Protein–RNA interactions for Protein: Q00977

Gjb2, Gap junction beta-2 protein, mousemouse

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb2Q00977 Zfp595-205ENSMUST00000171466 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gjb2Q00977 Tmem2-202ENSMUST00000096194 6667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gjb2Q00977 Necab1-202ENSMUST00000108273 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gjb2Q00977 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gjb2Q00977 Stim1-201ENSMUST00000033289 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gjb2Q00977 Gm45332-201ENSMUST00000210508 1949 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gjb2Q00977 Hsd3b7-201ENSMUST00000046863 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gjb2Q00977 Espn-213ENSMUST00000105659 3595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gjb2Q00977 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gjb2Q00977 Wdr25-206ENSMUST00000221510 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gjb2Q00977 Zfand4-202ENSMUST00000112900 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gjb2Q00977 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gjb2Q00977 2900026A02Rik-201ENSMUST00000050125 5876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gjb2Q00977 Vill-203ENSMUST00000126251 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gjb2Q00977 Dnmt3b-208ENSMUST00000109772 4015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gjb2Q00977 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gjb2Q00977 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gjb2Q00977 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gjb2Q00977 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gjb2Q00977 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gjb2Q00977 Rpl9-203ENSMUST00000120094 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gjb2Q00977 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gjb2Q00977 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gjb2Q00977 Prss36-202ENSMUST00000118755 3028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gjb2Q00977 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gjb2Q00977 Tnpo2-202ENSMUST00000166592 4884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gjb2Q00977 Lpar2-202ENSMUST00000164890 5800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gjb2Q00977 Ube2k-210ENSMUST00000202679 4682 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gjb2Q00977 Ntrk2-208ENSMUST00000225583 2719 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Gjb2Q00977 Ampd2-202ENSMUST00000102637 3586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gjb2Q00977 Edrf1-202ENSMUST00000128901 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gjb2Q00977 Laptm5-207ENSMUST00000151698 2600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gjb2Q00977 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gjb2Q00977 Rbpjl-201ENSMUST00000017151 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gjb2Q00977 Gm853-201ENSMUST00000023884 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gjb2Q00977 Phka1-206ENSMUST00000122022 6115 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gjb2Q00977 Phka1-202ENSMUST00000052012 6115 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gjb2Q00977 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gjb2Q00977 Mier3-203ENSMUST00000109272 5279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gjb2Q00977 Cnot3-201ENSMUST00000038913 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gjb2Q00977 Btrc-202ENSMUST00000111936 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gjb2Q00977 AC137842.1-201ENSMUST00000227896 2064 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Gjb2Q00977 Apol6-201ENSMUST00000127957 2034 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gjb2Q00977 Tle6-201ENSMUST00000072020 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gjb2Q00977 Hsph1-201ENSMUST00000074846 3240 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gjb2Q00977 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gjb2Q00977 Gm15851-201ENSMUST00000160564 662 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gjb2Q00977 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Gjb2Q00977 Mir7221-201ENSMUST00000184009 72 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Gjb2Q00977 Gm38144-201ENSMUST00000192790 465 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Gjb2Q00977 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gjb2Q00977 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gjb2Q00977 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gjb2Q00977 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gjb2Q00977 Sema4a-214ENSMUST00000166237 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gjb2Q00977 Notch1-201ENSMUST00000028288 9488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gjb2Q00977 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gjb2Q00977 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gjb2Q00977 Pde4d-220ENSMUST00000177907 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gjb2Q00977 Tbc1d9b-201ENSMUST00000093138 4407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gjb2Q00977 B230217C12Rik-202ENSMUST00000155954 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gjb2Q00977 Syngap1-201ENSMUST00000081285 4315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gjb2Q00977 Phf13-201ENSMUST00000055688 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gjb2Q00977 Tbc1d22a-201ENSMUST00000063414 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gjb2Q00977 Fam187a-201ENSMUST00000100369 1563 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gjb2Q00977 A930007I19Rik-203ENSMUST00000181726 2099 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gjb2Q00977 Tmem132e-202ENSMUST00000092852 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gjb2Q00977 Hlf-201ENSMUST00000004051 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gjb2Q00977 Fgfr3-215ENSMUST00000202138 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gjb2Q00977 Add2-202ENSMUST00000203196 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gjb2Q00977 Podn-201ENSMUST00000044248 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gjb2Q00977 Usp33-209ENSMUST00000197748 4183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gjb2Q00977 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gjb2Q00977 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gjb2Q00977 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gjb2Q00977 Acad12-202ENSMUST00000111776 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gjb2Q00977 Stk33-204ENSMUST00000121748 2295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gjb2Q00977 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gjb2Q00977 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gjb2Q00977 Ncor2-203ENSMUST00000111393 8661 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gjb2Q00977 Rnf180-201ENSMUST00000069686 1728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gjb2Q00977 Cd34-202ENSMUST00000110815 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gjb2Q00977 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gjb2Q00977 Mir874-201ENSMUST00000104769 76 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Gjb2Q00977 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gjb2Q00977 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gjb2Q00977 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gjb2Q00977 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gjb2Q00977 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Gjb2Q00977 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gjb2Q00977 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Gjb2Q00977 Fgfr1-203ENSMUST00000119398 3789 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gjb2Q00977 Ifi47-201ENSMUST00000046704 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gjb2Q00977 Clcn6-201ENSMUST00000030879 3306 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gjb2Q00977 Ildr1-202ENSMUST00000089618 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gjb2Q00977 Rhot1-204ENSMUST00000092857 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gjb2Q00977 Trim34a-202ENSMUST00000106848 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gjb2Q00977 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gjb2Q00977 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gjb2Q00977 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.1 ms