Protein–RNA interactions for Protein: Q0V8T7

Cntnap5c, Contactin-associated protein like 5-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,305 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cntnap5cQ0V8T7 Scg3-202ENSMUST00000213324 2152 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Cntnap5cQ0V8T7 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Cntnap5cQ0V8T7 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Cntnap5cQ0V8T7 Psmd13-208ENSMUST00000163610 1382 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cntnap5cQ0V8T7 Zfp575-201ENSMUST00000094705 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cntnap5cQ0V8T7 Bcl2l1-202ENSMUST00000109820 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cntnap5cQ0V8T7 Myl3-203ENSMUST00000136695 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cntnap5cQ0V8T7 Snhg20-201ENSMUST00000145438 459 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cntnap5cQ0V8T7 Gm27206-201ENSMUST00000154038 979 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cntnap5cQ0V8T7 4930524O07Rik-201ENSMUST00000161822 1050 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cntnap5cQ0V8T7 Psme1-202ENSMUST00000172738 681 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cntnap5cQ0V8T7 Gm37042-201ENSMUST00000193816 581 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Cntnap5cQ0V8T7 Gm17823-201ENSMUST00000217830 1006 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Cntnap5cQ0V8T7 Net1-207ENSMUST00000223258 597 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cntnap5cQ0V8T7 Gm11562-201ENSMUST00000073853 817 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cntnap5cQ0V8T7 Gm8399-201ENSMUST00000082300 1117 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Cntnap5cQ0V8T7 Myadm-203ENSMUST00000203328 1899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cntnap5cQ0V8T7 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cntnap5cQ0V8T7 Wwox-203ENSMUST00000109108 1771 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cntnap5cQ0V8T7 Gjb5-201ENSMUST00000046498 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cntnap5cQ0V8T7 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cntnap5cQ0V8T7 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cntnap5cQ0V8T7 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cntnap5cQ0V8T7 Adgrv1-205ENSMUST00000126444 3823 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cntnap5cQ0V8T7 Tcf4-226ENSMUST00000201094 2172 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cntnap5cQ0V8T7 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cntnap5cQ0V8T7 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cntnap5cQ0V8T7 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cntnap5cQ0V8T7 Acoxl-202ENSMUST00000110344 1573 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cntnap5cQ0V8T7 Pir-201ENSMUST00000033749 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cntnap5cQ0V8T7 Apol6-201ENSMUST00000127957 2034 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cntnap5cQ0V8T7 Olfr763-201ENSMUST00000077460 2523 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cntnap5cQ0V8T7 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cntnap5cQ0V8T7 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cntnap5cQ0V8T7 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cntnap5cQ0V8T7 AC154262.2-201ENSMUST00000224310 2293 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Cntnap5cQ0V8T7 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cntnap5cQ0V8T7 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cntnap5cQ0V8T7 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cntnap5cQ0V8T7 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Cntnap5cQ0V8T7 Cfap77-204ENSMUST00000189711 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cntnap5cQ0V8T7 6330418K02Rik-201ENSMUST00000124298 743 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cntnap5cQ0V8T7 Polr3c-202ENSMUST00000125183 923 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cntnap5cQ0V8T7 Gm14091-201ENSMUST00000133534 874 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cntnap5cQ0V8T7 Gm26185-201ENSMUST00000157692 266 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Cntnap5cQ0V8T7 Gm38297-201ENSMUST00000195122 1057 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Cntnap5cQ0V8T7 Gm42839-201ENSMUST00000198978 525 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cntnap5cQ0V8T7 Gm43118-201ENSMUST00000199149 775 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Cntnap5cQ0V8T7 Msra-205ENSMUST00000210428 1180 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cntnap5cQ0V8T7 Gm19309-201ENSMUST00000218295 205 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Cntnap5cQ0V8T7 AC148335.1-201ENSMUST00000218778 818 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cntnap5cQ0V8T7 4930447A16Rik-201ENSMUST00000022897 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cntnap5cQ0V8T7 Tspan8-201ENSMUST00000035563 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cntnap5cQ0V8T7 Gemin7-201ENSMUST00000051364 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cntnap5cQ0V8T7 n-R5s195-201ENSMUST00000082891 119 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Cntnap5cQ0V8T7 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cntnap5cQ0V8T7 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cntnap5cQ0V8T7 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cntnap5cQ0V8T7 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cntnap5cQ0V8T7 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cntnap5cQ0V8T7 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cntnap5cQ0V8T7 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cntnap5cQ0V8T7 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cntnap5cQ0V8T7 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cntnap5cQ0V8T7 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cntnap5cQ0V8T7 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cntnap5cQ0V8T7 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cntnap5cQ0V8T7 F3-201ENSMUST00000029771 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cntnap5cQ0V8T7 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cntnap5cQ0V8T7 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cntnap5cQ0V8T7 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cntnap5cQ0V8T7 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cntnap5cQ0V8T7 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cntnap5cQ0V8T7 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cntnap5cQ0V8T7 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cntnap5cQ0V8T7 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cntnap5cQ0V8T7 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cntnap5cQ0V8T7 Sgce-201ENSMUST00000004750 1703 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cntnap5cQ0V8T7 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cntnap5cQ0V8T7 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cntnap5cQ0V8T7 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cntnap5cQ0V8T7 2310026I22Rik-201ENSMUST00000180941 1300 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cntnap5cQ0V8T7 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cntnap5cQ0V8T7 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cntnap5cQ0V8T7 Pkig-203ENSMUST00000109400 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cntnap5cQ0V8T7 1700049J03Rik-201ENSMUST00000011196 421 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cntnap5cQ0V8T7 4930579D09Rik-201ENSMUST00000132321 469 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cntnap5cQ0V8T7 Gm12843-201ENSMUST00000137607 601 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cntnap5cQ0V8T7 Pigyl-202ENSMUST00000148088 676 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cntnap5cQ0V8T7 2010320O07Rik-201ENSMUST00000160935 525 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cntnap5cQ0V8T7 Gm17180-201ENSMUST00000172211 435 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cntnap5cQ0V8T7 Gm6222-202ENSMUST00000182143 629 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Cntnap5cQ0V8T7 1700120C14Rik-202ENSMUST00000187967 391 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cntnap5cQ0V8T7 Gm37008-201ENSMUST00000195712 319 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Cntnap5cQ0V8T7 Gm43133-201ENSMUST00000197472 463 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Cntnap5cQ0V8T7 Gm45880-201ENSMUST00000213041 853 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Cntnap5cQ0V8T7 Gm19163-201ENSMUST00000223313 780 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Cntnap5cQ0V8T7 AC133598.1-201ENSMUST00000224327 660 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Cntnap5cQ0V8T7 CU024892.2-201ENSMUST00000224608 832 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Cntnap5cQ0V8T7 AC022775.2-201ENSMUST00000227885 646 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms