Protein–RNA interactions for Protein: Q1PSW8

Trim71, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM71, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 855 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim71Q1PSW8 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Trim71Q1PSW8 Fam241b-202ENSMUST00000064050 1096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Trim71Q1PSW8 Abcg4-208ENSMUST00000161354 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Trim71Q1PSW8 Emd-202ENSMUST00000088313 1338 ntTSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Trim71Q1PSW8 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Trim71Q1PSW8 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Trim71Q1PSW8 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Trim71Q1PSW8 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Trim71Q1PSW8 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
Trim71Q1PSW8 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Trim71Q1PSW8 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Trim71Q1PSW8 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Trim71Q1PSW8 D230025D16Rik-201ENSMUST00000034361 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Trim71Q1PSW8 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Trim71Q1PSW8 Dennd6b-201ENSMUST00000078953 4607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Trim71Q1PSW8 Tecpr1-201ENSMUST00000085701 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Trim71Q1PSW8 Grin1-203ENSMUST00000114308 4165 ntTSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.16
Trim71Q1PSW8 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.16
Trim71Q1PSW8 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Trim71Q1PSW8 Hspb7-201ENSMUST00000102486 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Trim71Q1PSW8 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Trim71Q1PSW8 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Trim71Q1PSW8 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Trim71Q1PSW8 Spon1-201ENSMUST00000046687 6161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Trim71Q1PSW8 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Trim71Q1PSW8 Cxadr-202ENSMUST00000114229 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Trim71Q1PSW8 Caskin2-201ENSMUST00000041684 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Trim71Q1PSW8 Gm26878-201ENSMUST00000181778 1644 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Trim71Q1PSW8 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Trim71Q1PSW8 Tifa-203ENSMUST00000164447 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Trim71Q1PSW8 Acy1-201ENSMUST00000024031 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Trim71Q1PSW8 Gm16534-201ENSMUST00000149300 1492 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Trim71Q1PSW8 1700049J03Rik-201ENSMUST00000011196 421 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Trim71Q1PSW8 3110009E18Rik-203ENSMUST00000112644 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Trim71Q1PSW8 Rpl9-203ENSMUST00000120094 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Trim71Q1PSW8 Ptgr2-205ENSMUST00000135001 1286 ntTSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Trim71Q1PSW8 Myl3-203ENSMUST00000136695 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Trim71Q1PSW8 Txnl4b-202ENSMUST00000178445 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Trim71Q1PSW8 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Trim71Q1PSW8 Gm42693-201ENSMUST00000196779 631 ntBASIC14.02□□□□□ -0.17
Trim71Q1PSW8 Gm9728-201ENSMUST00000200197 1055 ntBASIC14.02□□□□□ -0.17
Trim71Q1PSW8 Gm18473-201ENSMUST00000220543 868 ntBASIC14.02□□□□□ -0.17
Trim71Q1PSW8 Tex26-201ENSMUST00000031667 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Trim71Q1PSW8 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Trim71Q1PSW8 Cacna1b-205ENSMUST00000114447 6987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Trim71Q1PSW8 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Trim71Q1PSW8 Tmem200a-201ENSMUST00000066049 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Trim71Q1PSW8 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Trim71Q1PSW8 Plekhg2-202ENSMUST00000119990 4880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Trim71Q1PSW8 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Trim71Q1PSW8 Igf2r-201ENSMUST00000024599 8887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Trim71Q1PSW8 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Trim71Q1PSW8 Zc3h4-202ENSMUST00000209289 5853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Trim71Q1PSW8 Proser1-201ENSMUST00000058577 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Trim71Q1PSW8 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Trim71Q1PSW8 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Trim71Q1PSW8 Ntrk2-208ENSMUST00000225583 2719 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
Trim71Q1PSW8 C530008M17Rik-202ENSMUST00000120639 6826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Trim71Q1PSW8 C530008M17Rik-211ENSMUST00000163347 6835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Trim71Q1PSW8 Pdpk1-204ENSMUST00000115409 4623 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Trim71Q1PSW8 Sertad2-203ENSMUST00000109586 5515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Trim71Q1PSW8 Dhtkd1-202ENSMUST00000095147 5480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Trim71Q1PSW8 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Trim71Q1PSW8 Psd2-206ENSMUST00000177432 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Trim71Q1PSW8 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Trim71Q1PSW8 Eif5b-201ENSMUST00000027252 7797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Trim71Q1PSW8 Gm23931-201ENSMUST00000103842 109 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
Trim71Q1PSW8 Gm11803-201ENSMUST00000119966 444 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
Trim71Q1PSW8 Gm13834-201ENSMUST00000123757 137 ntTSL 3 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Trim71Q1PSW8 Tldc2-202ENSMUST00000166140 639 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Trim71Q1PSW8 Chd3os-203ENSMUST00000218008 1026 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Trim71Q1PSW8 Gstt2-203ENSMUST00000218500 794 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Trim71Q1PSW8 Mrps22-201ENSMUST00000035034 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Trim71Q1PSW8 Atpif1-201ENSMUST00000067496 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Trim71Q1PSW8 Gm10478-201ENSMUST00000084451 396 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
Trim71Q1PSW8 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Trim71Q1PSW8 B230118H07Rik-202ENSMUST00000099682 895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Trim71Q1PSW8 Cops7b-202ENSMUST00000121534 5383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Trim71Q1PSW8 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Trim71Q1PSW8 Lgals8-202ENSMUST00000099821 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Trim71Q1PSW8 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Trim71Q1PSW8 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Trim71Q1PSW8 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Trim71Q1PSW8 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Trim71Q1PSW8 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Trim71Q1PSW8 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Trim71Q1PSW8 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Trim71Q1PSW8 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Trim71Q1PSW8 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Trim71Q1PSW8 Il7-205ENSMUST00000194279 4858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Trim71Q1PSW8 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Trim71Q1PSW8 Igsf5-202ENSMUST00000081093 1554 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Trim71Q1PSW8 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Trim71Q1PSW8 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Trim71Q1PSW8 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Trim71Q1PSW8 Dlgap1-202ENSMUST00000097288 2626 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Trim71Q1PSW8 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Trim71Q1PSW8 Cep164-201ENSMUST00000117194 5541 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Trim71Q1PSW8 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Trim71Q1PSW8 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms