Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHX8

Nkx6-3, Homeobox protein Nkx-6.3, mousemouse

Predictions only

Length 262 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkx6-3Q3UHX8 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Nkx6-3Q3UHX8 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Nkx6-3Q3UHX8 Lgals12-203ENSMUST00000159983 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Nkx6-3Q3UHX8 Pnpla5-201ENSMUST00000019012 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Nkx6-3Q3UHX8 Mad2l2-203ENSMUST00000105707 949 ntTSL 3 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Nkx6-3Q3UHX8 Lsm2-202ENSMUST00000114011 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Nkx6-3Q3UHX8 Gm12945-201ENSMUST00000140080 674 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Nkx6-3Q3UHX8 Ssr4-208ENSMUST00000166518 800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Nkx6-3Q3UHX8 Aif1-206ENSMUST00000173324 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Nkx6-3Q3UHX8 Tgif2-ps1-201ENSMUST00000203590 713 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Nkx6-3Q3UHX8 AC122459.1-201ENSMUST00000228373 885 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Nkx6-3Q3UHX8 Tomm7-201ENSMUST00000030851 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Nkx6-3Q3UHX8 Pin1rt1-201ENSMUST00000099659 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Nkx6-3Q3UHX8 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Nkx6-3Q3UHX8 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Nkx6-3Q3UHX8 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Nkx6-3Q3UHX8 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Nkx6-3Q3UHX8 Gm45684-201ENSMUST00000210244 1571 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Nkx6-3Q3UHX8 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Nkx6-3Q3UHX8 Stk33-204ENSMUST00000121748 2295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Nkx6-3Q3UHX8 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Nkx6-3Q3UHX8 Ninj1-202ENSMUST00000120733 1321 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Nkx6-3Q3UHX8 Krt40-201ENSMUST00000074253 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Nkx6-3Q3UHX8 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Nkx6-3Q3UHX8 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Nkx6-3Q3UHX8 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Nkx6-3Q3UHX8 Scg3-202ENSMUST00000213324 2152 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Nkx6-3Q3UHX8 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Nkx6-3Q3UHX8 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Nkx6-3Q3UHX8 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC12.58□□□□□ -0.39
Nkx6-3Q3UHX8 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
Nkx6-3Q3UHX8 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
Nkx6-3Q3UHX8 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
Nkx6-3Q3UHX8 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
Nkx6-3Q3UHX8 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
Nkx6-3Q3UHX8 Ifi35-201ENSMUST00000010502 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Nkx6-3Q3UHX8 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Nkx6-3Q3UHX8 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Nkx6-3Q3UHX8 Pla2g5-204ENSMUST00000102513 2289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
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Nkx6-3Q3UHX8 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Nkx6-3Q3UHX8 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Nkx6-3Q3UHX8 Zfand4-202ENSMUST00000112900 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Nkx6-3Q3UHX8 Gm13226-201ENSMUST00000117838 404 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Nkx6-3Q3UHX8 Nde1-203ENSMUST00000117958 1551 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
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Nkx6-3Q3UHX8 Gm11978-201ENSMUST00000122315 466 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Nkx6-3Q3UHX8 Pisd-ps2-202ENSMUST00000142526 1175 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Nkx6-3Q3UHX8 Rwdd3-209ENSMUST00000170781 1111 ntTSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
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Nkx6-3Q3UHX8 Mir7221-201ENSMUST00000184009 72 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Nkx6-3Q3UHX8 Gm37497-201ENSMUST00000195830 798 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Nkx6-3Q3UHX8 Dnajb6-210ENSMUST00000196528 1018 ntTSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Nkx6-3Q3UHX8 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
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Nkx6-3Q3UHX8 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Nkx6-3Q3UHX8 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Nkx6-3Q3UHX8 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Nkx6-3Q3UHX8 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
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Nkx6-3Q3UHX8 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Nkx6-3Q3UHX8 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
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Nkx6-3Q3UHX8 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Nkx6-3Q3UHX8 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Nkx6-3Q3UHX8 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Nkx6-3Q3UHX8 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
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Nkx6-3Q3UHX8 Olfr1234-202ENSMUST00000111543 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.57□□□□□ -0.4
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Nkx6-3Q3UHX8 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Nkx6-3Q3UHX8 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Nkx6-3Q3UHX8 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Nkx6-3Q3UHX8 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Nkx6-3Q3UHX8 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Nkx6-3Q3UHX8 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Nkx6-3Q3UHX8 Adsl-206ENSMUST00000168756 1439 ntTSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Nkx6-3Q3UHX8 Zfp157-202ENSMUST00000100524 869 ntTSL 3 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Nkx6-3Q3UHX8 Trav4-2-201ENSMUST00000103637 370 ntAPPRIS P1 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Nkx6-3Q3UHX8 Timm10b-202ENSMUST00000106780 671 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Nkx6-3Q3UHX8 Gm13369-201ENSMUST00000119442 987 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
Nkx6-3Q3UHX8 Gm16177-201ENSMUST00000120728 718 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
Nkx6-3Q3UHX8 Commd6-203ENSMUST00000168587 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Nkx6-3Q3UHX8 Rims3-204ENSMUST00000171363 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Nkx6-3Q3UHX8 Mir7085-201ENSMUST00000184353 66 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
Nkx6-3Q3UHX8 Dnm3os-203ENSMUST00000185878 557 ntTSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Nkx6-3Q3UHX8 Lamtor1-202ENSMUST00000193465 661 ntTSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Nkx6-3Q3UHX8 Gm38161-201ENSMUST00000195344 576 ntTSL 2 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Nkx6-3Q3UHX8 Hax1-207ENSMUST00000198782 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Nkx6-3Q3UHX8 Gm9299-201ENSMUST00000206392 1140 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
Nkx6-3Q3UHX8 Gm2824-203ENSMUST00000226189 1228 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
Nkx6-3Q3UHX8 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Nkx6-3Q3UHX8 1700123K08Rik-201ENSMUST00000031501 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Nkx6-3Q3UHX8 Tmem107-201ENSMUST00000075980 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Nkx6-3Q3UHX8 Rpl36-201ENSMUST00000080492 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Nkx6-3Q3UHX8 Ctgf-203ENSMUST00000176228 2490 ntTSL 2 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Nkx6-3Q3UHX8 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Nkx6-3Q3UHX8 Chchd10-203ENSMUST00000219839 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
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