Protein–RNA interactions for Protein: Q3UGP9

Lrrc58, Leucine-rich repeat-containing protein 58, mousemouse

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Length 366 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc58Q3UGP9 Naa40-201ENSMUST00000025675 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lrrc58Q3UGP9 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lrrc58Q3UGP9 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lrrc58Q3UGP9 Clmp-201ENSMUST00000034522 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lrrc58Q3UGP9 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lrrc58Q3UGP9 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Lrrc58Q3UGP9 Pex12-207ENSMUST00000176518 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lrrc58Q3UGP9 Fnbp4-201ENSMUST00000013759 4691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lrrc58Q3UGP9 Inhba-201ENSMUST00000042603 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lrrc58Q3UGP9 Smim14-205ENSMUST00000139122 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lrrc58Q3UGP9 Tmprss9-203ENSMUST00000219817 3581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lrrc58Q3UGP9 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lrrc58Q3UGP9 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lrrc58Q3UGP9 Cdc73-201ENSMUST00000018337 11586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lrrc58Q3UGP9 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lrrc58Q3UGP9 Yipf6-201ENSMUST00000054697 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lrrc58Q3UGP9 Efhc1-201ENSMUST00000038447 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lrrc58Q3UGP9 Celf1-202ENSMUST00000068726 7851 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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Lrrc58Q3UGP9 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lrrc58Q3UGP9 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lrrc58Q3UGP9 Mcm8-201ENSMUST00000028831 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lrrc58Q3UGP9 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lrrc58Q3UGP9 Astl-202ENSMUST00000089673 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
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Lrrc58Q3UGP9 Pde12-201ENSMUST00000052932 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lrrc58Q3UGP9 Nr4a3-201ENSMUST00000030025 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lrrc58Q3UGP9 Mier3-203ENSMUST00000109272 5279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lrrc58Q3UGP9 Slc38a10-204ENSMUST00000103018 4578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lrrc58Q3UGP9 Celsr1-201ENSMUST00000016172 10879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lrrc58Q3UGP9 Myc-205ENSMUST00000161976 2338 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lrrc58Q3UGP9 Myc-201ENSMUST00000022971 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lrrc58Q3UGP9 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
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Lrrc58Q3UGP9 Rhot1-204ENSMUST00000092857 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lrrc58Q3UGP9 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lrrc58Q3UGP9 Ap4b1-203ENSMUST00000106823 2741 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lrrc58Q3UGP9 Zfp575-201ENSMUST00000094705 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lrrc58Q3UGP9 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
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Lrrc58Q3UGP9 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lrrc58Q3UGP9 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lrrc58Q3UGP9 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lrrc58Q3UGP9 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lrrc58Q3UGP9 Rab10os-207ENSMUST00000179924 823 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
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Lrrc58Q3UGP9 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lrrc58Q3UGP9 AC162801.1-201ENSMUST00000220612 198 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
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Lrrc58Q3UGP9 Rinl-201ENSMUST00000059857 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
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Lrrc58Q3UGP9 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
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Lrrc58Q3UGP9 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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Lrrc58Q3UGP9 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Lrrc58Q3UGP9 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Lrrc58Q3UGP9 Nfkb2-201ENSMUST00000073116 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Lrrc58Q3UGP9 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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Lrrc58Q3UGP9 Ptn-202ENSMUST00000201321 2558 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Lrrc58Q3UGP9 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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Lrrc58Q3UGP9 Ppip5k2-202ENSMUST00000112845 6239 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Lrrc58Q3UGP9 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Lrrc58Q3UGP9 Tmem219-202ENSMUST00000119781 1118 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Lrrc58Q3UGP9 Gm21887-201ENSMUST00000178789 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Lrrc58Q3UGP9 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Lrrc58Q3UGP9 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Lrrc58Q3UGP9 Gm4129-201ENSMUST00000220083 625 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Lrrc58Q3UGP9 AC159006.1-201ENSMUST00000226396 258 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Lrrc58Q3UGP9 Map6-205ENSMUST00000207883 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Lrrc58Q3UGP9 4930513N10Rik-204ENSMUST00000212647 3957 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Lrrc58Q3UGP9 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Lrrc58Q3UGP9 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Lrrc58Q3UGP9 Gm996-204ENSMUST00000191602 4812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Lrrc58Q3UGP9 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Lrrc58Q3UGP9 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Lrrc58Q3UGP9 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Lrrc58Q3UGP9 Edrf1-201ENSMUST00000051169 5424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Lrrc58Q3UGP9 Polrmt-202ENSMUST00000159016 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Lrrc58Q3UGP9 Rgs9bp-201ENSMUST00000069912 6590 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.5 ms