Protein–RNA interactions for Protein: Q00690

Sele, E-selectin, mousemouse

Predictions only

Length 612 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SeleQ00690 Gk5-202ENSMUST00000122383 4455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
SeleQ00690 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
SeleQ00690 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
SeleQ00690 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
SeleQ00690 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
SeleQ00690 Mlxip-201ENSMUST00000068237 7303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
SeleQ00690 Kcnj3-201ENSMUST00000067101 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
SeleQ00690 Ggt6-203ENSMUST00000108499 874 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
SeleQ00690 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
SeleQ00690 Rpsa-ps9-201ENSMUST00000120702 885 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
SeleQ00690 Mir1894-201ENSMUST00000122802 81 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
SeleQ00690 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
SeleQ00690 Gm13070-201ENSMUST00000146532 768 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
SeleQ00690 Gm10863-205ENSMUST00000148028 905 ntTSL 3 BASIC10.89□□□□□ -0.67
SeleQ00690 Ube4bos1-202ENSMUST00000151896 1286 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
SeleQ00690 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
SeleQ00690 Gm27892-201ENSMUST00000185017 106 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
SeleQ00690 4930438A08Rik-202ENSMUST00000208022 918 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
SeleQ00690 Gm6983-201ENSMUST00000214912 628 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
SeleQ00690 AC131997.1-201ENSMUST00000228611 1229 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
SeleQ00690 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
SeleQ00690 Prkca-202ENSMUST00000100302 2265 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
SeleQ00690 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
SeleQ00690 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
SeleQ00690 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
SeleQ00690 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
SeleQ00690 Mb21d1-201ENSMUST00000034898 3231 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
SeleQ00690 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
SeleQ00690 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
SeleQ00690 Dda1-206ENSMUST00000138892 1738 ntTSL 3 BASIC10.89□□□□□ -0.67
SeleQ00690 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
SeleQ00690 Mbnl2-204ENSMUST00000227012 2390 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
SeleQ00690 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
SeleQ00690 Phactr3-202ENSMUST00000103066 2680 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
SeleQ00690 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
SeleQ00690 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
SeleQ00690 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
SeleQ00690 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
SeleQ00690 Tex10-201ENSMUST00000030030 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
SeleQ00690 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
SeleQ00690 Gm12626-201ENSMUST00000117339 1983 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
SeleQ00690 Gm12623-201ENSMUST00000119849 1983 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
SeleQ00690 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
SeleQ00690 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
SeleQ00690 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
SeleQ00690 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
SeleQ00690 Proser1-201ENSMUST00000058577 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
SeleQ00690 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
SeleQ00690 Gm12280-201ENSMUST00000155836 1624 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
SeleQ00690 Sgce-204ENSMUST00000115577 1776 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
SeleQ00690 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
SeleQ00690 Gps1-201ENSMUST00000100134 1925 ntTSL 2 BASIC10.88□□□□□ -0.67
SeleQ00690 Nudt18-201ENSMUST00000089049 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
SeleQ00690 Plcb2-202ENSMUST00000102524 5145 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.88□□□□□ -0.67
SeleQ00690 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
SeleQ00690 Atxn7l3b-201ENSMUST00000099276 3566 ntAPPRIS P1 BASIC10.88□□□□□ -0.67
SeleQ00690 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
SeleQ00690 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
SeleQ00690 Gm15371-201ENSMUST00000117057 784 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
SeleQ00690 Gm16194-204ENSMUST00000141797 475 ntTSL 3 BASIC10.88□□□□□ -0.67
SeleQ00690 Pmepa1os-201ENSMUST00000150185 680 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
SeleQ00690 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
SeleQ00690 Gm17150-201ENSMUST00000165577 381 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
SeleQ00690 Gm6244-201ENSMUST00000178732 841 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
SeleQ00690 Gpr35-205ENSMUST00000186298 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
SeleQ00690 Gm38223-201ENSMUST00000194484 695 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
SeleQ00690 Gm42748-201ENSMUST00000199354 2341 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
SeleQ00690 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
SeleQ00690 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
SeleQ00690 Coprs-202ENSMUST00000209371 601 ntTSL 3 BASIC10.88□□□□□ -0.67
SeleQ00690 Gm8131-201ENSMUST00000213783 1570 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
SeleQ00690 Tbr1-201ENSMUST00000048934 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
SeleQ00690 Akr1b7-201ENSMUST00000007449 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
SeleQ00690 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
SeleQ00690 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
SeleQ00690 S100a16-201ENSMUST00000098910 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
SeleQ00690 Olfr142-201ENSMUST00000099752 918 ntAPPRIS P1 BASIC10.88□□□□□ -0.67
SeleQ00690 Glis2-201ENSMUST00000014447 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
SeleQ00690 Apaf1-207ENSMUST00000161987 2710 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
SeleQ00690 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
SeleQ00690 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
SeleQ00690 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
SeleQ00690 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
SeleQ00690 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
SeleQ00690 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
SeleQ00690 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
SeleQ00690 Slc7a15-201ENSMUST00000036938 1907 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
SeleQ00690 Vwa3b-202ENSMUST00000067178 1769 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC10.88□□□□□ -0.67
SeleQ00690 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
SeleQ00690 Mta2-201ENSMUST00000096240 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
SeleQ00690 Rhot1-204ENSMUST00000092857 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
SeleQ00690 Diaph1-204ENSMUST00000115631 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
SeleQ00690 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
SeleQ00690 Zmiz1os1-201ENSMUST00000156682 3469 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
SeleQ00690 Gm6198-201ENSMUST00000191337 2929 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
SeleQ00690 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
SeleQ00690 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
SeleQ00690 Tgm6-201ENSMUST00000028888 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
SeleQ00690 Cux2-210ENSMUST00000168288 4697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
SeleQ00690 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.2 ms