Protein–RNA interactions for Protein: Q0P5W1

Vps8, Vacuolar protein sorting-associated protein 8 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,427 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps8Q0P5W1 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Vps8Q0P5W1 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Vps8Q0P5W1 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Vps8Q0P5W1 Banp-210ENSMUST00000173254 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Vps8Q0P5W1 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Vps8Q0P5W1 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Vps8Q0P5W1 Gm829-202ENSMUST00000146622 722 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Vps8Q0P5W1 Lage3-201ENSMUST00000015433 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Vps8Q0P5W1 Ly6g5b-202ENSMUST00000172854 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Vps8Q0P5W1 Gm37489-201ENSMUST00000191883 159 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Vps8Q0P5W1 AC132317.1-201ENSMUST00000227227 962 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Vps8Q0P5W1 Gm9843-201ENSMUST00000052867 504 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Vps8Q0P5W1 Olfr223-201ENSMUST00000061293 1111 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Vps8Q0P5W1 Gm11559-201ENSMUST00000092694 1096 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Vps8Q0P5W1 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Vps8Q0P5W1 Gm9025-201ENSMUST00000122415 1575 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Vps8Q0P5W1 AC113060.1-201ENSMUST00000225689 1573 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Vps8Q0P5W1 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Vps8Q0P5W1 Il34-204ENSMUST00000150680 1796 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Vps8Q0P5W1 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Vps8Q0P5W1 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Vps8Q0P5W1 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Vps8Q0P5W1 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Vps8Q0P5W1 Suclg1-201ENSMUST00000064740 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Vps8Q0P5W1 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Vps8Q0P5W1 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Vps8Q0P5W1 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Vps8Q0P5W1 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Vps8Q0P5W1 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Vps8Q0P5W1 Ighv8-10-201ENSMUST00000199579 358 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Vps8Q0P5W1 Gm18584-201ENSMUST00000203098 964 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Vps8Q0P5W1 Gm6082-201ENSMUST00000215204 454 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Vps8Q0P5W1 Tspan8-201ENSMUST00000035563 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Vps8Q0P5W1 Fetub-201ENSMUST00000023587 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Vps8Q0P5W1 4930444K16Rik-201ENSMUST00000220438 1767 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Vps8Q0P5W1 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Vps8Q0P5W1 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Vps8Q0P5W1 Smarcd2-203ENSMUST00000106843 2548 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Vps8Q0P5W1 Arhgef2-208ENSMUST00000175911 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Vps8Q0P5W1 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Vps8Q0P5W1 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Vps8Q0P5W1 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Vps8Q0P5W1 Zfp575-201ENSMUST00000094705 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Vps8Q0P5W1 Akr1b3-201ENSMUST00000102980 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Vps8Q0P5W1 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Vps8Q0P5W1 Rps19-203ENSMUST00000108430 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Vps8Q0P5W1 Gm14019-201ENSMUST00000131514 403 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Vps8Q0P5W1 Atp6v0e-201ENSMUST00000015719 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Vps8Q0P5W1 Gm20457-201ENSMUST00000173374 682 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Vps8Q0P5W1 Gm9061-201ENSMUST00000182707 1006 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Vps8Q0P5W1 AC153506.3-201ENSMUST00000219287 1029 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Vps8Q0P5W1 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Vps8Q0P5W1 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Vps8Q0P5W1 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Vps8Q0P5W1 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Vps8Q0P5W1 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Vps8Q0P5W1 Btrc-202ENSMUST00000111936 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Vps8Q0P5W1 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Vps8Q0P5W1 Sphk2-203ENSMUST00000210060 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Vps8Q0P5W1 Nmral1-202ENSMUST00000079130 1459 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Vps8Q0P5W1 Actc1-201ENSMUST00000090269 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Vps8Q0P5W1 Ptgir-201ENSMUST00000086101 2725 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Vps8Q0P5W1 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Vps8Q0P5W1 Tmem215-202ENSMUST00000179526 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Vps8Q0P5W1 4933416C03Rik-201ENSMUST00000099261 2254 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.67
Vps8Q0P5W1 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Vps8Q0P5W1 Misp-201ENSMUST00000046833 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Vps8Q0P5W1 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Vps8Q0P5W1 Eif3i-201ENSMUST00000102593 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Vps8Q0P5W1 Mir874-201ENSMUST00000104769 76 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Vps8Q0P5W1 Gm12216-202ENSMUST00000120776 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Vps8Q0P5W1 Gm13442-201ENSMUST00000135749 663 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Vps8Q0P5W1 Cabp2-201ENSMUST00000159148 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Vps8Q0P5W1 Gm16570-201ENSMUST00000161951 436 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Vps8Q0P5W1 Prr13-204ENSMUST00000164957 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Vps8Q0P5W1 Anapc16-205ENSMUST00000182912 566 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Vps8Q0P5W1 Gm11523-203ENSMUST00000184482 802 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Vps8Q0P5W1 Caly-203ENSMUST00000211044 1029 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Vps8Q0P5W1 Rhox2a-201ENSMUST00000063340 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Vps8Q0P5W1 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Vps8Q0P5W1 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Vps8Q0P5W1 4930488N24Rik-201ENSMUST00000188802 1527 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Vps8Q0P5W1 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Vps8Q0P5W1 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Vps8Q0P5W1 Eps8l1-214ENSMUST00000171445 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Vps8Q0P5W1 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Vps8Q0P5W1 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Vps8Q0P5W1 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Vps8Q0P5W1 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Vps8Q0P5W1 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Vps8Q0P5W1 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Vps8Q0P5W1 Gm20683-201ENSMUST00000176751 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Vps8Q0P5W1 Rbm11-203ENSMUST00000114253 2699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Vps8Q0P5W1 Sectm1a-204ENSMUST00000106120 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Vps8Q0P5W1 Gm11222-201ENSMUST00000119005 738 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Vps8Q0P5W1 Gm26185-201ENSMUST00000157692 266 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Vps8Q0P5W1 Gm2383-201ENSMUST00000181461 807 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Vps8Q0P5W1 Gm28085-201ENSMUST00000189281 1137 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Vps8Q0P5W1 2010310C07Rik-202ENSMUST00000190889 842 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Vps8Q0P5W1 Morn3-201ENSMUST00000031437 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.4 ms