Protein–RNA interactions for Protein: Q08460

Kcnma1, Calcium-activated potassium channel subunit alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,209 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnma1Q08460 Gm6091-201ENSMUST00000098307 165 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
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Kcnma1Q08460 Glod4-201ENSMUST00000017430 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
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Kcnma1Q08460 Hsd3b4-202ENSMUST00000196861 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
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Kcnma1Q08460 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
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Kcnma1Q08460 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
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Kcnma1Q08460 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Kcnma1Q08460 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Kcnma1Q08460 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Kcnma1Q08460 Acin1-219ENSMUST00000148754 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Kcnma1Q08460 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Kcnma1Q08460 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Kcnma1Q08460 5330406M23Rik-201ENSMUST00000195672 2094 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Kcnma1Q08460 Ccdc185-201ENSMUST00000060041 2055 ntAPPRIS P1 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Kcnma1Q08460 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Kcnma1Q08460 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Kcnma1Q08460 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Kcnma1Q08460 Mlx-202ENSMUST00000107302 1826 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Kcnma1Q08460 Mfsd4a-205ENSMUST00000144548 3288 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Kcnma1Q08460 Celrr-202ENSMUST00000181433 1561 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Kcnma1Q08460 Pef1-201ENSMUST00000030563 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Kcnma1Q08460 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Kcnma1Q08460 Tigd2-201ENSMUST00000062626 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Kcnma1Q08460 Gucy2e-202ENSMUST00000108664 4415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Kcnma1Q08460 Prss47-204ENSMUST00000222769 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Kcnma1Q08460 Dusp6-201ENSMUST00000020118 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
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