Protein–RNA interactions for Protein: Q0KL01

Ubxn2b, UBX domain-containing protein 2B, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn2bQ0KL01 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ubxn2bQ0KL01 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ubxn2bQ0KL01 Chchd3-202ENSMUST00000115091 1363 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ubxn2bQ0KL01 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ubxn2bQ0KL01 Gm15477-201ENSMUST00000140578 2130 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ubxn2bQ0KL01 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ubxn2bQ0KL01 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ubxn2bQ0KL01 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ubxn2bQ0KL01 Mfsd4a-204ENSMUST00000126927 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ubxn2bQ0KL01 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ubxn2bQ0KL01 Pcca-201ENSMUST00000038374 2592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ubxn2bQ0KL01 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ubxn2bQ0KL01 Mcfd2-204ENSMUST00000144236 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ubxn2bQ0KL01 Cspp1-202ENSMUST00000117415 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ubxn2bQ0KL01 Gm13736-201ENSMUST00000119272 253 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Ubxn2bQ0KL01 Gm14704-201ENSMUST00000120300 874 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Ubxn2bQ0KL01 4631405J19Rik-204ENSMUST00000145926 936 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ubxn2bQ0KL01 Nop16-202ENSMUST00000148222 790 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ubxn2bQ0KL01 Gm25604-201ENSMUST00000158359 133 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Ubxn2bQ0KL01 Agtpbp1-219ENSMUST00000170378 653 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ubxn2bQ0KL01 Rwdd2a-202ENSMUST00000179212 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ubxn2bQ0KL01 Mir7076-201ENSMUST00000183519 74 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Ubxn2bQ0KL01 Gm45285-201ENSMUST00000210418 749 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ubxn2bQ0KL01 Gm2517-201ENSMUST00000215651 348 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Ubxn2bQ0KL01 Prss51-201ENSMUST00000063785 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ubxn2bQ0KL01 Mirlet7i-201ENSMUST00000083472 85 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Ubxn2bQ0KL01 Gm5965-201ENSMUST00000009191 588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ubxn2bQ0KL01 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ubxn2bQ0KL01 Cenpl-202ENSMUST00000111618 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ubxn2bQ0KL01 CT009713.10-201ENSMUST00000225013 1986 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Ubxn2bQ0KL01 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ubxn2bQ0KL01 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ubxn2bQ0KL01 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ubxn2bQ0KL01 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ubxn2bQ0KL01 Olfr649-202ENSMUST00000106859 1382 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ubxn2bQ0KL01 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ubxn2bQ0KL01 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ubxn2bQ0KL01 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ubxn2bQ0KL01 Gm12501-201ENSMUST00000119163 529 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Ubxn2bQ0KL01 Gm14832-201ENSMUST00000121289 322 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Ubxn2bQ0KL01 4930502E09Rik-201ENSMUST00000126016 755 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ubxn2bQ0KL01 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ubxn2bQ0KL01 Gm15978-201ENSMUST00000161043 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ubxn2bQ0KL01 Ccdc28a-203ENSMUST00000173243 590 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ubxn2bQ0KL01 Platr7-201ENSMUST00000181466 1334 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ubxn2bQ0KL01 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ubxn2bQ0KL01 Cfap77-204ENSMUST00000189711 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ubxn2bQ0KL01 Gm45120-201ENSMUST00000208880 408 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Ubxn2bQ0KL01 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ubxn2bQ0KL01 Azgp1-201ENSMUST00000035390 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ubxn2bQ0KL01 Gm6781-201ENSMUST00000038304 1242 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Ubxn2bQ0KL01 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ubxn2bQ0KL01 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ubxn2bQ0KL01 Phxr2-201ENSMUST00000060761 1159 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ubxn2bQ0KL01 Aamdc-202ENSMUST00000072725 776 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ubxn2bQ0KL01 Cbx1-202ENSMUST00000079702 912 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ubxn2bQ0KL01 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ubxn2bQ0KL01 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ubxn2bQ0KL01 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ubxn2bQ0KL01 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ubxn2bQ0KL01 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ubxn2bQ0KL01 Pced1b-201ENSMUST00000059433 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ubxn2bQ0KL01 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ubxn2bQ0KL01 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ubxn2bQ0KL01 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ubxn2bQ0KL01 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ubxn2bQ0KL01 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ubxn2bQ0KL01 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ubxn2bQ0KL01 5330439B14Rik-201ENSMUST00000194811 1392 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ubxn2bQ0KL01 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ubxn2bQ0KL01 Marcksl1-ps4-201ENSMUST00000132531 291 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Ubxn2bQ0KL01 Gm43752-201ENSMUST00000198475 697 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Ubxn2bQ0KL01 Mir7686-201ENSMUST00000200604 57 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Ubxn2bQ0KL01 Gm43050-202ENSMUST00000201152 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ubxn2bQ0KL01 Gm6722-201ENSMUST00000221586 390 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Ubxn2bQ0KL01 Prss39-201ENSMUST00000027299 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ubxn2bQ0KL01 Olfr524-201ENSMUST00000051943 1058 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ubxn2bQ0KL01 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ubxn2bQ0KL01 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ubxn2bQ0KL01 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ubxn2bQ0KL01 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ubxn2bQ0KL01 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ubxn2bQ0KL01 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ubxn2bQ0KL01 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ubxn2bQ0KL01 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ubxn2bQ0KL01 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ubxn2bQ0KL01 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ubxn2bQ0KL01 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ubxn2bQ0KL01 Ctbp2-209ENSMUST00000166439 1997 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ubxn2bQ0KL01 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Ubxn2bQ0KL01 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ubxn2bQ0KL01 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ubxn2bQ0KL01 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ubxn2bQ0KL01 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ubxn2bQ0KL01 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ubxn2bQ0KL01 Serpinb13-201ENSMUST00000027564 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ubxn2bQ0KL01 Rnf214-205ENSMUST00000160699 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ubxn2bQ0KL01 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ubxn2bQ0KL01 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ubxn2bQ0KL01 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.1 ms