Protein–RNA interactions for Protein: Q0VBP7

Shisal1, Protein shisa-like-1, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shisal1Q0VBP7 Me3-202ENSMUST00000032856 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Shisal1Q0VBP7 Ppp3r1-201ENSMUST00000102880 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Shisal1Q0VBP7 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Shisal1Q0VBP7 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Shisal1Q0VBP7 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Shisal1Q0VBP7 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Shisal1Q0VBP7 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Shisal1Q0VBP7 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Shisal1Q0VBP7 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Shisal1Q0VBP7 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Shisal1Q0VBP7 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Shisal1Q0VBP7 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Shisal1Q0VBP7 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Shisal1Q0VBP7 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Shisal1Q0VBP7 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Shisal1Q0VBP7 Ints6-202ENSMUST00000223585 10883 ntAPPRIS P1 BASIC10□□□□□ -0.81
Shisal1Q0VBP7 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Shisal1Q0VBP7 Cercam-201ENSMUST00000047521 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Shisal1Q0VBP7 Ttll12-201ENSMUST00000016901 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Shisal1Q0VBP7 Zfp341-201ENSMUST00000081926 3299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Shisal1Q0VBP7 Ppp1r18-203ENSMUST00000127442 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Shisal1Q0VBP7 Uckl1-201ENSMUST00000057816 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Shisal1Q0VBP7 Zfp429-201ENSMUST00000109732 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Shisal1Q0VBP7 Cers6-201ENSMUST00000028426 7038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Shisal1Q0VBP7 Gm26823-201ENSMUST00000181425 2361 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Shisal1Q0VBP7 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Shisal1Q0VBP7 2410131K14Rik-201ENSMUST00000049138 5649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Shisal1Q0VBP7 Smc5-202ENSMUST00000223934 3448 ntAPPRIS P2 BASIC10□□□□□ -0.81
Shisal1Q0VBP7 CT573086.2-201ENSMUST00000227277 4992 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Shisal1Q0VBP7 Gm34006-202ENSMUST00000216467 1918 ntTSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Shisal1Q0VBP7 Slc39a3-205ENSMUST00000168076 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Shisal1Q0VBP7 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Shisal1Q0VBP7 Wdr59-202ENSMUST00000038193 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Shisal1Q0VBP7 Slc25a40-201ENSMUST00000066921 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Shisal1Q0VBP7 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Shisal1Q0VBP7 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Shisal1Q0VBP7 Sspn-201ENSMUST00000032383 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Shisal1Q0VBP7 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Shisal1Q0VBP7 Sstr5-202ENSMUST00000165183 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Shisal1Q0VBP7 Gm43721-201ENSMUST00000199677 2313 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Shisal1Q0VBP7 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Shisal1Q0VBP7 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Shisal1Q0VBP7 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Shisal1Q0VBP7 Arsa-202ENSMUST00000165199 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Shisal1Q0VBP7 Pianp-206ENSMUST00000162000 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Shisal1Q0VBP7 Gpld1-201ENSMUST00000021773 5224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Shisal1Q0VBP7 Gosr2-202ENSMUST00000107013 1044 ntTSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Shisal1Q0VBP7 Foxp1-205ENSMUST00000113324 2121 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Shisal1Q0VBP7 Foxp1-207ENSMUST00000113328 2121 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Shisal1Q0VBP7 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Shisal1Q0VBP7 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Shisal1Q0VBP7 Foxp1-228ENSMUST00000177307 2121 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Shisal1Q0VBP7 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Shisal1Q0VBP7 Gm3809-201ENSMUST00000180973 1006 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Shisal1Q0VBP7 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Shisal1Q0VBP7 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Shisal1Q0VBP7 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Shisal1Q0VBP7 Pfas-201ENSMUST00000021282 6373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Shisal1Q0VBP7 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Shisal1Q0VBP7 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Shisal1Q0VBP7 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Shisal1Q0VBP7 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Shisal1Q0VBP7 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Shisal1Q0VBP7 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Shisal1Q0VBP7 Slc25a42-201ENSMUST00000063788 3081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Shisal1Q0VBP7 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Shisal1Q0VBP7 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Shisal1Q0VBP7 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Shisal1Q0VBP7 Zfp853-203ENSMUST00000212715 3133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Shisal1Q0VBP7 Eya1-202ENSMUST00000080664 3426 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Shisal1Q0VBP7 Plekha5-201ENSMUST00000087622 7382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Shisal1Q0VBP7 Csrnp3-207ENSMUST00000145598 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Shisal1Q0VBP7 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Shisal1Q0VBP7 Dennd4c-202ENSMUST00000082026 7940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Shisal1Q0VBP7 Prodh-205ENSMUST00000136776 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Shisal1Q0VBP7 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Shisal1Q0VBP7 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Shisal1Q0VBP7 Slc12a8-206ENSMUST00000122427 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Shisal1Q0VBP7 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Shisal1Q0VBP7 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Shisal1Q0VBP7 Mroh5-202ENSMUST00000110021 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Shisal1Q0VBP7 Gm1661-203ENSMUST00000165128 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Shisal1Q0VBP7 Fen1-203ENSMUST00000142241 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Shisal1Q0VBP7 Nol4-204ENSMUST00000097651 4549 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Shisal1Q0VBP7 Pcnt-202ENSMUST00000217838 9341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Shisal1Q0VBP7 Slc4a3-202ENSMUST00000124341 7182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Shisal1Q0VBP7 B4galnt3-203ENSMUST00000212457 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Shisal1Q0VBP7 Mrvi1-201ENSMUST00000005751 6198 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Shisal1Q0VBP7 Rbm6-207ENSMUST00000183032 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Shisal1Q0VBP7 Psmd8-207ENSMUST00000209034 1983 ntTSL 2 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Shisal1Q0VBP7 Rnf17-201ENSMUST00000095793 5264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Shisal1Q0VBP7 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Shisal1Q0VBP7 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Shisal1Q0VBP7 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Shisal1Q0VBP7 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
Shisal1Q0VBP7 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Shisal1Q0VBP7 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Shisal1Q0VBP7 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Shisal1Q0VBP7 Rin2-202ENSMUST00000110005 4641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Shisal1Q0VBP7 Oprm1-205ENSMUST00000078634 1695 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms