Protein–RNA interactions for Protein: Q02738

Gjb4, Gap junction beta-4 protein, mousemouse

Predictions only

Length 266 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb4Q02738 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Gjb4Q02738 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gjb4Q02738 Sbsn-201ENSMUST00000080518 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gjb4Q02738 Tmprss11d-202ENSMUST00000122377 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gjb4Q02738 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gjb4Q02738 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ 0
Gjb4Q02738 Slc25a42-201ENSMUST00000063788 3081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Gjb4Q02738 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gjb4Q02738 Gm13612-201ENSMUST00000119276 390 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Gjb4Q02738 Rpsa-ps9-201ENSMUST00000120702 885 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Gjb4Q02738 Gm6161-201ENSMUST00000121942 1102 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Gjb4Q02738 Plekhd1os-201ENSMUST00000153297 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gjb4Q02738 Hnrnpa3-207ENSMUST00000164947 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Gjb4Q02738 Gm6254-201ENSMUST00000168178 1072 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Gjb4Q02738 Gm6153-201ENSMUST00000172004 1058 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Gjb4Q02738 Gm9242-201ENSMUST00000177820 1074 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Gjb4Q02738 2610306M01Rik-201ENSMUST00000185414 1042 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Gjb4Q02738 Gm43714-201ENSMUST00000198351 1204 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gjb4Q02738 Gm5641-202ENSMUST00000198699 1080 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Gjb4Q02738 Gm44064-201ENSMUST00000204964 1087 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Gjb4Q02738 Gm33460-201ENSMUST00000212286 536 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Gjb4Q02738 CT573086.1-201ENSMUST00000227202 1074 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Gjb4Q02738 Gm13199-201ENSMUST00000071016 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gjb4Q02738 Dpp6-201ENSMUST00000071500 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gjb4Q02738 Fam173a-201ENSMUST00000072735 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gjb4Q02738 Spred3-201ENSMUST00000048923 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gjb4Q02738 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Gjb4Q02738 Rnps1-202ENSMUST00000115371 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gjb4Q02738 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gjb4Q02738 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gjb4Q02738 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gjb4Q02738 Rcbtb2-202ENSMUST00000110952 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gjb4Q02738 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gjb4Q02738 Spib-201ENSMUST00000035323 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gjb4Q02738 Sp6-202ENSMUST00000107622 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gjb4Q02738 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gjb4Q02738 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gjb4Q02738 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gjb4Q02738 Polrmt-202ENSMUST00000159016 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gjb4Q02738 Ubap2l-204ENSMUST00000195995 3516 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gjb4Q02738 Gm45638-201ENSMUST00000211507 2878 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Gjb4Q02738 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gjb4Q02738 Kifc1-204ENSMUST00000173492 2350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gjb4Q02738 Acad12-202ENSMUST00000111776 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gjb4Q02738 Pde4d-220ENSMUST00000177907 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gjb4Q02738 Acbd5-213ENSMUST00000227809 1986 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.04■□□□□ -0
Gjb4Q02738 Fsd1-201ENSMUST00000011733 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gjb4Q02738 Acy1-201ENSMUST00000024031 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gjb4Q02738 Trav13d-2-201ENSMUST00000103596 264 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Gjb4Q02738 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Gjb4Q02738 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gjb4Q02738 Proscos-202ENSMUST00000178990 666 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Gjb4Q02738 Gm8652-201ENSMUST00000181363 964 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Gjb4Q02738 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Gjb4Q02738 Cyct-201ENSMUST00000028430 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gjb4Q02738 Lamtor1-201ENSMUST00000033131 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gjb4Q02738 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gjb4Q02738 Il27-201ENSMUST00000058429 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gjb4Q02738 Olfr373-201ENSMUST00000074540 945 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Gjb4Q02738 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gjb4Q02738 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gjb4Q02738 Tspan12-201ENSMUST00000031678 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gjb4Q02738 Ash2l-204ENSMUST00000110610 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gjb4Q02738 Micu1-201ENSMUST00000020311 2336 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Gjb4Q02738 Pianp-207ENSMUST00000162170 2053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gjb4Q02738 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Gjb4Q02738 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gjb4Q02738 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gjb4Q02738 N6amt1-203ENSMUST00000118310 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gjb4Q02738 D830030K20Rik-201ENSMUST00000112797 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gjb4Q02738 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Gjb4Q02738 Aspg-201ENSMUST00000079400 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gjb4Q02738 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gjb4Q02738 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Gjb4Q02738 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC15.03■□□□□ -0
Gjb4Q02738 Wfdc1-201ENSMUST00000024107 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gjb4Q02738 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gjb4Q02738 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Gjb4Q02738 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gjb4Q02738 Zbtb32-201ENSMUST00000108150 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gjb4Q02738 C030018K13Rik-202ENSMUST00000196829 712 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Gjb4Q02738 Gm38671-201ENSMUST00000200573 130 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Gjb4Q02738 Rdh5-201ENSMUST00000026406 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gjb4Q02738 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gjb4Q02738 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gjb4Q02738 Omp-201ENSMUST00000098281 2144 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Gjb4Q02738 S100a16-201ENSMUST00000098910 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gjb4Q02738 Klhl26-203ENSMUST00000209415 2919 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gjb4Q02738 BB123696-201ENSMUST00000222580 2056 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gjb4Q02738 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Gjb4Q02738 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Gjb4Q02738 Cdyl-202ENSMUST00000163595 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gjb4Q02738 Rnf19b-202ENSMUST00000097874 1992 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Gjb4Q02738 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gjb4Q02738 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Gjb4Q02738 Tsku-204ENSMUST00000165901 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gjb4Q02738 Il34-204ENSMUST00000150680 1796 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gjb4Q02738 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gjb4Q02738 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gjb4Q02738 Cidec-201ENSMUST00000032416 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.2 ms