Protein–RNA interactions for Protein: Q03517

Scg2, Secretogranin-2, mousemouse

Predictions only

Length 617 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scg2Q03517 Lamtor1-202ENSMUST00000193465 661 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Scg2Q03517 Gm38161-201ENSMUST00000195344 576 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Scg2Q03517 AC122459.1-201ENSMUST00000228373 885 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Scg2Q03517 1700123K08Rik-201ENSMUST00000031501 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Scg2Q03517 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Scg2Q03517 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Scg2Q03517 Triml2-203ENSMUST00000209872 1395 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Scg2Q03517 Pnoc-202ENSMUST00000224594 1388 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Scg2Q03517 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Scg2Q03517 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Scg2Q03517 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Scg2Q03517 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Scg2Q03517 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Scg2Q03517 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Scg2Q03517 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Scg2Q03517 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Scg2Q03517 Enpp5-203ENSMUST00000154166 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Scg2Q03517 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Scg2Q03517 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Scg2Q03517 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Scg2Q03517 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Scg2Q03517 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Scg2Q03517 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Scg2Q03517 Ighv2-9-201ENSMUST00000103451 362 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Scg2Q03517 Trav4-2-201ENSMUST00000103637 370 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Scg2Q03517 Mir874-201ENSMUST00000104769 76 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Scg2Q03517 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Scg2Q03517 Fgf18-202ENSMUST00000109363 991 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Scg2Q03517 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Scg2Q03517 Gm5466-201ENSMUST00000119395 1890 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Scg2Q03517 Gm13075-202ENSMUST00000149247 1621 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Scg2Q03517 Hhatl-202ENSMUST00000163981 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Scg2Q03517 Slc22a13b-ps-201ENSMUST00000173185 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Scg2Q03517 Naa60-209ENSMUST00000175809 279 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Scg2Q03517 Gm5741-201ENSMUST00000177563 328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Scg2Q03517 9130604C24Rik-201ENSMUST00000197965 956 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Scg2Q03517 Gm43818-201ENSMUST00000200605 466 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Scg2Q03517 Myadm-203ENSMUST00000203328 1899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Scg2Q03517 Gm45233-201ENSMUST00000203633 898 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Scg2Q03517 Gm9299-201ENSMUST00000206392 1140 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Scg2Q03517 Chchd10-203ENSMUST00000219839 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Scg2Q03517 AC139054.1-201ENSMUST00000226898 1598 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Scg2Q03517 AC154276.1-201ENSMUST00000228874 1299 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Scg2Q03517 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Scg2Q03517 Pisd-202ENSMUST00000071829 1986 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Scg2Q03517 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Scg2Q03517 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Scg2Q03517 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Scg2Q03517 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Scg2Q03517 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Scg2Q03517 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Scg2Q03517 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Scg2Q03517 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Scg2Q03517 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Scg2Q03517 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Scg2Q03517 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Scg2Q03517 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Scg2Q03517 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Scg2Q03517 Creb3-201ENSMUST00000102944 1884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Scg2Q03517 Eif4e2-206ENSMUST00000113233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Scg2Q03517 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Scg2Q03517 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Scg2Q03517 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Scg2Q03517 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Scg2Q03517 Gm14371-201ENSMUST00000138925 1518 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Scg2Q03517 Psmc3-203ENSMUST00000111441 1419 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Scg2Q03517 Gm7553-201ENSMUST00000185805 1426 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Scg2Q03517 Gm14660-201ENSMUST00000119809 575 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Scg2Q03517 Sbk3-201ENSMUST00000133272 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Scg2Q03517 BC046401-201ENSMUST00000155786 847 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Scg2Q03517 Crb3-204ENSMUST00000163763 868 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Scg2Q03517 4930594M17Rik-201ENSMUST00000181204 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Scg2Q03517 Gm27731-201ENSMUST00000185192 107 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Scg2Q03517 Hax1-207ENSMUST00000198782 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Scg2Q03517 Fam241b-202ENSMUST00000064050 1096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Scg2Q03517 Rpl36-201ENSMUST00000080492 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Scg2Q03517 Tmem256-201ENSMUST00000094065 492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Scg2Q03517 Hoxb9-202ENSMUST00000174042 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Scg2Q03517 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Scg2Q03517 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Scg2Q03517 Grin1-204ENSMUST00000114310 4276 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Scg2Q03517 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Scg2Q03517 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Scg2Q03517 B3gat1-206ENSMUST00000161431 3858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Scg2Q03517 Rnf26-205ENSMUST00000215685 1804 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Scg2Q03517 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Scg2Q03517 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Scg2Q03517 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Scg2Q03517 Ctgf-203ENSMUST00000176228 2490 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Scg2Q03517 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Scg2Q03517 4933431E20Rik-209ENSMUST00000146337 1636 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Scg2Q03517 Ate1-204ENSMUST00000178534 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Scg2Q03517 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Scg2Q03517 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Scg2Q03517 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Scg2Q03517 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Scg2Q03517 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Scg2Q03517 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Scg2Q03517 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Scg2Q03517 Folr1-205ENSMUST00000106986 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.5 ms