Protein–RNA interactions for Protein: Q06138

Cab39, Calcium-binding protein 39, mousemouse

Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cab39Q06138 Pla2g3-202ENSMUST00000064265 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Cab39Q06138 Srp54a-202ENSMUST00000220578 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Cab39Q06138 Nrf1-210ENSMUST00000115211 3295 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Cab39Q06138 Lmntd2-201ENSMUST00000026573 2095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Cab39Q06138 Stat3-203ENSMUST00000127638 4516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Cab39Q06138 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Cab39Q06138 Ankrd42-205ENSMUST00000138267 2827 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Cab39Q06138 Myo18a-202ENSMUST00000092884 5117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Cab39Q06138 Ajuba-201ENSMUST00000054487 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Cab39Q06138 Col6a2-201ENSMUST00000001181 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Cab39Q06138 Clec18a-203ENSMUST00000188466 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Cab39Q06138 Clec18a-201ENSMUST00000039597 1998 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Cab39Q06138 Mmp28-202ENSMUST00000103209 3438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Cab39Q06138 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Cab39Q06138 Aifm2-203ENSMUST00000099706 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Cab39Q06138 Smug1-201ENSMUST00000064067 3281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Cab39Q06138 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Cab39Q06138 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Cab39Q06138 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Cab39Q06138 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Cab39Q06138 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Cab39Q06138 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Cab39Q06138 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Cab39Q06138 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Cab39Q06138 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Cab39Q06138 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Cab39Q06138 Gm43463-201ENSMUST00000195967 1803 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Cab39Q06138 Zcchc11-202ENSMUST00000097925 5865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Cab39Q06138 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Cab39Q06138 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Cab39Q06138 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Cab39Q06138 Wnt9a-201ENSMUST00000000128 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Cab39Q06138 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Cab39Q06138 Lmna-201ENSMUST00000029699 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Cab39Q06138 Dlc1-201ENSMUST00000033923 6159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Cab39Q06138 Ccdc32-201ENSMUST00000036470 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Cab39Q06138 Sec14l2-201ENSMUST00000003681 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Cab39Q06138 Smim1-213ENSMUST00000182151 5091 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Cab39Q06138 Dgcr14-201ENSMUST00000003621 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Cab39Q06138 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Cab39Q06138 Ptprt-203ENSMUST00000109443 12112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Cab39Q06138 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Cab39Q06138 Omp-201ENSMUST00000098281 2144 ntAPPRIS P1 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Cab39Q06138 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Cab39Q06138 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Cab39Q06138 Txn2-203ENSMUST00000109747 1778 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Cab39Q06138 Pbrm1-206ENSMUST00000112094 5154 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Cab39Q06138 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Cab39Q06138 Gm13814-201ENSMUST00000141341 3077 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Cab39Q06138 Sh3bp2-201ENSMUST00000067638 2885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Cab39Q06138 Med25-211ENSMUST00000208551 2678 ntTSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Cab39Q06138 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Cab39Q06138 Setd1a-201ENSMUST00000047075 6487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Cab39Q06138 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Cab39Q06138 Rnf17-201ENSMUST00000095793 5264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Cab39Q06138 Klhl14-201ENSMUST00000049105 4018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Cab39Q06138 Rab11fip5-201ENSMUST00000060837 4035 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Cab39Q06138 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Cab39Q06138 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Cab39Q06138 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Cab39Q06138 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Cab39Q06138 Smim17-203ENSMUST00000161855 664 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Cab39Q06138 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Cab39Q06138 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Cab39Q06138 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Cab39Q06138 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Cab39Q06138 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Cab39Q06138 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Cab39Q06138 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Cab39Q06138 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Cab39Q06138 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Cab39Q06138 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Cab39Q06138 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Cab39Q06138 Bpi-203ENSMUST00000109500 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Cab39Q06138 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Cab39Q06138 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Cab39Q06138 Myo16-203ENSMUST00000207477 7169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Cab39Q06138 Snx14-207ENSMUST00000174806 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Cab39Q06138 Slc6a8-201ENSMUST00000033752 3964 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Cab39Q06138 Urgcp-203ENSMUST00000118076 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Cab39Q06138 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Cab39Q06138 Adcyap1r1-206ENSMUST00000167234 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Cab39Q06138 Rbpj-207ENSMUST00000201883 4961 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Cab39Q06138 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Cab39Q06138 Cacna2d1-203ENSMUST00000101581 3879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Cab39Q06138 Cacna2d1-206ENSMUST00000180204 3882 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Cab39Q06138 Cacna2d1-209ENSMUST00000199704 3861 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Cab39Q06138 Nepn-201ENSMUST00000067085 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Cab39Q06138 Nfe2l1-211ENSMUST00000167149 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Cab39Q06138 Tmem201-203ENSMUST00000105687 3697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Cab39Q06138 Dcun1d3-201ENSMUST00000059851 5985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Cab39Q06138 Ccnt1-208ENSMUST00000169707 7397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Cab39Q06138 Frmd4a-202ENSMUST00000091497 6208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Cab39Q06138 Abca3-201ENSMUST00000039013 6476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Cab39Q06138 Otx1-201ENSMUST00000006071 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Cab39Q06138 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Cab39Q06138 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Cab39Q06138 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Cab39Q06138 Gm45242-201ENSMUST00000210666 2129 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Cab39Q06138 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.5 ms