Protein–RNA interactions for Protein: Q0GGX2

Znf541, Zinc finger protein 541, mousemouse

Predictions only

Length 1,363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf541Q0GGX2 Dnmt3l-201ENSMUST00000000746 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Znf541Q0GGX2 Ccdc71-201ENSMUST00000061209 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Znf541Q0GGX2 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Znf541Q0GGX2 Plcd3-201ENSMUST00000103077 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Znf541Q0GGX2 Luc7l2-207ENSMUST00000161227 2405 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Znf541Q0GGX2 Ttc23l-201ENSMUST00000022857 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Znf541Q0GGX2 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Znf541Q0GGX2 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Znf541Q0GGX2 Micalcl-201ENSMUST00000033033 2259 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Znf541Q0GGX2 Fam43a-201ENSMUST00000059078 3075 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Znf541Q0GGX2 Gm10544-201ENSMUST00000180516 2239 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Znf541Q0GGX2 Rps13-203ENSMUST00000205490 1317 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Znf541Q0GGX2 Pkm-202ENSMUST00000163694 2041 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Znf541Q0GGX2 1700042G07Rik-201ENSMUST00000106492 385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Znf541Q0GGX2 Snhg17-206ENSMUST00000152125 1046 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Znf541Q0GGX2 Gm17420-201ENSMUST00000164753 153 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Znf541Q0GGX2 9230110C19Rik-202ENSMUST00000215478 533 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Znf541Q0GGX2 AC165260.3-202ENSMUST00000224550 1031 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Znf541Q0GGX2 AC132317.1-201ENSMUST00000227227 962 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Znf541Q0GGX2 H2-Oa-201ENSMUST00000025192 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Znf541Q0GGX2 Asb9-201ENSMUST00000033756 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Znf541Q0GGX2 Gm24526-201ENSMUST00000082921 158 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Znf541Q0GGX2 AC153366.2-201ENSMUST00000219461 1984 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Znf541Q0GGX2 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Znf541Q0GGX2 Tmem17-201ENSMUST00000059319 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Znf541Q0GGX2 Adal-205ENSMUST00000119031 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Znf541Q0GGX2 Igfals-201ENSMUST00000050714 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Znf541Q0GGX2 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Znf541Q0GGX2 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Znf541Q0GGX2 Plk-ps1-201ENSMUST00000119494 1787 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Znf541Q0GGX2 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Znf541Q0GGX2 Nek3-202ENSMUST00000110730 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Znf541Q0GGX2 Kifc1-204ENSMUST00000173492 2350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Znf541Q0GGX2 Osbp2-202ENSMUST00000101632 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Znf541Q0GGX2 Gcom1-201ENSMUST00000163998 1726 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Znf541Q0GGX2 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Znf541Q0GGX2 Zfp207-206ENSMUST00000165565 2311 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Znf541Q0GGX2 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Znf541Q0GGX2 Smarcd2-203ENSMUST00000106843 2548 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Znf541Q0GGX2 Gm10451-201ENSMUST00000101281 1598 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Znf541Q0GGX2 Cabp1-203ENSMUST00000112112 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Znf541Q0GGX2 Fuom-203ENSMUST00000121115 872 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Znf541Q0GGX2 Ablim2-213ENSMUST00000150146 415 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Znf541Q0GGX2 Gm38293-201ENSMUST00000193209 600 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Znf541Q0GGX2 Ceacam1-209ENSMUST00000206687 1061 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Znf541Q0GGX2 Gm9899-201ENSMUST00000065519 555 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Znf541Q0GGX2 1810030O07Rik-201ENSMUST00000060108 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Znf541Q0GGX2 B430212C06Rik-205ENSMUST00000145081 2623 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Znf541Q0GGX2 Afmid-201ENSMUST00000073388 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Znf541Q0GGX2 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Znf541Q0GGX2 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Znf541Q0GGX2 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Znf541Q0GGX2 Dhx58-201ENSMUST00000017974 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Znf541Q0GGX2 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Znf541Q0GGX2 Cant1-206ENSMUST00000164927 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Znf541Q0GGX2 Gm26799-201ENSMUST00000180959 1361 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Znf541Q0GGX2 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Znf541Q0GGX2 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Znf541Q0GGX2 Ssr1-203ENSMUST00000225246 1825 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Znf541Q0GGX2 Naa40-201ENSMUST00000025675 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Znf541Q0GGX2 2310026I22Rik-201ENSMUST00000180941 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Znf541Q0GGX2 Odf3-202ENSMUST00000106049 1509 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Znf541Q0GGX2 Gm3052-202ENSMUST00000188254 2224 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Znf541Q0GGX2 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Znf541Q0GGX2 Mir1247-201ENSMUST00000116706 82 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Znf541Q0GGX2 6330418K02Rik-201ENSMUST00000124298 743 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Znf541Q0GGX2 1700066O22Rik-203ENSMUST00000150994 961 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Znf541Q0GGX2 Gm16282-201ENSMUST00000162641 451 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Znf541Q0GGX2 Tead1-207ENSMUST00000165036 1248 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Znf541Q0GGX2 Tead1-212ENSMUST00000171197 1074 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Znf541Q0GGX2 Oaz1-207ENSMUST00000180036 1044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Znf541Q0GGX2 Gm26871-201ENSMUST00000180593 700 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Znf541Q0GGX2 Gm28139-201ENSMUST00000189480 643 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Znf541Q0GGX2 Ovol3-201ENSMUST00000189482 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Znf541Q0GGX2 Gm28411-201ENSMUST00000189864 341 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Znf541Q0GGX2 Gm45720-201ENSMUST00000211881 484 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Znf541Q0GGX2 1700023F06Rik-201ENSMUST00000021323 1199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Znf541Q0GGX2 Alkbh3-201ENSMUST00000040005 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Znf541Q0GGX2 Gm9823-201ENSMUST00000051212 327 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Znf541Q0GGX2 Chchd1-201ENSMUST00000071215 616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Znf541Q0GGX2 Olfr12-201ENSMUST00000081274 1121 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Znf541Q0GGX2 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Znf541Q0GGX2 Endou-201ENSMUST00000023105 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Znf541Q0GGX2 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Znf541Q0GGX2 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Znf541Q0GGX2 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Znf541Q0GGX2 Usp16-201ENSMUST00000026710 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Znf541Q0GGX2 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Znf541Q0GGX2 Tcea1-201ENSMUST00000081551 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Znf541Q0GGX2 Cldn18-204ENSMUST00000136429 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Znf541Q0GGX2 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Znf541Q0GGX2 Gm6992-201ENSMUST00000217973 1607 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Znf541Q0GGX2 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Znf541Q0GGX2 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Znf541Q0GGX2 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Znf541Q0GGX2 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Znf541Q0GGX2 Gemin2-201ENSMUST00000021379 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Znf541Q0GGX2 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Znf541Q0GGX2 Cflar-202ENSMUST00000097722 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Znf541Q0GGX2 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37 ms