Protein–RNA interactions for Protein: Q04690

Nf1, Neurofibromin, mousemouse

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Length 2,841 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nf1Q04690 Anapc11-201ENSMUST00000026128 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Nf1Q04690 Lrrc8a-202ENSMUST00000113654 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Nf1Q04690 4930423D22Rik-201ENSMUST00000221909 1674 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Nf1Q04690 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Nf1Q04690 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Nf1Q04690 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Nf1Q04690 Wdr25-206ENSMUST00000221510 1600 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Nf1Q04690 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Nf1Q04690 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Nf1Q04690 Gspt1-205ENSMUST00000167571 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Nf1Q04690 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Nf1Q04690 Cd8b1-201ENSMUST00000065248 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Nf1Q04690 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Nf1Q04690 Mfn2-203ENSMUST00000105715 4043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Nf1Q04690 AC169511.2-201ENSMUST00000226674 2063 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Nf1Q04690 Prdx1-202ENSMUST00000106470 877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Nf1Q04690 Gm11597-201ENSMUST00000121423 964 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Nf1Q04690 Retn-201ENSMUST00000012849 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Nf1Q04690 Coa3-202ENSMUST00000168089 291 ntTSL 3 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Nf1Q04690 Rims3-204ENSMUST00000171363 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Nf1Q04690 U2af1l4-234ENSMUST00000171850 564 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Nf1Q04690 Gm5070-201ENSMUST00000177599 862 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Nf1Q04690 Gm29187-201ENSMUST00000186681 689 ntTSL 3 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Nf1Q04690 Gm37905-201ENSMUST00000195310 341 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Nf1Q04690 Gm8365-201ENSMUST00000197334 648 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Nf1Q04690 Polr2i-201ENSMUST00000019882 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Nf1Q04690 S100a3-204ENSMUST00000200290 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Nf1Q04690 Tmem247-201ENSMUST00000042172 752 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Nf1Q04690 Cyb5d1-201ENSMUST00000051620 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Nf1Q04690 Ormdl1-201ENSMUST00000027266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Nf1Q04690 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Nf1Q04690 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Nf1Q04690 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Nf1Q04690 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Nf1Q04690 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Nf1Q04690 Ucp3-201ENSMUST00000032958 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Nf1Q04690 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Nf1Q04690 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Nf1Q04690 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Nf1Q04690 Gm8206-201ENSMUST00000164139 1956 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Nf1Q04690 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Nf1Q04690 6230400D17Rik-201ENSMUST00000180987 1554 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Nf1Q04690 Pmp22-202ENSMUST00000108700 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Nf1Q04690 Gm15547-201ENSMUST00000122152 333 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
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Nf1Q04690 Rassf4-202ENSMUST00000203029 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Nf1Q04690 Gm39460-201ENSMUST00000215728 1266 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
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Nf1Q04690 Azgp1-201ENSMUST00000035390 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Nf1Q04690 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Nf1Q04690 Cdk15-201ENSMUST00000114248 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Nf1Q04690 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Nf1Q04690 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Nf1Q04690 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Nf1Q04690 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Nf1Q04690 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Nf1Q04690 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Nf1Q04690 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Nf1Q04690 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Nf1Q04690 Gdap1l1-202ENSMUST00000109420 2475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Nf1Q04690 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
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Nf1Q04690 Tmsb10-201ENSMUST00000114048 623 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.22□□□□□ -0.77
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Nf1Q04690 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Nf1Q04690 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Nf1Q04690 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Nf1Q04690 Phactr2-201ENSMUST00000079698 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
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Nf1Q04690 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Nf1Q04690 Rpe-202ENSMUST00000113995 2713 ntTSL 3 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Nf1Q04690 Txndc12-201ENSMUST00000030296 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Nf1Q04690 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Nf1Q04690 Cyth1-204ENSMUST00000106305 3179 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Nf1Q04690 AC079680.2-201ENSMUST00000219181 1306 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Nf1Q04690 Nrf1-219ENSMUST00000167972 1541 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Nf1Q04690 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Nf1Q04690 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Nf1Q04690 Gm11675-201ENSMUST00000121873 832 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Nf1Q04690 Gm20521-201ENSMUST00000134077 1245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Nf1Q04690 Fhit-206ENSMUST00000162278 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Nf1Q04690 Snrpa-206ENSMUST00000163311 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Nf1Q04690 Gm27184-201ENSMUST00000185095 607 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Nf1Q04690 Gm29054-201ENSMUST00000187589 1185 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Nf1Q04690 Gm32633-201ENSMUST00000205726 587 ntTSL 3 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Nf1Q04690 Ccdc153-202ENSMUST00000213891 792 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Nf1Q04690 AC136986.1-201ENSMUST00000222829 380 ntTSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Nf1Q04690 AC169036.1-201ENSMUST00000227994 296 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Nf1Q04690 Lcn10-201ENSMUST00000058912 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Nf1Q04690 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Nf1Q04690 Zfp82-201ENSMUST00000080834 2181 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Nf1Q04690 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Nf1Q04690 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Nf1Q04690 Pgbd5-203ENSMUST00000136892 1739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
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