Protein–RNA interactions for Protein: Q07105

Gdf9, Growth/differentiation factor 9, mousemouse

Predictions only

Length 441 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gdf9Q07105 AC113441.2-201ENSMUST00000221538 1468 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Gdf9Q07105 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gdf9Q07105 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gdf9Q07105 Kcnk16-202ENSMUST00000225596 2127 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Gdf9Q07105 Oprm1-214ENSMUST00000105605 1503 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gdf9Q07105 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gdf9Q07105 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gdf9Q07105 Oprm1-201ENSMUST00000000783 1500 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gdf9Q07105 Dlst-201ENSMUST00000053811 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gdf9Q07105 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gdf9Q07105 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gdf9Q07105 Fbxw7-201ENSMUST00000029727 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gdf9Q07105 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gdf9Q07105 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Gdf9Q07105 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Gdf9Q07105 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Gdf9Q07105 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Gdf9Q07105 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Gdf9Q07105 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Gdf9Q07105 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Gdf9Q07105 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Gdf9Q07105 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Gdf9Q07105 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gdf9Q07105 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gdf9Q07105 Gm24255-201ENSMUST00000104481 128 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Gdf9Q07105 Gm14381-201ENSMUST00000122105 414 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Gdf9Q07105 Gm4577-201ENSMUST00000135203 716 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gdf9Q07105 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gdf9Q07105 Gnpda2-207ENSMUST00000173927 1011 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gdf9Q07105 4930516B21Rik-201ENSMUST00000181600 1195 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gdf9Q07105 Rps4l-202ENSMUST00000204242 789 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Gdf9Q07105 Scoc-203ENSMUST00000212031 409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gdf9Q07105 Erg28-201ENSMUST00000021676 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gdf9Q07105 2310002L09Rik-201ENSMUST00000030101 958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gdf9Q07105 Nkiras2-202ENSMUST00000051947 831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gdf9Q07105 Fam173a-201ENSMUST00000072735 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gdf9Q07105 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gdf9Q07105 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gdf9Q07105 Palm2-202ENSMUST00000102905 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gdf9Q07105 Nfatc4-201ENSMUST00000024179 3267 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gdf9Q07105 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gdf9Q07105 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gdf9Q07105 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gdf9Q07105 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gdf9Q07105 Alkbh3os1-201ENSMUST00000028621 1549 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gdf9Q07105 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gdf9Q07105 0610037L13Rik-207ENSMUST00000125107 1551 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gdf9Q07105 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gdf9Q07105 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gdf9Q07105 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gdf9Q07105 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gdf9Q07105 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gdf9Q07105 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gdf9Q07105 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gdf9Q07105 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gdf9Q07105 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gdf9Q07105 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gdf9Q07105 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gdf9Q07105 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gdf9Q07105 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gdf9Q07105 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gdf9Q07105 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gdf9Q07105 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gdf9Q07105 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gdf9Q07105 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gdf9Q07105 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gdf9Q07105 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gdf9Q07105 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gdf9Q07105 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gdf9Q07105 Cbl-206ENSMUST00000206147 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gdf9Q07105 Gm13369-201ENSMUST00000119442 987 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Gdf9Q07105 Rpl17-ps5-201ENSMUST00000121001 555 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Gdf9Q07105 Platr29-201ENSMUST00000130022 830 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gdf9Q07105 Gm27341-201ENSMUST00000183570 106 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Gdf9Q07105 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gdf9Q07105 Rpl10a-201ENSMUST00000042334 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gdf9Q07105 Rps5-201ENSMUST00000004554 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gdf9Q07105 Cenpm-202ENSMUST00000089157 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gdf9Q07105 Nt5c3b-203ENSMUST00000107397 1348 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gdf9Q07105 Dlk1-204ENSMUST00000109843 1300 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gdf9Q07105 Gm6203-201ENSMUST00000209575 1342 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Gdf9Q07105 Gm5620-201ENSMUST00000077991 1348 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Gdf9Q07105 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gdf9Q07105 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gdf9Q07105 5830462O15Rik-201ENSMUST00000214603 1655 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Gdf9Q07105 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gdf9Q07105 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gdf9Q07105 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gdf9Q07105 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gdf9Q07105 Gm38346-201ENSMUST00000192379 2639 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Gdf9Q07105 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gdf9Q07105 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gdf9Q07105 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gdf9Q07105 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gdf9Q07105 Gm42688-201ENSMUST00000101253 3628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gdf9Q07105 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gdf9Q07105 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gdf9Q07105 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gdf9Q07105 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Gdf9Q07105 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.3 ms