Protein–RNA interactions for Protein: Q3TTP0

Shcbp1l, Testicular spindle-associated protein SHCBP1L, mousemouse

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Length 639 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shcbp1lQ3TTP0 Rapsn-202ENSMUST00000111445 1450 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Shcbp1lQ3TTP0 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Shcbp1lQ3TTP0 Cacna1g-202ENSMUST00000100561 8125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Shcbp1lQ3TTP0 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Shcbp1lQ3TTP0 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Shcbp1lQ3TTP0 Parp10-202ENSMUST00000165738 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Shcbp1lQ3TTP0 Klk6-203ENSMUST00000107968 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Shcbp1lQ3TTP0 Il7-205ENSMUST00000194279 4858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Shcbp1lQ3TTP0 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Shcbp1lQ3TTP0 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Shcbp1lQ3TTP0 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Shcbp1lQ3TTP0 Pdpk1-204ENSMUST00000115409 4623 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Shcbp1lQ3TTP0 Ildr2-201ENSMUST00000111416 8251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Shcbp1lQ3TTP0 Tomm5-204ENSMUST00000107810 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Shcbp1lQ3TTP0 Ecscr-204ENSMUST00000133064 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Shcbp1lQ3TTP0 Gm8835-201ENSMUST00000173096 1169 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Shcbp1lQ3TTP0 Gm20652-201ENSMUST00000177314 383 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Shcbp1lQ3TTP0 Degs2-201ENSMUST00000021691 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Shcbp1lQ3TTP0 AC159474.1-201ENSMUST00000218454 374 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Shcbp1lQ3TTP0 Rsph9-201ENSMUST00000024762 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Shcbp1lQ3TTP0 1700123K08Rik-201ENSMUST00000031501 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Shcbp1lQ3TTP0 Fam173b-201ENSMUST00000042702 1164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Shcbp1lQ3TTP0 Fau-201ENSMUST00000043074 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Shcbp1lQ3TTP0 Rps5-201ENSMUST00000004554 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Shcbp1lQ3TTP0 Rnase2b-201ENSMUST00000075648 759 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Shcbp1lQ3TTP0 Ecscr-201ENSMUST00000097618 1114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Shcbp1lQ3TTP0 Gm10570-201ENSMUST00000097865 513 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Shcbp1lQ3TTP0 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Shcbp1lQ3TTP0 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Shcbp1lQ3TTP0 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Shcbp1lQ3TTP0 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Shcbp1lQ3TTP0 Ppp3cb-205ENSMUST00000161445 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Shcbp1lQ3TTP0 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Shcbp1lQ3TTP0 Rnaseh2a-210ENSMUST00000147812 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Shcbp1lQ3TTP0 Dlk2-201ENSMUST00000061722 1532 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Shcbp1lQ3TTP0 Smim13-201ENSMUST00000165561 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Shcbp1lQ3TTP0 Map2k7-206ENSMUST00000110998 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Shcbp1lQ3TTP0 Sirt3-201ENSMUST00000026559 1461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Shcbp1lQ3TTP0 Hspa12b-201ENSMUST00000099349 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Shcbp1lQ3TTP0 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Shcbp1lQ3TTP0 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Shcbp1lQ3TTP0 Txn2-203ENSMUST00000109747 1778 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Shcbp1lQ3TTP0 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Shcbp1lQ3TTP0 Pcdha11-203ENSMUST00000192447 4583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Shcbp1lQ3TTP0 Gm38094-201ENSMUST00000195864 2978 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Shcbp1lQ3TTP0 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Shcbp1lQ3TTP0 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Shcbp1lQ3TTP0 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Shcbp1lQ3TTP0 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Shcbp1lQ3TTP0 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Shcbp1lQ3TTP0 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Shcbp1lQ3TTP0 Txlng-203ENSMUST00000112315 2525 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Shcbp1lQ3TTP0 Hk1-202ENSMUST00000099691 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Shcbp1lQ3TTP0 Gm13050-201ENSMUST00000122149 1345 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Shcbp1lQ3TTP0 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Shcbp1lQ3TTP0 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Shcbp1lQ3TTP0 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Shcbp1lQ3TTP0 Sbk1-201ENSMUST00000056028 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Shcbp1lQ3TTP0 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Shcbp1lQ3TTP0 Lsm2-202ENSMUST00000114011 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Shcbp1lQ3TTP0 Ice2-203ENSMUST00000117610 800 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Shcbp1lQ3TTP0 Gm5687-201ENSMUST00000118252 640 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Shcbp1lQ3TTP0 Rpl18a-ps1-201ENSMUST00000161190 523 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Shcbp1lQ3TTP0 Glo1-202ENSMUST00000167624 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Shcbp1lQ3TTP0 C330013E15Rik-201ENSMUST00000181034 878 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Shcbp1lQ3TTP0 Mir7085-201ENSMUST00000184353 66 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
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Shcbp1lQ3TTP0 Cryaa-201ENSMUST00000019192 1176 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Shcbp1lQ3TTP0 Gm31728-201ENSMUST00000192164 435 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
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Shcbp1lQ3TTP0 Dmac1-201ENSMUST00000030103 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Shcbp1lQ3TTP0 Tex26-201ENSMUST00000031667 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Shcbp1lQ3TTP0 Rpsa-ps10-201ENSMUST00000057740 885 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Shcbp1lQ3TTP0 Rn7sk-201ENSMUST00000083103 331 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Shcbp1lQ3TTP0 Gm26315-201ENSMUST00000083890 321 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Shcbp1lQ3TTP0 Itgb4-203ENSMUST00000106458 5779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Shcbp1lQ3TTP0 Cacna2d1-202ENSMUST00000078272 7311 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Shcbp1lQ3TTP0 Gm43796-201ENSMUST00000202853 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Shcbp1lQ3TTP0 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Shcbp1lQ3TTP0 Spag1-201ENSMUST00000047348 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Shcbp1lQ3TTP0 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Shcbp1lQ3TTP0 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Shcbp1lQ3TTP0 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Shcbp1lQ3TTP0 Gm26747-201ENSMUST00000180597 1716 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Shcbp1lQ3TTP0 Twf1-201ENSMUST00000023087 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Shcbp1lQ3TTP0 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Shcbp1lQ3TTP0 Ifi47-204ENSMUST00000213728 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Shcbp1lQ3TTP0 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Shcbp1lQ3TTP0 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Shcbp1lQ3TTP0 Aire-216ENSMUST00000156417 1627 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Shcbp1lQ3TTP0 Gm9755-201ENSMUST00000032981 1356 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Shcbp1lQ3TTP0 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Shcbp1lQ3TTP0 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Shcbp1lQ3TTP0 4933417O13Rik-202ENSMUST00000208893 1571 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Shcbp1lQ3TTP0 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Shcbp1lQ3TTP0 Sox17-206ENSMUST00000192650 3242 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Shcbp1lQ3TTP0 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Shcbp1lQ3TTP0 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
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