Protein–RNA interactions for Protein: Q3TWW8

Srsf6, Serine/arginine-rich splicing factor 6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srsf6Q3TWW8 Ctbp2-209ENSMUST00000166439 1997 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Srsf6Q3TWW8 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Srsf6Q3TWW8 Igf1-203ENSMUST00000105300 1673 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Srsf6Q3TWW8 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Srsf6Q3TWW8 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Srsf6Q3TWW8 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Srsf6Q3TWW8 Canx-201ENSMUST00000020637 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Srsf6Q3TWW8 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Srsf6Q3TWW8 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Srsf6Q3TWW8 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Srsf6Q3TWW8 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Srsf6Q3TWW8 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Srsf6Q3TWW8 Unc45bos-201ENSMUST00000156395 1306 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Srsf6Q3TWW8 AC079680.2-201ENSMUST00000219181 1306 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Srsf6Q3TWW8 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Srsf6Q3TWW8 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Srsf6Q3TWW8 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Srsf6Q3TWW8 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Srsf6Q3TWW8 Gm10451-201ENSMUST00000101281 1598 ntTSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Srsf6Q3TWW8 Dnajb5-203ENSMUST00000098112 3093 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Srsf6Q3TWW8 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Srsf6Q3TWW8 Dolpp1-202ENSMUST00000113612 1958 ntTSL 3 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Srsf6Q3TWW8 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Srsf6Q3TWW8 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Srsf6Q3TWW8 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Srsf6Q3TWW8 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Srsf6Q3TWW8 Apoc1-202ENSMUST00000108451 532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Srsf6Q3TWW8 Gm9083-201ENSMUST00000120423 819 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Srsf6Q3TWW8 Rpsa-ps12-201ENSMUST00000120596 892 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Srsf6Q3TWW8 Olfr647-ps1-201ENSMUST00000121599 960 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Srsf6Q3TWW8 Odf4-202ENSMUST00000125134 646 ntTSL 3 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Srsf6Q3TWW8 Naa60-207ENSMUST00000150655 1166 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Srsf6Q3TWW8 Mcpt8-201ENSMUST00000015594 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Srsf6Q3TWW8 Tmem116-209ENSMUST00000156080 1184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Srsf6Q3TWW8 Mir1943-201ENSMUST00000158276 73 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Srsf6Q3TWW8 Gng2-205ENSMUST00000161247 419 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Srsf6Q3TWW8 Rhoc-204ENSMUST00000176347 583 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Srsf6Q3TWW8 Gm25700-201ENSMUST00000177693 110 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Srsf6Q3TWW8 Gm26973-201ENSMUST00000182105 696 ntTSL 3 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Srsf6Q3TWW8 Ccser2-208ENSMUST00000183007 1293 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Srsf6Q3TWW8 Gm43584-201ENSMUST00000199762 605 ntTSL 3 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Srsf6Q3TWW8 Gm8099-201ENSMUST00000200510 742 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Srsf6Q3TWW8 AU022133-201ENSMUST00000200601 873 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Srsf6Q3TWW8 Mill2-201ENSMUST00000072386 1121 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Srsf6Q3TWW8 Gm10308-201ENSMUST00000095183 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Srsf6Q3TWW8 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Srsf6Q3TWW8 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Srsf6Q3TWW8 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Srsf6Q3TWW8 Pced1b-201ENSMUST00000059433 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Srsf6Q3TWW8 Txn2-203ENSMUST00000109747 1778 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Srsf6Q3TWW8 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Srsf6Q3TWW8 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Srsf6Q3TWW8 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Srsf6Q3TWW8 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Srsf6Q3TWW8 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Srsf6Q3TWW8 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Srsf6Q3TWW8 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Srsf6Q3TWW8 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Srsf6Q3TWW8 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Srsf6Q3TWW8 Ndufaf7-201ENSMUST00000024887 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Srsf6Q3TWW8 Prss43-201ENSMUST00000077549 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Srsf6Q3TWW8 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Srsf6Q3TWW8 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Srsf6Q3TWW8 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Srsf6Q3TWW8 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Srsf6Q3TWW8 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Srsf6Q3TWW8 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Srsf6Q3TWW8 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Srsf6Q3TWW8 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Srsf6Q3TWW8 Fgf18-202ENSMUST00000109363 991 ntTSL 3 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Srsf6Q3TWW8 n-R5s14-201ENSMUST00000122688 107 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Srsf6Q3TWW8 Gm454-201ENSMUST00000160126 751 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Srsf6Q3TWW8 2810405F17Rik-201ENSMUST00000189334 1117 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Srsf6Q3TWW8 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Srsf6Q3TWW8 Phgdh-ps1-201ENSMUST00000207540 754 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Srsf6Q3TWW8 Nppc-201ENSMUST00000027449 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Srsf6Q3TWW8 Tspan8-201ENSMUST00000035563 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Srsf6Q3TWW8 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Srsf6Q3TWW8 Asphd1-201ENSMUST00000052937 730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Srsf6Q3TWW8 Olfr1423-201ENSMUST00000087831 933 ntAPPRIS P1 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Srsf6Q3TWW8 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Srsf6Q3TWW8 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Srsf6Q3TWW8 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Srsf6Q3TWW8 Cstf3-201ENSMUST00000028599 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Srsf6Q3TWW8 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Srsf6Q3TWW8 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Srsf6Q3TWW8 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Srsf6Q3TWW8 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Srsf6Q3TWW8 Tmub1-203ENSMUST00000115036 1455 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Srsf6Q3TWW8 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Srsf6Q3TWW8 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Srsf6Q3TWW8 Chodl-203ENSMUST00000114216 1550 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Srsf6Q3TWW8 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Srsf6Q3TWW8 Gm8994-202ENSMUST00000204530 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Srsf6Q3TWW8 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Srsf6Q3TWW8 Tmem17-201ENSMUST00000059319 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Srsf6Q3TWW8 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Srsf6Q3TWW8 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Srsf6Q3TWW8 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Srsf6Q3TWW8 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
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