Protein–RNA interactions for Protein: Q3U595

UPF0545 protein C22orf39 homolog, mousemouse

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Length 105 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3U595 B3gat2-201ENSMUST00000063663 5655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Q3U595 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Q3U595 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Q3U595 Gtf2i-203ENSMUST00000111261 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Q3U595 Atp6ap1-202ENSMUST00000114171 2157 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Q3U595 Nek1-209ENSMUST00000211672 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Q3U595 Mslnl-201ENSMUST00000047098 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Q3U595 Grm5-202ENSMUST00000125009 8047 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Q3U595 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Q3U595 Gm15684-201ENSMUST00000160605 1814 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Q3U595 Neu2-204ENSMUST00000165109 1824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Q3U595 Armcx1-202ENSMUST00000051256 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Q3U595 Tcf4-204ENSMUST00000114978 2437 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Q3U595 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Q3U595 Podn-201ENSMUST00000044248 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Q3U595 Wnt7a-201ENSMUST00000032180 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Q3U595 Myo18a-202ENSMUST00000092884 5117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Q3U595 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Q3U595 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Q3U595 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Q3U595 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Q3U595 Tmed9-203ENSMUST00000224741 1450 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Q3U595 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Q3U595 Kcnn2-201ENSMUST00000066890 3682 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Q3U595 Fosb-207ENSMUST00000208505 3523 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Q3U595 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Q3U595 Lgals12-202ENSMUST00000099729 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Q3U595 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Q3U595 Crtc1-201ENSMUST00000076615 5683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Q3U595 5330426L24Rik-201ENSMUST00000200008 2175 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Q3U595 Arhgef2-229ENSMUST00000177303 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Q3U595 Ywhab-201ENSMUST00000018470 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Q3U595 Sdf4-201ENSMUST00000050078 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Q3U595 Runx1-201ENSMUST00000023673 5861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Q3U595 Fcgr1-201ENSMUST00000029748 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Q3U595 Ap2a1-201ENSMUST00000085399 3442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Q3U595 Gm26551-201ENSMUST00000181262 2432 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Q3U595 Eme1-201ENSMUST00000039949 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Q3U595 Slc35e2-202ENSMUST00000105608 6291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Q3U595 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Q3U595 Ptp4a1-201ENSMUST00000027232 4145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Q3U595 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Q3U595 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Q3U595 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Q3U595 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Q3U595 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Q3U595 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Q3U595 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Q3U595 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Q3U595 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Q3U595 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Q3U595 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Q3U595 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Q3U595 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Q3U595 9430007M09Rik-201ENSMUST00000201947 804 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Q3U595 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Q3U595 0610005C13Rik-202ENSMUST00000209510 671 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Q3U595 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Q3U595 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Q3U595 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Q3U595 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Q3U595 Acbd5-213ENSMUST00000227809 1986 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Q3U595 Ssr1-203ENSMUST00000225246 1825 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Q3U595 Rnf44-218ENSMUST00000177950 3941 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Q3U595 Dct-201ENSMUST00000022725 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Q3U595 Pcdhgb1-201ENSMUST00000192931 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Q3U595 AI839979-202ENSMUST00000201790 1539 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Q3U595 Sidt1-205ENSMUST00000136381 4404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Q3U595 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Q3U595 Slc6a6-201ENSMUST00000032185 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Q3U595 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Q3U595 Tle6-201ENSMUST00000072020 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Q3U595 Gm42957-201ENSMUST00000137564 3624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Q3U595 Dbndd1-203ENSMUST00000177240 1463 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Q3U595 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Q3U595 Gm10176-201ENSMUST00000159707 2264 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Q3U595 Irf1-202ENSMUST00000108920 2137 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Q3U595 Nxf1-211ENSMUST00000184970 5591 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Q3U595 Scarf1-201ENSMUST00000042808 2887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Q3U595 Adamts3-204ENSMUST00000198151 1833 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Q3U595 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Q3U595 Gm10305-201ENSMUST00000195331 2475 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Q3U595 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Q3U595 Vash2-201ENSMUST00000047409 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Q3U595 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Q3U595 Cacna2d1-209ENSMUST00000199704 3861 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Q3U595 Prnd-203ENSMUST00000110171 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Q3U595 Larp4-202ENSMUST00000100206 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Q3U595 Mrps30-201ENSMUST00000022245 3319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Q3U595 Hp1bp3-201ENSMUST00000030541 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Q3U595 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Q3U595 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Q3U595 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Q3U595 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Q3U595 Prss54-202ENSMUST00000180075 1152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Q3U595 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Q3U595 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Q3U595 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Q3U595 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Q3U595 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32 ms