Protein–RNA interactions for Protein: Q14B62

ptchd1, Patched domain-containing protein 1, mousemouse

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Length 888 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ptchd1Q14B62 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
ptchd1Q14B62 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
ptchd1Q14B62 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
ptchd1Q14B62 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
ptchd1Q14B62 Irs1-201ENSMUST00000069799 9144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
ptchd1Q14B62 Iffo2-201ENSMUST00000040023 5227 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
ptchd1Q14B62 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
ptchd1Q14B62 Apbb2-203ENSMUST00000159512 6632 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
ptchd1Q14B62 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
ptchd1Q14B62 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
ptchd1Q14B62 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
ptchd1Q14B62 Scarb2-201ENSMUST00000031377 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
ptchd1Q14B62 Med4-201ENSMUST00000022705 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
ptchd1Q14B62 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
ptchd1Q14B62 Draxin-201ENSMUST00000030862 5200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
ptchd1Q14B62 Gm11725-201ENSMUST00000125607 1850 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
ptchd1Q14B62 Xlr-202ENSMUST00000067782 1860 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
ptchd1Q14B62 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
ptchd1Q14B62 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
ptchd1Q14B62 Proser1-201ENSMUST00000058577 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
ptchd1Q14B62 Kcnt1-204ENSMUST00000114176 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
ptchd1Q14B62 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
ptchd1Q14B62 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
ptchd1Q14B62 Glipr2-202ENSMUST00000107855 1816 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
ptchd1Q14B62 Tnks1bp1-201ENSMUST00000048400 4799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
ptchd1Q14B62 Tmem51os1-204ENSMUST00000153023 3440 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
ptchd1Q14B62 Wisp1-202ENSMUST00000118823 708 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
ptchd1Q14B62 Gm11803-201ENSMUST00000119966 444 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
ptchd1Q14B62 Gm11400-201ENSMUST00000120853 1214 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
ptchd1Q14B62 Atpif1-203ENSMUST00000152993 462 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
ptchd1Q14B62 Gm22331-201ENSMUST00000158066 136 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
ptchd1Q14B62 Gm8810-201ENSMUST00000172895 754 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
ptchd1Q14B62 Smad7-204ENSMUST00000174411 769 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
ptchd1Q14B62 Gm3764-203ENSMUST00000180635 1191 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
ptchd1Q14B62 Gabarapl1-204ENSMUST00000204956 539 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.91□□□□□ -0.34
ptchd1Q14B62 Gstt2-203ENSMUST00000218500 794 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
ptchd1Q14B62 Gm36756-203ENSMUST00000223029 1166 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
ptchd1Q14B62 Bst2-201ENSMUST00000051672 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
ptchd1Q14B62 Gps2-201ENSMUST00000057884 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
ptchd1Q14B62 Gm13199-201ENSMUST00000071016 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
ptchd1Q14B62 Gas8-201ENSMUST00000093043 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
ptchd1Q14B62 Rcsd1-202ENSMUST00000097474 5001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
ptchd1Q14B62 Ak4-201ENSMUST00000102780 4186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
ptchd1Q14B62 Prrc2b-201ENSMUST00000036691 8612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
ptchd1Q14B62 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
ptchd1Q14B62 Ltbp2-203ENSMUST00000163189 6470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
ptchd1Q14B62 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
ptchd1Q14B62 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
ptchd1Q14B62 Vwa8-201ENSMUST00000040990 7054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
ptchd1Q14B62 Asap1-218ENSMUST00000177374 4582 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
ptchd1Q14B62 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
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ptchd1Q14B62 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
ptchd1Q14B62 Pef1-201ENSMUST00000030563 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
ptchd1Q14B62 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
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ptchd1Q14B62 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
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ptchd1Q14B62 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
ptchd1Q14B62 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
ptchd1Q14B62 Sbk1-201ENSMUST00000056028 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
ptchd1Q14B62 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
ptchd1Q14B62 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
ptchd1Q14B62 Nfatc2-202ENSMUST00000074618 6637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
ptchd1Q14B62 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
ptchd1Q14B62 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
ptchd1Q14B62 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC12.9□□□□□ -0.34
ptchd1Q14B62 Chst3-201ENSMUST00000068690 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
ptchd1Q14B62 Prg4-207ENSMUST00000162367 1480 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
ptchd1Q14B62 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
ptchd1Q14B62 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
ptchd1Q14B62 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
ptchd1Q14B62 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
ptchd1Q14B62 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
ptchd1Q14B62 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
ptchd1Q14B62 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
ptchd1Q14B62 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
ptchd1Q14B62 Ppp6r1-201ENSMUST00000064099 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
ptchd1Q14B62 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
ptchd1Q14B62 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
ptchd1Q14B62 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
ptchd1Q14B62 Gm7899-201ENSMUST00000192935 1897 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
ptchd1Q14B62 Myo18a-221ENSMUST00000167856 6132 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
ptchd1Q14B62 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
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