Protein–RNA interactions for Protein: Q3TYX8

Rufy4, RUN and FYVE domain-containing protein 4, mousemouse

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Length 563 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rufy4Q3TYX8 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rufy4Q3TYX8 Eps8l1-214ENSMUST00000171445 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rufy4Q3TYX8 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rufy4Q3TYX8 1600020E01Rik-206ENSMUST00000204663 2007 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rufy4Q3TYX8 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rufy4Q3TYX8 Kansl2-ps-201ENSMUST00000181818 1461 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Rufy4Q3TYX8 Gm14149-201ENSMUST00000123048 1853 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rufy4Q3TYX8 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rufy4Q3TYX8 N6amt1-203ENSMUST00000118310 1700 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rufy4Q3TYX8 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rufy4Q3TYX8 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rufy4Q3TYX8 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rufy4Q3TYX8 AC096628.2-201ENSMUST00000225443 1413 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Rufy4Q3TYX8 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Rufy4Q3TYX8 Hnrnpc-211ENSMUST00000228748 1691 ntAPPRIS P5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rufy4Q3TYX8 Rad54b-202ENSMUST00000095145 2403 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rufy4Q3TYX8 Spatc1l-202ENSMUST00000105414 1060 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rufy4Q3TYX8 Leng8-202ENSMUST00000117274 874 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rufy4Q3TYX8 Gm13123-201ENSMUST00000122173 492 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Rufy4Q3TYX8 Tldc2-202ENSMUST00000166140 639 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rufy4Q3TYX8 Dnd1-ps-201ENSMUST00000196992 964 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Rufy4Q3TYX8 Gm43630-201ENSMUST00000201550 776 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Rufy4Q3TYX8 Gm43597-201ENSMUST00000201650 1057 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rufy4Q3TYX8 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rufy4Q3TYX8 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rufy4Q3TYX8 Pin1rt1-201ENSMUST00000099659 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rufy4Q3TYX8 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rufy4Q3TYX8 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rufy4Q3TYX8 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rufy4Q3TYX8 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rufy4Q3TYX8 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rufy4Q3TYX8 AC154725.1-201ENSMUST00000224826 1961 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Rufy4Q3TYX8 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rufy4Q3TYX8 Fbxl5-211ENSMUST00000196483 2814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rufy4Q3TYX8 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rufy4Q3TYX8 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rufy4Q3TYX8 Rnf26-205ENSMUST00000215685 1804 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rufy4Q3TYX8 Pced1b-201ENSMUST00000059433 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rufy4Q3TYX8 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rufy4Q3TYX8 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rufy4Q3TYX8 Cops4-201ENSMUST00000045993 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rufy4Q3TYX8 Ctgf-203ENSMUST00000176228 2490 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rufy4Q3TYX8 Dctn4-202ENSMUST00000223590 1530 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Rufy4Q3TYX8 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rufy4Q3TYX8 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rufy4Q3TYX8 Zfp157-202ENSMUST00000100524 869 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rufy4Q3TYX8 Gm15420-201ENSMUST00000133274 382 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rufy4Q3TYX8 Pisd-ps2-202ENSMUST00000142526 1175 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Rufy4Q3TYX8 Gm27682-201ENSMUST00000183930 110 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Rufy4Q3TYX8 2610300A13Rik-201ENSMUST00000192930 503 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Rufy4Q3TYX8 AC153962.4-201ENSMUST00000217878 242 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Rufy4Q3TYX8 Ier3-201ENSMUST00000003635 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rufy4Q3TYX8 Fam241b-202ENSMUST00000064050 1096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rufy4Q3TYX8 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rufy4Q3TYX8 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rufy4Q3TYX8 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rufy4Q3TYX8 C030005K06Rik-201ENSMUST00000129164 2076 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rufy4Q3TYX8 6030458C11Rik-202ENSMUST00000227299 3206 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Rufy4Q3TYX8 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rufy4Q3TYX8 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rufy4Q3TYX8 AC121805.2-201ENSMUST00000218808 2538 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Rufy4Q3TYX8 Ifi35-201ENSMUST00000010502 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rufy4Q3TYX8 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rufy4Q3TYX8 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rufy4Q3TYX8 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rufy4Q3TYX8 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rufy4Q3TYX8 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rufy4Q3TYX8 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rufy4Q3TYX8 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rufy4Q3TYX8 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rufy4Q3TYX8 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rufy4Q3TYX8 Ankmy2-201ENSMUST00000041640 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rufy4Q3TYX8 Drap1-209ENSMUST00000136579 734 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
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Rufy4Q3TYX8 Mturn-202ENSMUST00000187701 503 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rufy4Q3TYX8 Gm37424-201ENSMUST00000191727 561 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Rufy4Q3TYX8 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rufy4Q3TYX8 Mal-201ENSMUST00000028853 486 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rufy4Q3TYX8 Rpl10-202ENSMUST00000074085 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rufy4Q3TYX8 Sdf4-202ENSMUST00000097734 973 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rufy4Q3TYX8 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rufy4Q3TYX8 Nab1-204ENSMUST00000170269 1371 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rufy4Q3TYX8 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rufy4Q3TYX8 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rufy4Q3TYX8 Lmf2-201ENSMUST00000023283 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rufy4Q3TYX8 Gm16278-201ENSMUST00000148064 2071 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rufy4Q3TYX8 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rufy4Q3TYX8 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rufy4Q3TYX8 Zfp583-201ENSMUST00000062765 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rufy4Q3TYX8 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Rufy4Q3TYX8 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rufy4Q3TYX8 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rufy4Q3TYX8 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rufy4Q3TYX8 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rufy4Q3TYX8 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rufy4Q3TYX8 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rufy4Q3TYX8 4933436I20Rik-202ENSMUST00000190615 1509 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rufy4Q3TYX8 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rufy4Q3TYX8 Gm15684-201ENSMUST00000160605 1814 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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