Protein–RNA interactions for Protein: Q3UI66

Ccdc34, Coiled-coil domain-containing protein 34, mousemouse

Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc34Q3UI66 Setd1a-201ENSMUST00000047075 6487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Ccdc34Q3UI66 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Ccdc34Q3UI66 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Ccdc34Q3UI66 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Ccdc34Q3UI66 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Ccdc34Q3UI66 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Ccdc34Q3UI66 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Ccdc34Q3UI66 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Ccdc34Q3UI66 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
Ccdc34Q3UI66 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Ccdc34Q3UI66 Gm18363-201ENSMUST00000221671 730 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
Ccdc34Q3UI66 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Ccdc34Q3UI66 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Ccdc34Q3UI66 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Ccdc34Q3UI66 Tfdp2-205ENSMUST00000179416 2408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Ccdc34Q3UI66 AI597479-201ENSMUST00000010434 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Ccdc34Q3UI66 D030025P21Rik-202ENSMUST00000220643 3987 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
Ccdc34Q3UI66 Arap1-202ENSMUST00000084896 4926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Ccdc34Q3UI66 Gnai3-201ENSMUST00000000001 3262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Ccdc34Q3UI66 Ints5-201ENSMUST00000096249 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Ccdc34Q3UI66 Trim26-205ENSMUST00000130367 3187 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Ccdc34Q3UI66 Wdr45-204ENSMUST00000115689 1568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Ccdc34Q3UI66 Tenm3-206ENSMUST00000190840 8663 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Ccdc34Q3UI66 Kcna10-201ENSMUST00000055064 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Ccdc34Q3UI66 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Ccdc34Q3UI66 Senp3-201ENSMUST00000005336 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Ccdc34Q3UI66 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Ccdc34Q3UI66 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Ccdc34Q3UI66 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Ccdc34Q3UI66 Fam217b-201ENSMUST00000094251 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Ccdc34Q3UI66 Rgma-201ENSMUST00000094312 3586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Ccdc34Q3UI66 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Ccdc34Q3UI66 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Ccdc34Q3UI66 Ccnk-201ENSMUST00000101055 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Ccdc34Q3UI66 S1pr1-201ENSMUST00000055676 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Ccdc34Q3UI66 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Ccdc34Q3UI66 Gm3809-201ENSMUST00000180973 1006 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Ccdc34Q3UI66 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Ccdc34Q3UI66 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Ccdc34Q3UI66 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Ccdc34Q3UI66 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Ccdc34Q3UI66 A730020E08Rik-201ENSMUST00000180421 3387 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Ccdc34Q3UI66 Gpd1l-202ENSMUST00000129305 2543 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Ccdc34Q3UI66 Shtn1-202ENSMUST00000163821 3767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Ccdc34Q3UI66 Spry2-201ENSMUST00000022709 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Ccdc34Q3UI66 Chodl-202ENSMUST00000069148 2051 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Ccdc34Q3UI66 Cdc7-203ENSMUST00000117196 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Ccdc34Q3UI66 Zfp783-204ENSMUST00000130490 4419 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Ccdc34Q3UI66 Nr2c2-202ENSMUST00000113463 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Ccdc34Q3UI66 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Ccdc34Q3UI66 Bcl6-201ENSMUST00000023151 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Ccdc34Q3UI66 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Ccdc34Q3UI66 Pcdh8-204ENSMUST00000195355 3704 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Ccdc34Q3UI66 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Ccdc34Q3UI66 Pygo2-202ENSMUST00000107413 2911 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Ccdc34Q3UI66 Prx-204ENSMUST00000125990 4298 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ccdc34Q3UI66 Tnk1-201ENSMUST00000001626 2778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ccdc34Q3UI66 Hlcs-201ENSMUST00000099512 4833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ccdc34Q3UI66 Nsd3-206ENSMUST00000142395 10105 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ccdc34Q3UI66 Serpinb12-201ENSMUST00000081277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ccdc34Q3UI66 Arl14ep-201ENSMUST00000028536 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ccdc34Q3UI66 Nxf1-201ENSMUST00000010241 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ccdc34Q3UI66 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ccdc34Q3UI66 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ccdc34Q3UI66 Epha5-206ENSMUST00000113406 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ccdc34Q3UI66 Gfra1-201ENSMUST00000026076 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ccdc34Q3UI66 Lrrc3-201ENSMUST00000057608 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ccdc34Q3UI66 Rgs12-207ENSMUST00000114285 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ccdc34Q3UI66 Sh2d5-202ENSMUST00000105824 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ccdc34Q3UI66 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ccdc34Q3UI66 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
Ccdc34Q3UI66 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ccdc34Q3UI66 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ccdc34Q3UI66 Ercc2-202ENSMUST00000108460 3485 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ccdc34Q3UI66 Dlg4-203ENSMUST00000108588 3457 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ccdc34Q3UI66 Hck-204ENSMUST00000191431 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ccdc34Q3UI66 Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ccdc34Q3UI66 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ccdc34Q3UI66 Zufsp-201ENSMUST00000048222 2991 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ccdc34Q3UI66 Slc38a10-216ENSMUST00000179094 4052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ccdc34Q3UI66 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ccdc34Q3UI66 Gm11476-201ENSMUST00000127006 2019 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ccdc34Q3UI66 AC151895.1-201ENSMUST00000219025 1742 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
Ccdc34Q3UI66 Acvr1c-201ENSMUST00000028178 9162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ccdc34Q3UI66 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
Ccdc34Q3UI66 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Ccdc34Q3UI66 Lcmt2-202ENSMUST00000110674 3056 ntAPPRIS P1 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Ccdc34Q3UI66 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Ccdc34Q3UI66 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Ccdc34Q3UI66 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Ccdc34Q3UI66 Psd2-205ENSMUST00000176873 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Ccdc34Q3UI66 Dgcr2-203ENSMUST00000117082 2987 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Ccdc34Q3UI66 Gm26635-201ENSMUST00000181077 3199 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Ccdc34Q3UI66 Zfp422-202ENSMUST00000079749 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Ccdc34Q3UI66 Cadm1-203ENSMUST00000114547 4444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Ccdc34Q3UI66 Insrr-202ENSMUST00000107582 4694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Ccdc34Q3UI66 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Ccdc34Q3UI66 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Ccdc34Q3UI66 Gm13183-201ENSMUST00000118615 789 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
Ccdc34Q3UI66 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.7 ms