Protein–RNA interactions for Protein: Q14AI6

Rpusd3, Mitochondrial mRNA pseudouridine synthase Rpusd3, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd3Q14AI6 Sema7a-201ENSMUST00000043059 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rpusd3Q14AI6 Smug1-201ENSMUST00000064067 3281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rpusd3Q14AI6 Shank2-203ENSMUST00000105902 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rpusd3Q14AI6 Msh6-201ENSMUST00000005503 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rpusd3Q14AI6 Yeats2-201ENSMUST00000090052 5997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rpusd3Q14AI6 Rnf224-201ENSMUST00000091318 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rpusd3Q14AI6 Usp19-204ENSMUST00000178075 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rpusd3Q14AI6 Usp19-202ENSMUST00000085044 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rpusd3Q14AI6 Sin3a-208ENSMUST00000168678 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rpusd3Q14AI6 Hipk3-201ENSMUST00000028600 7454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rpusd3Q14AI6 Oxr1-204ENSMUST00000110297 4596 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rpusd3Q14AI6 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rpusd3Q14AI6 Lrfn3-201ENSMUST00000046351 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rpusd3Q14AI6 Tgm1-201ENSMUST00000002389 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rpusd3Q14AI6 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rpusd3Q14AI6 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rpusd3Q14AI6 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rpusd3Q14AI6 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rpusd3Q14AI6 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rpusd3Q14AI6 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rpusd3Q14AI6 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rpusd3Q14AI6 Gm2445-201ENSMUST00000182798 989 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Rpusd3Q14AI6 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Rpusd3Q14AI6 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rpusd3Q14AI6 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rpusd3Q14AI6 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rpusd3Q14AI6 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rpusd3Q14AI6 Tsku-202ENSMUST00000164726 2620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rpusd3Q14AI6 Sugp2-201ENSMUST00000093458 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rpusd3Q14AI6 Canx-201ENSMUST00000020637 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rpusd3Q14AI6 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rpusd3Q14AI6 Efhc1-201ENSMUST00000038447 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rpusd3Q14AI6 Mynn-202ENSMUST00000192715 5555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rpusd3Q14AI6 Mafk-202ENSMUST00000110836 3097 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rpusd3Q14AI6 Sgsm3-208ENSMUST00000139517 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rpusd3Q14AI6 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rpusd3Q14AI6 Igf2r-201ENSMUST00000024599 8887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rpusd3Q14AI6 Elk1-201ENSMUST00000009550 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rpusd3Q14AI6 Hp1bp3-201ENSMUST00000030541 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rpusd3Q14AI6 Slc6a8-201ENSMUST00000033752 3964 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rpusd3Q14AI6 Pcdh1-202ENSMUST00000159405 3880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rpusd3Q14AI6 Bud13-201ENSMUST00000074957 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rpusd3Q14AI6 Zbtb44-205ENSMUST00000216649 3157 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rpusd3Q14AI6 Nr3c1-203ENSMUST00000115567 6436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rpusd3Q14AI6 Pdxk-ps-201ENSMUST00000159650 2342 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rpusd3Q14AI6 Ttyh1-202ENSMUST00000079415 2882 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rpusd3Q14AI6 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rpusd3Q14AI6 Omp-201ENSMUST00000098281 2144 ntAPPRIS P1 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rpusd3Q14AI6 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rpusd3Q14AI6 Mest-211ENSMUST00000163949 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rpusd3Q14AI6 Ddx19b-202ENSMUST00000065784 3104 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rpusd3Q14AI6 Pou2f2-203ENSMUST00000108415 7095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rpusd3Q14AI6 Gm42706-201ENSMUST00000199733 1910 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Rpusd3Q14AI6 Syt2-204ENSMUST00000188842 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rpusd3Q14AI6 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rpusd3Q14AI6 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rpusd3Q14AI6 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rpusd3Q14AI6 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Rpusd3Q14AI6 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Rpusd3Q14AI6 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rpusd3Q14AI6 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rpusd3Q14AI6 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
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Rpusd3Q14AI6 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rpusd3Q14AI6 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rpusd3Q14AI6 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rpusd3Q14AI6 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rpusd3Q14AI6 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rpusd3Q14AI6 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rpusd3Q14AI6 Ubap2l-202ENSMUST00000064639 4073 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rpusd3Q14AI6 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rpusd3Q14AI6 Gm5939-201ENSMUST00000119613 2874 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Rpusd3Q14AI6 Podn-201ENSMUST00000044248 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rpusd3Q14AI6 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rpusd3Q14AI6 Bcl7a-201ENSMUST00000031391 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rpusd3Q14AI6 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rpusd3Q14AI6 Rfc2-201ENSMUST00000023867 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rpusd3Q14AI6 Rtn4-203ENSMUST00000102841 4060 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rpusd3Q14AI6 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rpusd3Q14AI6 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rpusd3Q14AI6 Stau1-201ENSMUST00000049412 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rpusd3Q14AI6 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rpusd3Q14AI6 Setdb1-203ENSMUST00000107171 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rpusd3Q14AI6 Snx14-207ENSMUST00000174806 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.55
Rpusd3Q14AI6 Myh7-204ENSMUST00000168485 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
Rpusd3Q14AI6 Prnd-203ENSMUST00000110171 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
Rpusd3Q14AI6 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
Rpusd3Q14AI6 Col14a1-203ENSMUST00000110221 5679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Rpusd3Q14AI6 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Rpusd3Q14AI6 Fuca2-203ENSMUST00000121465 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Rpusd3Q14AI6 Abat-203ENSMUST00000115839 2414 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Rpusd3Q14AI6 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Rpusd3Q14AI6 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Rpusd3Q14AI6 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Rpusd3Q14AI6 F2-202ENSMUST00000111335 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Rpusd3Q14AI6 Atp6v1b1-201ENSMUST00000006431 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Rpusd3Q14AI6 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Rpusd3Q14AI6 Ripor3-201ENSMUST00000099073 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Rpusd3Q14AI6 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Rpusd3Q14AI6 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.4 ms