Protein–RNA interactions for Protein: Q08331

Calb2, Calretinin, mousemouse

Predictions only

Length 271 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Calb2Q08331 Tfe3-205ENSMUST00000115678 2658 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Calb2Q08331 Rnf113a2-201ENSMUST00000183146 1383 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Calb2Q08331 Sfxn3-202ENSMUST00000084493 2843 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Calb2Q08331 Gpatch4-203ENSMUST00000193398 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Calb2Q08331 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Calb2Q08331 Dgcr2-203ENSMUST00000117082 2987 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Calb2Q08331 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
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Calb2Q08331 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
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Calb2Q08331 Cd33-202ENSMUST00000039861 1791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Calb2Q08331 Slc25a40-201ENSMUST00000066921 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Calb2Q08331 Gba-202ENSMUST00000167998 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
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Calb2Q08331 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Calb2Q08331 Slc6a4-201ENSMUST00000021195 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Calb2Q08331 Necap1-201ENSMUST00000032477 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
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Calb2Q08331 Slc6a18-210ENSMUST00000223074 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
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Calb2Q08331 Cmtm6-201ENSMUST00000035007 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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Calb2Q08331 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Calb2Q08331 Dennd2d-201ENSMUST00000029508 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Calb2Q08331 Enpp5-203ENSMUST00000154166 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Calb2Q08331 Tjp3-205ENSMUST00000219479 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Calb2Q08331 Pde4d-201ENSMUST00000074103 2167 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Calb2Q08331 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Calb2Q08331 Chst3-201ENSMUST00000068690 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Calb2Q08331 Fgfr3-209ENSMUST00000164207 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Calb2Q08331 Islr-201ENSMUST00000041477 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Calb2Q08331 Wfs1-201ENSMUST00000043964 3787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Calb2Q08331 Eno2-216ENSMUST00000204896 1640 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Calb2Q08331 Tsku-202ENSMUST00000164726 2620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Calb2Q08331 Sorcs1-205ENSMUST00000209413 4398 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Calb2Q08331 Prkag2-202ENSMUST00000076306 2838 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40 ms