Protein–RNA interactions for Protein: Q08874

Mitf, Microphthalmia-associated transcription factor, mousemouse

Predictions only

Length 526 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MitfQ08874 Esrrb-203ENSMUST00000110204 4196 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
MitfQ08874 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
MitfQ08874 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
MitfQ08874 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
MitfQ08874 Capn9-201ENSMUST00000093033 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
MitfQ08874 Ankrd61-203ENSMUST00000110718 1774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
MitfQ08874 Pxn-202ENSMUST00000086523 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
MitfQ08874 Bmp2-201ENSMUST00000028836 3555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
MitfQ08874 Tpm3-rs7-201ENSMUST00000072359 2147 ntAPPRIS P1 BASIC12.35□□□□□ -0.43
MitfQ08874 Rbak-202ENSMUST00000165318 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
MitfQ08874 Drc1-201ENSMUST00000101448 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
MitfQ08874 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC12.35□□□□□ -0.43
MitfQ08874 Rbm48-201ENSMUST00000042753 2368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
MitfQ08874 Gm34006-202ENSMUST00000216467 1918 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
MitfQ08874 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
MitfQ08874 Fibin-201ENSMUST00000099626 2267 ntAPPRIS P1 BASIC12.35□□□□□ -0.43
MitfQ08874 Adamts3-204ENSMUST00000198151 1833 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
MitfQ08874 Ppp1r16b-201ENSMUST00000045503 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
MitfQ08874 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
MitfQ08874 Pglyrp2-202ENSMUST00000170392 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
MitfQ08874 Syvn1-204ENSMUST00000138532 3464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
MitfQ08874 9330198N18Rik-201ENSMUST00000146702 1247 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
MitfQ08874 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
MitfQ08874 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
MitfQ08874 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
MitfQ08874 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC12.35□□□□□ -0.43
MitfQ08874 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
MitfQ08874 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
MitfQ08874 Rcsd1-202ENSMUST00000097474 5001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
MitfQ08874 Usf1-207ENSMUST00000160486 1878 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
MitfQ08874 Rgp1-202ENSMUST00000107886 5888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
MitfQ08874 Gm26635-201ENSMUST00000181077 3199 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
MitfQ08874 Pgpep1-201ENSMUST00000070173 4883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
MitfQ08874 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
MitfQ08874 Slc6a18-208ENSMUST00000222029 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
MitfQ08874 Kif1c-204ENSMUST00000137119 6596 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
MitfQ08874 Wscd1-201ENSMUST00000021168 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
MitfQ08874 AC241621.2-201ENSMUST00000223991 2151 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
MitfQ08874 Arid5a-203ENSMUST00000115031 3002 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
MitfQ08874 Klk2-ps-202ENSMUST00000206865 2684 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
MitfQ08874 Smc5-202ENSMUST00000223934 3448 ntAPPRIS P2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
MitfQ08874 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
MitfQ08874 Apaf1-207ENSMUST00000161987 2710 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
MitfQ08874 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
MitfQ08874 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
MitfQ08874 Gm20683-201ENSMUST00000176751 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
MitfQ08874 B230344G16Rik-201ENSMUST00000180782 2024 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
MitfQ08874 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
MitfQ08874 Kcnc2-204ENSMUST00000219301 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
MitfQ08874 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC12.34□□□□□ -0.43
MitfQ08874 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
MitfQ08874 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
MitfQ08874 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
MitfQ08874 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
MitfQ08874 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC12.34□□□□□ -0.43
MitfQ08874 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
MitfQ08874 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
MitfQ08874 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC12.34□□□□□ -0.43
MitfQ08874 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
MitfQ08874 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
MitfQ08874 Slc7a11-205ENSMUST00000194462 2419 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
MitfQ08874 Tcf4-249ENSMUST00000202435 2427 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
MitfQ08874 Cops7b-202ENSMUST00000121534 5383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
MitfQ08874 Slc25a42-201ENSMUST00000063788 3081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
MitfQ08874 Nagk-202ENSMUST00000113850 1918 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
MitfQ08874 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
MitfQ08874 Capn11-201ENSMUST00000120717 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
MitfQ08874 Dcaf6-201ENSMUST00000027856 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
MitfQ08874 Smg8-201ENSMUST00000020801 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
MitfQ08874 Hhipl2-202ENSMUST00000192527 2310 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
MitfQ08874 Nr2c2-201ENSMUST00000113460 7647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
MitfQ08874 Irak1-203ENSMUST00000101458 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
MitfQ08874 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
MitfQ08874 Spast-201ENSMUST00000024869 4672 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
MitfQ08874 Nfatc2-202ENSMUST00000074618 6637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
MitfQ08874 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
MitfQ08874 E2f7-209ENSMUST00000174857 2865 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
MitfQ08874 Ncor2-204ENSMUST00000111394 7452 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
MitfQ08874 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
MitfQ08874 Vps4b-201ENSMUST00000094646 4633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
MitfQ08874 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
MitfQ08874 Cyb5rl-203ENSMUST00000106758 2516 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
MitfQ08874 Mcph1-201ENSMUST00000039412 4662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
MitfQ08874 Saraf-201ENSMUST00000033933 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
MitfQ08874 E230029C05Rik-205ENSMUST00000208362 2444 ntTSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.43
MitfQ08874 Dnm2-201ENSMUST00000072362 3502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
MitfQ08874 Nxf1-201ENSMUST00000010241 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
MitfQ08874 Gm42416-201ENSMUST00000115661 2856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
MitfQ08874 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
MitfQ08874 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
MitfQ08874 Prkcd-204ENSMUST00000112206 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
MitfQ08874 G2e3-201ENSMUST00000054308 6803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
MitfQ08874 Klhdc7b-201ENSMUST00000166926 1818 ntAPPRIS P2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
MitfQ08874 Ccr7-201ENSMUST00000103134 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
MitfQ08874 Bscl2-210ENSMUST00000171649 1962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
MitfQ08874 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
MitfQ08874 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
MitfQ08874 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
MitfQ08874 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
MitfQ08874 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms