Protein–RNA interactions for Protein: Q0HA38

Ttc21b, Tetratricopeptide repeat protein 21B, mousemouse

Predictions only

Length 1,315 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc21bQ0HA38 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ttc21bQ0HA38 Gcdh-202ENSMUST00000109745 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ttc21bQ0HA38 Tspan5-202ENSMUST00000119993 2107 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ttc21bQ0HA38 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ttc21bQ0HA38 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ttc21bQ0HA38 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ttc21bQ0HA38 Prr15l-203ENSMUST00000107633 930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ttc21bQ0HA38 Gm16099-202ENSMUST00000151873 660 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ttc21bQ0HA38 Fez1-208ENSMUST00000163816 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ttc21bQ0HA38 Gm25732-201ENSMUST00000175168 60 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Ttc21bQ0HA38 Gm28411-201ENSMUST00000189864 341 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ttc21bQ0HA38 Gm32468-201ENSMUST00000214199 1040 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ttc21bQ0HA38 Treml1-205ENSMUST00000225849 974 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ttc21bQ0HA38 Blvrb-201ENSMUST00000037399 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ttc21bQ0HA38 Prorsd1-201ENSMUST00000039900 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ttc21bQ0HA38 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ttc21bQ0HA38 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ttc21bQ0HA38 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ttc21bQ0HA38 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ttc21bQ0HA38 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Ttc21bQ0HA38 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ttc21bQ0HA38 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ttc21bQ0HA38 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ttc21bQ0HA38 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ttc21bQ0HA38 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ttc21bQ0HA38 Tspan13-201ENSMUST00000020896 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ttc21bQ0HA38 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ttc21bQ0HA38 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ttc21bQ0HA38 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ttc21bQ0HA38 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ttc21bQ0HA38 Jmjd8-201ENSMUST00000026832 2091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ttc21bQ0HA38 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ttc21bQ0HA38 Dhx58os-201ENSMUST00000137154 1594 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ttc21bQ0HA38 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ttc21bQ0HA38 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ttc21bQ0HA38 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ttc21bQ0HA38 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ttc21bQ0HA38 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ttc21bQ0HA38 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ttc21bQ0HA38 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ttc21bQ0HA38 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ttc21bQ0HA38 Ndufa3-202ENSMUST00000108644 351 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ttc21bQ0HA38 Gm6370-201ENSMUST00000110611 1142 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ttc21bQ0HA38 Cep97-206ENSMUST00000122280 1057 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ttc21bQ0HA38 Gm10863-201ENSMUST00000130745 438 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ttc21bQ0HA38 Nme9-202ENSMUST00000163199 1196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ttc21bQ0HA38 Gm6309-201ENSMUST00000174320 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ttc21bQ0HA38 Gm27046-201ENSMUST00000182160 463 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Ttc21bQ0HA38 Pfn1-201ENSMUST00000018437 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ttc21bQ0HA38 Gm37986-201ENSMUST00000193285 383 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Ttc21bQ0HA38 AC158605.1-202ENSMUST00000217860 540 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ttc21bQ0HA38 Tnfrsf17-201ENSMUST00000023140 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ttc21bQ0HA38 Med27-201ENSMUST00000028139 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ttc21bQ0HA38 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ttc21bQ0HA38 Gm10131-201ENSMUST00000080152 736 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ttc21bQ0HA38 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ttc21bQ0HA38 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ttc21bQ0HA38 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ttc21bQ0HA38 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ttc21bQ0HA38 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ttc21bQ0HA38 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ttc21bQ0HA38 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ttc21bQ0HA38 Gucy1a2-201ENSMUST00000115733 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ttc21bQ0HA38 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ttc21bQ0HA38 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ttc21bQ0HA38 5330426L24Rik-201ENSMUST00000200008 2175 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Ttc21bQ0HA38 Cd27-201ENSMUST00000032486 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ttc21bQ0HA38 Zyx-201ENSMUST00000070635 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ttc21bQ0HA38 Marco-201ENSMUST00000027639 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ttc21bQ0HA38 Enpp5-203ENSMUST00000154166 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ttc21bQ0HA38 Ankmy2-201ENSMUST00000041640 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ttc21bQ0HA38 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ttc21bQ0HA38 Tubb2a-ps2-201ENSMUST00000221547 1339 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
Ttc21bQ0HA38 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ttc21bQ0HA38 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ttc21bQ0HA38 Gm10544-201ENSMUST00000180516 2239 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ttc21bQ0HA38 Hsd3b7-201ENSMUST00000046863 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ttc21bQ0HA38 Gngt2-207ENSMUST00000107714 558 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ttc21bQ0HA38 Gm13736-201ENSMUST00000119272 253 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
Ttc21bQ0HA38 Gm14277-201ENSMUST00000121195 360 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
Ttc21bQ0HA38 Gm11851-201ENSMUST00000132219 692 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ttc21bQ0HA38 Mitd1-205ENSMUST00000139725 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ttc21bQ0HA38 Naa60-207ENSMUST00000150655 1166 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ttc21bQ0HA38 1700125G22Rik-201ENSMUST00000181124 861 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ttc21bQ0HA38 Gm3096-201ENSMUST00000185770 364 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
Ttc21bQ0HA38 4930578M07Rik-202ENSMUST00000212946 552 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ttc21bQ0HA38 Psma7-201ENSMUST00000029082 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ttc21bQ0HA38 Ssc4d-201ENSMUST00000054895 1191 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ttc21bQ0HA38 Gm10308-201ENSMUST00000095183 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ttc21bQ0HA38 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ttc21bQ0HA38 Mettl1-201ENSMUST00000006915 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ttc21bQ0HA38 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ttc21bQ0HA38 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ttc21bQ0HA38 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ttc21bQ0HA38 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ttc21bQ0HA38 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ttc21bQ0HA38 Rabggtb-201ENSMUST00000089950 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ttc21bQ0HA38 2900069G24Rik-201ENSMUST00000192780 1311 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Ttc21bQ0HA38 Pla2g10-202ENSMUST00000115807 964 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ttc21bQ0HA38 Acyp1-204ENSMUST00000121930 634 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.2 ms