Protein–RNA interactions for Protein: Q0VGU4

Vgf, MCG18019, mousemouse

Predictions only

Length 617 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VgfQ0VGU4 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
VgfQ0VGU4 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
VgfQ0VGU4 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
VgfQ0VGU4 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
VgfQ0VGU4 Gm4984-201ENSMUST00000115987 360 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
VgfQ0VGU4 9330198N18Rik-201ENSMUST00000146702 1247 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
VgfQ0VGU4 Commd6-203ENSMUST00000168587 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
VgfQ0VGU4 Mrpl30-205ENSMUST00000193673 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
VgfQ0VGU4 Ube2a-205ENSMUST00000201068 1298 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
VgfQ0VGU4 Gm42906-201ENSMUST00000202365 408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
VgfQ0VGU4 Gm44799-201ENSMUST00000207639 1202 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
VgfQ0VGU4 Gm33460-201ENSMUST00000212286 536 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
VgfQ0VGU4 AC073947.2-201ENSMUST00000215888 1130 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
VgfQ0VGU4 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
VgfQ0VGU4 Atp5d-201ENSMUST00000003156 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
VgfQ0VGU4 Gm5129-201ENSMUST00000065372 300 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
VgfQ0VGU4 Spock3-202ENSMUST00000117377 3066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
VgfQ0VGU4 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
VgfQ0VGU4 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
VgfQ0VGU4 Tbx6-202ENSMUST00000172352 1529 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
VgfQ0VGU4 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
VgfQ0VGU4 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
VgfQ0VGU4 Ikzf4-201ENSMUST00000133342 5150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
VgfQ0VGU4 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
VgfQ0VGU4 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
VgfQ0VGU4 Apbb2-203ENSMUST00000159512 6632 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
VgfQ0VGU4 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
VgfQ0VGU4 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
VgfQ0VGU4 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
VgfQ0VGU4 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
VgfQ0VGU4 Sox11-201ENSMUST00000079063 8311 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
VgfQ0VGU4 Gnaz-202ENSMUST00000159991 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
VgfQ0VGU4 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
VgfQ0VGU4 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
VgfQ0VGU4 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
VgfQ0VGU4 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
VgfQ0VGU4 Gm11425-201ENSMUST00000119608 498 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
VgfQ0VGU4 Rpl12-203ENSMUST00000126610 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
VgfQ0VGU4 Gm11684-201ENSMUST00000144975 757 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
VgfQ0VGU4 Ndufaf2-201ENSMUST00000163558 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
VgfQ0VGU4 Abhd14a-202ENSMUST00000171678 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
VgfQ0VGU4 Gm43240-201ENSMUST00000198543 630 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
VgfQ0VGU4 Rpl18-208ENSMUST00000211061 552 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
VgfQ0VGU4 Nme2-201ENSMUST00000021217 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
VgfQ0VGU4 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
VgfQ0VGU4 Csrp3-201ENSMUST00000032658 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
VgfQ0VGU4 Gm9396-201ENSMUST00000076703 567 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
VgfQ0VGU4 Camkmt-201ENSMUST00000095188 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
VgfQ0VGU4 Bach2-201ENSMUST00000037416 3462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
VgfQ0VGU4 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
VgfQ0VGU4 Llgl2-212ENSMUST00000177736 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
VgfQ0VGU4 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
VgfQ0VGU4 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
VgfQ0VGU4 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
VgfQ0VGU4 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
VgfQ0VGU4 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
VgfQ0VGU4 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
VgfQ0VGU4 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
VgfQ0VGU4 Sirt3-201ENSMUST00000026559 1461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
VgfQ0VGU4 Gpr19-208ENSMUST00000165392 1643 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
VgfQ0VGU4 Gpr19-202ENSMUST00000066107 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
VgfQ0VGU4 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
VgfQ0VGU4 Mapk8ip3-206ENSMUST00000120035 4125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
VgfQ0VGU4 Gm43650-201ENSMUST00000197337 1382 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
VgfQ0VGU4 Gm30214-201ENSMUST00000199271 1383 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
VgfQ0VGU4 Nat3-201ENSMUST00000070514 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
VgfQ0VGU4 Hnrnph1-203ENSMUST00000109142 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
VgfQ0VGU4 Alox12b-201ENSMUST00000036424 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
VgfQ0VGU4 Secisbp2l-201ENSMUST00000053699 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
VgfQ0VGU4 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
VgfQ0VGU4 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
VgfQ0VGU4 Araf-203ENSMUST00000122312 2854 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
VgfQ0VGU4 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
VgfQ0VGU4 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
VgfQ0VGU4 Dlk1-202ENSMUST00000109841 879 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
VgfQ0VGU4 Mup-ps23-201ENSMUST00000118063 630 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
VgfQ0VGU4 Atpif1-203ENSMUST00000152993 462 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
VgfQ0VGU4 Ighv2-3-201ENSMUST00000178229 347 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
VgfQ0VGU4 Gm8652-201ENSMUST00000181363 964 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
VgfQ0VGU4 Gm29152-201ENSMUST00000189284 325 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
VgfQ0VGU4 1700094J05Rik-202ENSMUST00000190491 997 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
VgfQ0VGU4 Ube2f-210ENSMUST00000191368 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
VgfQ0VGU4 Lce3a-201ENSMUST00000067318 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
VgfQ0VGU4 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
VgfQ0VGU4 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
VgfQ0VGU4 Fam219a-202ENSMUST00000108050 3321 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
VgfQ0VGU4 G6pc3-201ENSMUST00000070334 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
VgfQ0VGU4 Gucy2e-202ENSMUST00000108664 4415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
VgfQ0VGU4 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
VgfQ0VGU4 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
VgfQ0VGU4 4933417O13Rik-202ENSMUST00000208893 1571 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
VgfQ0VGU4 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
VgfQ0VGU4 Lgals8-203ENSMUST00000124888 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
VgfQ0VGU4 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
VgfQ0VGU4 Xlr-202ENSMUST00000067782 1860 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
VgfQ0VGU4 Metap1d-201ENSMUST00000037210 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
VgfQ0VGU4 Mypopos-202ENSMUST00000205975 2321 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
VgfQ0VGU4 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
VgfQ0VGU4 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
VgfQ0VGU4 Elmo3-202ENSMUST00000212033 2351 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.7 ms