Protein–RNA interactions for Protein: Q3TGF2

Fam107b, Protein FAM107B, mousemouse

Predictions only

Length 131 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam107bQ3TGF2 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Fam107bQ3TGF2 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Fam107bQ3TGF2 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Fam107bQ3TGF2 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Fam107bQ3TGF2 Gm3809-201ENSMUST00000180973 1006 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Fam107bQ3TGF2 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Fam107bQ3TGF2 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Fam107bQ3TGF2 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Fam107bQ3TGF2 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Fam107bQ3TGF2 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Fam107bQ3TGF2 Dach2-201ENSMUST00000067219 2520 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Fam107bQ3TGF2 Nfe2l1-211ENSMUST00000167149 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Fam107bQ3TGF2 Gm43075-201ENSMUST00000198613 3905 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Fam107bQ3TGF2 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Fam107bQ3TGF2 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Fam107bQ3TGF2 Itfg2-201ENSMUST00000001559 2320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Fam107bQ3TGF2 Apbb2-215ENSMUST00000162349 3362 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Fam107bQ3TGF2 Apbb2-201ENSMUST00000087256 3362 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Fam107bQ3TGF2 Git1-201ENSMUST00000037285 3512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Fam107bQ3TGF2 Rnf14-201ENSMUST00000072376 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Fam107bQ3TGF2 Cd276-202ENSMUST00000165365 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Fam107bQ3TGF2 Mkl1-209ENSMUST00000149582 4366 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Fam107bQ3TGF2 Satb2-205ENSMUST00000177424 4694 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Fam107bQ3TGF2 Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 6941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Fam107bQ3TGF2 Prr18-202ENSMUST00000163887 3251 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Fam107bQ3TGF2 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Fam107bQ3TGF2 Pbld2-201ENSMUST00000020262 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Fam107bQ3TGF2 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Fam107bQ3TGF2 Ints6-202ENSMUST00000223585 10883 ntAPPRIS P1 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Fam107bQ3TGF2 Dmbt1-201ENSMUST00000084509 6243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Fam107bQ3TGF2 AC151895.1-201ENSMUST00000219025 1742 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Fam107bQ3TGF2 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Fam107bQ3TGF2 Mrps26-202ENSMUST00000145614 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Fam107bQ3TGF2 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Fam107bQ3TGF2 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Fam107bQ3TGF2 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Fam107bQ3TGF2 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Fam107bQ3TGF2 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Fam107bQ3TGF2 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Fam107bQ3TGF2 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Fam107bQ3TGF2 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Fam107bQ3TGF2 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Fam107bQ3TGF2 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Fam107bQ3TGF2 Ppp1r18-203ENSMUST00000127442 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Fam107bQ3TGF2 Gm43051-201ENSMUST00000201096 2678 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Fam107bQ3TGF2 Edc4-202ENSMUST00000119261 4645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Fam107bQ3TGF2 Tbc1d1-204ENSMUST00000121370 5419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Fam107bQ3TGF2 Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Fam107bQ3TGF2 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Fam107bQ3TGF2 Gpld1-201ENSMUST00000021773 5224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Fam107bQ3TGF2 AC166574.4-201ENSMUST00000227165 1937 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Fam107bQ3TGF2 Dlc1-201ENSMUST00000033923 6159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Fam107bQ3TGF2 Npepps-215ENSMUST00000167806 2307 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Fam107bQ3TGF2 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Fam107bQ3TGF2 Epm2aip1-202ENSMUST00000135807 4245 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Fam107bQ3TGF2 Acvrl1-205ENSMUST00000120754 3506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Fam107bQ3TGF2 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Fam107bQ3TGF2 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Fam107bQ3TGF2 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Fam107bQ3TGF2 Pif1-202ENSMUST00000131483 3309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Fam107bQ3TGF2 Sp7-201ENSMUST00000078508 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Fam107bQ3TGF2 Hspa2-202ENSMUST00000219555 2526 ntAPPRIS P1 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Fam107bQ3TGF2 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Fam107bQ3TGF2 Orc2-201ENSMUST00000027198 3561 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Fam107bQ3TGF2 Ebf2-202ENSMUST00000176029 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Fam107bQ3TGF2 Mgme1-202ENSMUST00000110027 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Fam107bQ3TGF2 Add2-202ENSMUST00000203196 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Fam107bQ3TGF2 Specc1-213ENSMUST00000202179 6676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Fam107bQ3TGF2 Cacnb2-203ENSMUST00000114723 3945 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Fam107bQ3TGF2 2410131K14Rik-201ENSMUST00000049138 5649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Fam107bQ3TGF2 Map4k1-203ENSMUST00000208227 2720 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Fam107bQ3TGF2 Map4k1-201ENSMUST00000085835 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Fam107bQ3TGF2 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Fam107bQ3TGF2 Dgcr2-203ENSMUST00000117082 2987 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Fam107bQ3TGF2 Gm44851-201ENSMUST00000205735 2309 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Fam107bQ3TGF2 Mark4-201ENSMUST00000085715 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Fam107bQ3TGF2 Gm42890-202ENSMUST00000167642 2566 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Fam107bQ3TGF2 Trim55-201ENSMUST00000029139 2595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Fam107bQ3TGF2 Uap1l1-201ENSMUST00000102925 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Fam107bQ3TGF2 Lgr5-201ENSMUST00000020350 4714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Fam107bQ3TGF2 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Fam107bQ3TGF2 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Fam107bQ3TGF2 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Fam107bQ3TGF2 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Fam107bQ3TGF2 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Fam107bQ3TGF2 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Fam107bQ3TGF2 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Fam107bQ3TGF2 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Fam107bQ3TGF2 Gm29741-201ENSMUST00000192667 421 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Fam107bQ3TGF2 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Fam107bQ3TGF2 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Fam107bQ3TGF2 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Fam107bQ3TGF2 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Fam107bQ3TGF2 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Fam107bQ3TGF2 C230014O12Rik-201ENSMUST00000134921 2668 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Fam107bQ3TGF2 Zc3h12d-201ENSMUST00000039484 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Fam107bQ3TGF2 Mroh1-204ENSMUST00000159218 5085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Fam107bQ3TGF2 Sorcs1-203ENSMUST00000164039 7241 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Fam107bQ3TGF2 Fn1-216ENSMUST00000189821 7410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Fam107bQ3TGF2 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.6 ms