Protein–RNA interactions for Protein: Q06649

Sh3bp2, SH3 domain-binding protein 2, mousemouse

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Length 559 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp2Q06649 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Sh3bp2Q06649 Mfsd14b-201ENSMUST00000054730 3251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Sh3bp2Q06649 Dlst-201ENSMUST00000053811 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Sh3bp2Q06649 Metap1d-201ENSMUST00000037210 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Sh3bp2Q06649 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Sh3bp2Q06649 Rbm11-203ENSMUST00000114253 2699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
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Sh3bp2Q06649 C330013E15Rik-201ENSMUST00000181034 878 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
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Sh3bp2Q06649 Gm7561-201ENSMUST00000211203 886 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Sh3bp2Q06649 S100a16-201ENSMUST00000098910 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Sh3bp2Q06649 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
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Sh3bp2Q06649 Acot7-202ENSMUST00000075363 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
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Sh3bp2Q06649 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Sh3bp2Q06649 Cacng3-201ENSMUST00000084615 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Sh3bp2Q06649 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Sh3bp2Q06649 Btrc-202ENSMUST00000111936 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Sh3bp2Q06649 Acad12-202ENSMUST00000111776 2269 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Sh3bp2Q06649 Lingo1-202ENSMUST00000114247 2287 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Sh3bp2Q06649 Tmprss11d-202ENSMUST00000122377 2256 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Sh3bp2Q06649 Neu2-204ENSMUST00000165109 1824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
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Sh3bp2Q06649 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Sh3bp2Q06649 Prdm5-202ENSMUST00000031976 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
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Sh3bp2Q06649 Tldc2-201ENSMUST00000099140 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Sh3bp2Q06649 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Sh3bp2Q06649 Trim26-202ENSMUST00000123715 1406 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Sh3bp2Q06649 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Sh3bp2Q06649 Nagk-202ENSMUST00000113850 1918 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Sh3bp2Q06649 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Sh3bp2Q06649 Dhx58-201ENSMUST00000017974 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Sh3bp2Q06649 Tsku-205ENSMUST00000167405 2597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Sh3bp2Q06649 4933417O13Rik-202ENSMUST00000208893 1571 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Sh3bp2Q06649 Gm8131-201ENSMUST00000213783 1570 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Sh3bp2Q06649 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Sh3bp2Q06649 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Sh3bp2Q06649 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Sh3bp2Q06649 Gm45638-201ENSMUST00000211507 2878 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Sh3bp2Q06649 Gm44401-201ENSMUST00000204462 2375 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Sh3bp2Q06649 Rasl12-201ENSMUST00000085453 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Sh3bp2Q06649 Tigd2-201ENSMUST00000062626 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Sh3bp2Q06649 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
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