Protein–RNA interactions for Protein: Q01149

Col1a2, Collagen alpha-2(I) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col1a2Q01149 AC110091.3-202ENSMUST00000217104 791 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Col1a2Q01149 Trpt1-201ENSMUST00000088223 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Col1a2Q01149 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Col1a2Q01149 Cyp1a2-201ENSMUST00000034860 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Col1a2Q01149 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Col1a2Q01149 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Col1a2Q01149 Pianp-207ENSMUST00000162170 2053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Col1a2Q01149 Adgrv1-205ENSMUST00000126444 3823 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Col1a2Q01149 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Col1a2Q01149 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Col1a2Q01149 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Col1a2Q01149 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Col1a2Q01149 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Col1a2Q01149 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Col1a2Q01149 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Col1a2Q01149 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Col1a2Q01149 BB123696-201ENSMUST00000222580 2056 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Col1a2Q01149 Styxl1-202ENSMUST00000111161 963 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Col1a2Q01149 Fzr1-202ENSMUST00000118812 1215 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Col1a2Q01149 Gm13297-201ENSMUST00000120205 934 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Col1a2Q01149 Bcas1os1-201ENSMUST00000133586 1239 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Col1a2Q01149 Gm9061-201ENSMUST00000182707 1006 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Col1a2Q01149 Ighv8-10-201ENSMUST00000199579 358 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Col1a2Q01149 Bcdin3d-201ENSMUST00000040313 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Col1a2Q01149 Olfr1368-201ENSMUST00000055298 1064 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Col1a2Q01149 Olfr223-201ENSMUST00000061293 1111 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Col1a2Q01149 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Col1a2Q01149 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Col1a2Q01149 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Col1a2Q01149 Zfp575-201ENSMUST00000094705 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Col1a2Q01149 Pigq-209ENSMUST00000140304 1835 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Col1a2Q01149 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Col1a2Q01149 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Col1a2Q01149 Creb3-201ENSMUST00000102944 1884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Col1a2Q01149 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Col1a2Q01149 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Col1a2Q01149 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Col1a2Q01149 Crx-203ENSMUST00000172758 1469 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Col1a2Q01149 Mrm3-201ENSMUST00000040577 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Col1a2Q01149 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Col1a2Q01149 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Col1a2Q01149 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Col1a2Q01149 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Col1a2Q01149 Fbxl19-202ENSMUST00000186116 3641 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Col1a2Q01149 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Col1a2Q01149 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Col1a2Q01149 E130114P18Rik-202ENSMUST00000107068 1132 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Col1a2Q01149 Rps19-203ENSMUST00000108430 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Col1a2Q01149 Cbfa2t2-ps1-201ENSMUST00000117165 730 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Col1a2Q01149 Gm13316-201ENSMUST00000140537 691 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Col1a2Q01149 S100a14-202ENSMUST00000167598 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Col1a2Q01149 Gm8738-201ENSMUST00000172606 329 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Col1a2Q01149 Rnf141-207ENSMUST00000176716 1080 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Col1a2Q01149 Mospd4-201ENSMUST00000180618 576 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Col1a2Q01149 1700045I11Rik-201ENSMUST00000194752 493 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Col1a2Q01149 Gm45437-201ENSMUST00000209998 448 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Col1a2Q01149 Rad51d-202ENSMUST00000021033 1201 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Col1a2Q01149 Gm10608-202ENSMUST00000213924 676 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Col1a2Q01149 AC132384.14-201ENSMUST00000219346 1147 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Col1a2Q01149 Taf1d-201ENSMUST00000034415 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Col1a2Q01149 Saa3-201ENSMUST00000006956 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Col1a2Q01149 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Col1a2Q01149 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Col1a2Q01149 Wdr53-201ENSMUST00000023474 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Col1a2Q01149 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Col1a2Q01149 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Col1a2Q01149 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Col1a2Q01149 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Col1a2Q01149 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Col1a2Q01149 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Col1a2Q01149 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Col1a2Q01149 Zc3h18-201ENSMUST00000017622 3810 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Col1a2Q01149 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Col1a2Q01149 Fetub-201ENSMUST00000023587 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Col1a2Q01149 Erlin1-206ENSMUST00000170801 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Col1a2Q01149 Endou-201ENSMUST00000023105 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Col1a2Q01149 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Col1a2Q01149 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Col1a2Q01149 Gm2237-202ENSMUST00000170694 2090 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Col1a2Q01149 Trav4d-3-201ENSMUST00000103592 331 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Col1a2Q01149 Trav4d-4-201ENSMUST00000103600 354 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Col1a2Q01149 Trav4n-3-201ENSMUST00000103618 331 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Col1a2Q01149 Trav4n-4-201ENSMUST00000103627 354 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Col1a2Q01149 Trav4-3-201ENSMUST00000103655 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Col1a2Q01149 Trav4-4-dv10-201ENSMUST00000103663 361 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Col1a2Q01149 Cabp1-203ENSMUST00000112112 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Col1a2Q01149 Gm15370-201ENSMUST00000117158 253 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Col1a2Q01149 Gm4986-201ENSMUST00000119731 549 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Col1a2Q01149 Pisd-ps1-203ENSMUST00000145164 789 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Col1a2Q01149 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Col1a2Q01149 Gm38100-201ENSMUST00000194391 1329 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Col1a2Q01149 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Col1a2Q01149 Gm44775-201ENSMUST00000207266 1456 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Col1a2Q01149 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Col1a2Q01149 Banp-210ENSMUST00000173254 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Col1a2Q01149 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Col1a2Q01149 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Col1a2Q01149 A930007I19Rik-203ENSMUST00000181726 2099 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Col1a2Q01149 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Col1a2Q01149 Rhbdl2-202ENSMUST00000106204 1120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.7 ms