106247 1341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sf3b2Q3UJB0 Spatc1l-201ENSMUST00000009259 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sf3b2Q3UJB0 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sf3b2Q3UJB0 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sf3b2Q3UJB0 Gm14149-201ENSMUST00000123048 1853 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sf3b2Q3UJB0 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sf3b2Q3UJB0 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sf3b2Q3UJB0 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sf3b2Q3UJB0 Luc7l-201ENSMUST00000025023 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sf3b2Q3UJB0 Klhl32-204ENSMUST00000108218 7143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sf3b2Q3UJB0 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sf3b2Q3UJB0 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sf3b2Q3UJB0 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sf3b2Q3UJB0 Gm13047-201ENSMUST00000117116 815 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Sf3b2Q3UJB0 Dnajb6-202ENSMUST00000012734 1024 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sf3b2Q3UJB0 4930404N11Rik-201ENSMUST00000020456 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sf3b2Q3UJB0 Gm21057-202ENSMUST00000206111 512 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sf3b2Q3UJB0 Gm45433-201ENSMUST00000209386 247 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Sf3b2Q3UJB0 Gm8913-201ENSMUST00000209491 641 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Sf3b2Q3UJB0 CT025551.1-201ENSMUST00000223996 692 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Sf3b2Q3UJB0 Chodl-203ENSMUST00000114216 1550 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sf3b2Q3UJB0 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sf3b2Q3UJB0 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sf3b2Q3UJB0 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sf3b2Q3UJB0 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sf3b2Q3UJB0 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sf3b2Q3UJB0 Igf1-203ENSMUST00000105300 1673 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sf3b2Q3UJB0 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sf3b2Q3UJB0 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Sf3b2Q3UJB0 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sf3b2Q3UJB0 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sf3b2Q3UJB0 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sf3b2Q3UJB0 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sf3b2Q3UJB0 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sf3b2Q3UJB0 Nfyc-203ENSMUST00000118902 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sf3b2Q3UJB0 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sf3b2Q3UJB0 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sf3b2Q3UJB0 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sf3b2Q3UJB0 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sf3b2Q3UJB0 Gm10961-201ENSMUST00000106703 144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sf3b2Q3UJB0 Rps9-204ENSMUST00000108625 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sf3b2Q3UJB0 Cstl1-202ENSMUST00000109954 454 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sf3b2Q3UJB0 Gm6890-201ENSMUST00000114117 776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sf3b2Q3UJB0 Mageb17-ps-201ENSMUST00000117902 919 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Sf3b2Q3UJB0 Igfbp2-202ENSMUST00000120564 991 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sf3b2Q3UJB0 Gm17135-201ENSMUST00000167009 564 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sf3b2Q3UJB0 Gm29707-202ENSMUST00000198744 659 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sf3b2Q3UJB0 Gm45224-201ENSMUST00000208203 414 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Sf3b2Q3UJB0 Vmn1r213-201ENSMUST00000076897 1155 ntAPPRIS P2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sf3b2Q3UJB0 Krtap19-1-201ENSMUST00000081334 493 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sf3b2Q3UJB0 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sf3b2Q3UJB0 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sf3b2Q3UJB0 Sparc-209ENSMUST00000216313 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sf3b2Q3UJB0 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sf3b2Q3UJB0 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Sf3b2Q3UJB0 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sf3b2Q3UJB0 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sf3b2Q3UJB0 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sf3b2Q3UJB0 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sf3b2Q3UJB0 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sf3b2Q3UJB0 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sf3b2Q3UJB0 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sf3b2Q3UJB0 Mapk8-204ENSMUST00000111944 1528 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sf3b2Q3UJB0 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sf3b2Q3UJB0 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sf3b2Q3UJB0 Slc36a1-202ENSMUST00000108867 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sf3b2Q3UJB0 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sf3b2Q3UJB0 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sf3b2Q3UJB0 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sf3b2Q3UJB0 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sf3b2Q3UJB0 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sf3b2Q3UJB0 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sf3b2Q3UJB0 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms