Protein–RNA interactions for Protein: Q0VBF2

Tmem52b, Transmembrane protein 52B, mousemouse

Predictions only

Length 186 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem52bQ0VBF2 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Tmem52bQ0VBF2 Abat-203ENSMUST00000115839 2414 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Tmem52bQ0VBF2 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Tmem52bQ0VBF2 Stxbp1-202ENSMUST00000077458 3616 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Tmem52bQ0VBF2 Nrd1-201ENSMUST00000065977 4311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Tmem52bQ0VBF2 Tcf12-201ENSMUST00000034755 4621 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Tmem52bQ0VBF2 Per2-201ENSMUST00000069620 5833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Tmem52bQ0VBF2 Plk4-203ENSMUST00000203295 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Tmem52bQ0VBF2 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Tmem52bQ0VBF2 Plcb1-202ENSMUST00000110116 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Tmem52bQ0VBF2 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Tmem52bQ0VBF2 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Tmem52bQ0VBF2 Arr3-201ENSMUST00000113769 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Tmem52bQ0VBF2 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Tmem52bQ0VBF2 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Tmem52bQ0VBF2 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Tmem52bQ0VBF2 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Tmem52bQ0VBF2 Gm15851-201ENSMUST00000160564 662 ntTSL 3 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Tmem52bQ0VBF2 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Tmem52bQ0VBF2 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Tmem52bQ0VBF2 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Tmem52bQ0VBF2 Gm17870-201ENSMUST00000219489 1174 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Tmem52bQ0VBF2 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Tmem52bQ0VBF2 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Tmem52bQ0VBF2 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Tmem52bQ0VBF2 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Tmem52bQ0VBF2 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Tmem52bQ0VBF2 Gm648-201ENSMUST00000081133 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Tmem52bQ0VBF2 Usp24-204ENSMUST00000165709 10594 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Tmem52bQ0VBF2 Kcp-203ENSMUST00000101614 4885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Tmem52bQ0VBF2 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Tmem52bQ0VBF2 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Tmem52bQ0VBF2 Ky-201ENSMUST00000039390 5837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Tmem52bQ0VBF2 Gpd2-201ENSMUST00000028167 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Tmem52bQ0VBF2 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Tmem52bQ0VBF2 Dnmt3b-208ENSMUST00000109772 4015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Tmem52bQ0VBF2 Gm7324-201ENSMUST00000094051 1647 ntAPPRIS P1 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Tmem52bQ0VBF2 Mul1-201ENSMUST00000044058 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Tmem52bQ0VBF2 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Tmem52bQ0VBF2 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Tmem52bQ0VBF2 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Tmem52bQ0VBF2 Ccdc85a-202ENSMUST00000093253 5431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Tmem52bQ0VBF2 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Tmem52bQ0VBF2 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Tmem52bQ0VBF2 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Tmem52bQ0VBF2 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Tmem52bQ0VBF2 Gm26880-201ENSMUST00000181610 1318 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Tmem52bQ0VBF2 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Tmem52bQ0VBF2 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.63
Tmem52bQ0VBF2 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.63
Tmem52bQ0VBF2 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Tmem52bQ0VBF2 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Tmem52bQ0VBF2 Insrr-202ENSMUST00000107582 4694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Tmem52bQ0VBF2 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Tmem52bQ0VBF2 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Tmem52bQ0VBF2 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Tmem52bQ0VBF2 Map10-201ENSMUST00000053078 3542 ntAPPRIS P1 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Tmem52bQ0VBF2 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Tmem52bQ0VBF2 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Tmem52bQ0VBF2 Rhot1-204ENSMUST00000092857 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Tmem52bQ0VBF2 Arid4b-202ENSMUST00000110533 3020 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Tmem52bQ0VBF2 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Tmem52bQ0VBF2 Nfib-203ENSMUST00000107245 9116 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Tmem52bQ0VBF2 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Tmem52bQ0VBF2 Gm13716-201ENSMUST00000126401 808 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Tmem52bQ0VBF2 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Tmem52bQ0VBF2 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Tmem52bQ0VBF2 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Tmem52bQ0VBF2 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Tmem52bQ0VBF2 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Tmem52bQ0VBF2 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Tmem52bQ0VBF2 Gm26894-201ENSMUST00000180828 1134 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Tmem52bQ0VBF2 1700030C10Rik-202ENSMUST00000186243 126 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Tmem52bQ0VBF2 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Tmem52bQ0VBF2 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Tmem52bQ0VBF2 Gm38223-201ENSMUST00000194484 695 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Tmem52bQ0VBF2 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Tmem52bQ0VBF2 Gm11427-203ENSMUST00000215482 1203 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Tmem52bQ0VBF2 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Tmem52bQ0VBF2 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Tmem52bQ0VBF2 AC192088.1-201ENSMUST00000227561 301 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Tmem52bQ0VBF2 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Tmem52bQ0VBF2 Gm5129-201ENSMUST00000065372 300 ntAPPRIS P1 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Tmem52bQ0VBF2 Gm43364-201ENSMUST00000196046 3274 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Tmem52bQ0VBF2 Ntrk2-208ENSMUST00000225583 2719 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Tmem52bQ0VBF2 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Tmem52bQ0VBF2 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Tmem52bQ0VBF2 Uggt2-212ENSMUST00000156203 6456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Tmem52bQ0VBF2 Gm5124-201ENSMUST00000127554 1970 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Tmem52bQ0VBF2 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Tmem52bQ0VBF2 Abcc5-202ENSMUST00000079158 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Tmem52bQ0VBF2 Atg2b-201ENSMUST00000041055 7546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Tmem52bQ0VBF2 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Tmem52bQ0VBF2 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Tmem52bQ0VBF2 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Tmem52bQ0VBF2 Rhog-202ENSMUST00000106923 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Tmem52bQ0VBF2 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Tmem52bQ0VBF2 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Tmem52bQ0VBF2 Gm4782-201ENSMUST00000168705 2046 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Tmem52bQ0VBF2 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms