Protein–RNA interactions for Protein: Q02525

Zfp39, Zinc finger protein 39, mousemouse

Predictions only

Length 718 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp39Q02525 Armc6-201ENSMUST00000019679 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Zfp39Q02525 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Zfp39Q02525 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Zfp39Q02525 Gpa33-202ENSMUST00000060833 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Zfp39Q02525 Sema4a-202ENSMUST00000107531 2897 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Zfp39Q02525 Lrfn3-201ENSMUST00000046351 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Zfp39Q02525 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Zfp39Q02525 Lrrc20-201ENSMUST00000049242 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Zfp39Q02525 Ubqln1-202ENSMUST00000076454 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Zfp39Q02525 Rara-207ENSMUST00000164748 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Zfp39Q02525 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Zfp39Q02525 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Zfp39Q02525 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Zfp39Q02525 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Zfp39Q02525 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Zfp39Q02525 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Zfp39Q02525 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Zfp39Q02525 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Zfp39Q02525 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Zfp39Q02525 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Zfp39Q02525 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Zfp39Q02525 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Zfp39Q02525 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Zfp39Q02525 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Zfp39Q02525 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Zfp39Q02525 Cand1-201ENSMUST00000020315 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Zfp39Q02525 Tbc1d9b-201ENSMUST00000093138 4407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Zfp39Q02525 Dysf-214ENSMUST00000204354 6432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Zfp39Q02525 Zfp207-201ENSMUST00000017567 2245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Zfp39Q02525 Necab1-201ENSMUST00000041606 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Zfp39Q02525 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Zfp39Q02525 Vwa3b-202ENSMUST00000067178 1769 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Zfp39Q02525 Cul5-209ENSMUST00000166367 5942 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Zfp39Q02525 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Zfp39Q02525 Dtnb-201ENSMUST00000077930 2376 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Zfp39Q02525 Pde10a-202ENSMUST00000089085 7717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Zfp39Q02525 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Zfp39Q02525 Gm18263-201ENSMUST00000220846 1928 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Zfp39Q02525 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Zfp39Q02525 Smarca4-204ENSMUST00000174008 5405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Zfp39Q02525 Frmpd4-204ENSMUST00000112149 8456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Zfp39Q02525 AC087890.1-201ENSMUST00000219321 1823 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Zfp39Q02525 Ephb6-201ENSMUST00000114732 3762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Zfp39Q02525 Trim26-205ENSMUST00000130367 3187 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Zfp39Q02525 Pcdhb1-201ENSMUST00000052366 2588 ntAPPRIS P1 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Zfp39Q02525 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Zfp39Q02525 Cyp2a4-201ENSMUST00000098657 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Zfp39Q02525 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Zfp39Q02525 Il7-205ENSMUST00000194279 4858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Zfp39Q02525 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Zfp39Q02525 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Zfp39Q02525 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Zfp39Q02525 Flcn-202ENSMUST00000091246 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Zfp39Q02525 Pik3cd-201ENSMUST00000038859 4905 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Zfp39Q02525 Kmt5b-207ENSMUST00000113974 4150 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Zfp39Q02525 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Zfp39Q02525 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Zfp39Q02525 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Zfp39Q02525 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Zfp39Q02525 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Zfp39Q02525 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Zfp39Q02525 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Zfp39Q02525 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Zfp39Q02525 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Zfp39Q02525 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Zfp39Q02525 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Zfp39Q02525 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Zfp39Q02525 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Zfp39Q02525 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Zfp39Q02525 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Zfp39Q02525 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Zfp39Q02525 Dll1-201ENSMUST00000014917 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Zfp39Q02525 Rgma-201ENSMUST00000094312 3586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Zfp39Q02525 Tcf12-218ENSMUST00000184783 3489 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Zfp39Q02525 Pitpnm2-204ENSMUST00000159677 1690 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Zfp39Q02525 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Zfp39Q02525 Afmid-201ENSMUST00000073388 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Zfp39Q02525 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Zfp39Q02525 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Zfp39Q02525 Bcat2-203ENSMUST00000209204 2081 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Zfp39Q02525 Cdc73-201ENSMUST00000018337 11586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Zfp39Q02525 Zfp125-201ENSMUST00000079237 2488 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Zfp39Q02525 Plxdc1-201ENSMUST00000017561 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Zfp39Q02525 Poc1b-201ENSMUST00000020113 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Zfp39Q02525 Gorasp1-201ENSMUST00000035099 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Zfp39Q02525 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Zfp39Q02525 F630040K05Rik-202ENSMUST00000180558 2633 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Zfp39Q02525 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Zfp39Q02525 Sema3d-201ENSMUST00000030868 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Zfp39Q02525 Fam198a-203ENSMUST00000214536 2789 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Zfp39Q02525 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Zfp39Q02525 Sgk3-202ENSMUST00000166384 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Zfp39Q02525 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC12.33□□□□□ -0.43
Zfp39Q02525 Dpysl5-203ENSMUST00000114729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Zfp39Q02525 Zfp319-201ENSMUST00000057717 7232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Zfp39Q02525 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Zfp39Q02525 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Zfp39Q02525 Tmem132e-202ENSMUST00000092852 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Zfp39Q02525 Chpf2-202ENSMUST00000121863 3715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Zfp39Q02525 Zfp422-202ENSMUST00000079749 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.2 ms