Protein–RNA interactions for Protein: Q3U319

Rnf40, E3 ubiquitin-protein ligase BRE1B, mousemouse

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Length 1,001 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Rnf40Q3U319 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rnf40Q3U319 Foxl2os-201ENSMUST00000181706 3095 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rnf40Q3U319 Myadm-203ENSMUST00000203328 1899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rnf40Q3U319 Ints5-201ENSMUST00000096249 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rnf40Q3U319 Mgme1-202ENSMUST00000110027 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rnf40Q3U319 Nsun7-204ENSMUST00000202994 3632 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rnf40Q3U319 Ahi1-201ENSMUST00000105525 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rnf40Q3U319 Hck-204ENSMUST00000191431 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rnf40Q3U319 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
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Rnf40Q3U319 Dnajc30-201ENSMUST00000071263 1661 ntAPPRIS P1 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rnf40Q3U319 Tacr2-201ENSMUST00000020278 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rnf40Q3U319 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rnf40Q3U319 Cpeb3-204ENSMUST00000126188 4224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
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Rnf40Q3U319 Gsn-205ENSMUST00000201185 2607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
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Rnf40Q3U319 Ttc23l-201ENSMUST00000022857 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
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Rnf40Q3U319 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
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Rnf40Q3U319 Rdh19-201ENSMUST00000077530 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
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Rnf40Q3U319 Rnf4-201ENSMUST00000030992 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rnf40Q3U319 Ptger4-202ENSMUST00000120563 3312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
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Rnf40Q3U319 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
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Rnf40Q3U319 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rnf40Q3U319 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rnf40Q3U319 Vmn1r185-201ENSMUST00000171039 1144 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
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Rnf40Q3U319 Sult1e1-201ENSMUST00000031201 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
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Rnf40Q3U319 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rnf40Q3U319 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
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Rnf40Q3U319 Ccrl2-203ENSMUST00000199839 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rnf40Q3U319 Cd200r1-201ENSMUST00000057488 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rnf40Q3U319 Rbm10-202ENSMUST00000082089 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
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