Protein–RNA interactions for Protein: Q00420

Gabpb1, GA-binding protein subunit beta-1, mousemouse

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Length 383 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabpb1Q00420 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Gabpb1Q00420 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gabpb1Q00420 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gabpb1Q00420 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gabpb1Q00420 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gabpb1Q00420 Pcdha11-203ENSMUST00000192447 4583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gabpb1Q00420 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gabpb1Q00420 Pik3cd-205ENSMUST00000118704 4894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gabpb1Q00420 Kbtbd6-201ENSMUST00000100359 2982 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gabpb1Q00420 Fbxo34-205ENSMUST00000168833 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gabpb1Q00420 Kbtbd6-202ENSMUST00000226192 2984 ntAPPRIS P2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gabpb1Q00420 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gabpb1Q00420 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gabpb1Q00420 Spib-201ENSMUST00000035323 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gabpb1Q00420 Rnf40-202ENSMUST00000205694 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gabpb1Q00420 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gabpb1Q00420 Ube2k-210ENSMUST00000202679 4682 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gabpb1Q00420 Gm34006-202ENSMUST00000216467 1918 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gabpb1Q00420 Cxadr-202ENSMUST00000114229 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gabpb1Q00420 Setdb1-203ENSMUST00000107171 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gabpb1Q00420 Arid3a-201ENSMUST00000019708 5361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gabpb1Q00420 Cep170b-201ENSMUST00000092279 3817 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gabpb1Q00420 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gabpb1Q00420 Fam43a-201ENSMUST00000059078 3075 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gabpb1Q00420 Astl-202ENSMUST00000089673 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gabpb1Q00420 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gabpb1Q00420 Rgs9bp-201ENSMUST00000069912 6590 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gabpb1Q00420 Dcaf11-204ENSMUST00000121622 2379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gabpb1Q00420 Pdpk1-204ENSMUST00000115409 4623 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gabpb1Q00420 Gm12416-201ENSMUST00000120911 1008 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Gabpb1Q00420 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gabpb1Q00420 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gabpb1Q00420 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gabpb1Q00420 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Gabpb1Q00420 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gabpb1Q00420 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gabpb1Q00420 1700011B04Rik-206ENSMUST00000221013 824 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gabpb1Q00420 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gabpb1Q00420 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gabpb1Q00420 C530008M17Rik-202ENSMUST00000120639 6826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gabpb1Q00420 C530008M17Rik-211ENSMUST00000163347 6835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gabpb1Q00420 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gabpb1Q00420 Renbp-209ENSMUST00000155597 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gabpb1Q00420 Bpi-203ENSMUST00000109500 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gabpb1Q00420 Kcnh7-202ENSMUST00000112452 2849 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gabpb1Q00420 Mgat3-201ENSMUST00000044970 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gabpb1Q00420 Stk33-204ENSMUST00000121748 2295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gabpb1Q00420 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gabpb1Q00420 H2-T22-202ENSMUST00000077960 1694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gabpb1Q00420 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gabpb1Q00420 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gabpb1Q00420 Ankrd17-201ENSMUST00000014421 10458 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gabpb1Q00420 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gabpb1Q00420 Kcnj3-201ENSMUST00000067101 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gabpb1Q00420 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gabpb1Q00420 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gabpb1Q00420 Crybg1-202ENSMUST00000200401 7525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
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Gabpb1Q00420 Zfp276-201ENSMUST00000001092 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gabpb1Q00420 Gm9920-204ENSMUST00000148544 2752 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gabpb1Q00420 Fuca2-203ENSMUST00000121465 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gabpb1Q00420 Pde8b-207ENSMUST00000162153 2474 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gabpb1Q00420 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gabpb1Q00420 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
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Gabpb1Q00420 Arid4b-202ENSMUST00000110533 3020 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gabpb1Q00420 Osbp2-202ENSMUST00000101632 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gabpb1Q00420 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gabpb1Q00420 Cox16-202ENSMUST00000110340 668 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
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Gabpb1Q00420 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Gabpb1Q00420 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gabpb1Q00420 Gm29608-201ENSMUST00000190444 463 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Gabpb1Q00420 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Gabpb1Q00420 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gabpb1Q00420 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gabpb1Q00420 Cluh-201ENSMUST00000092915 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gabpb1Q00420 Slc34a1-201ENSMUST00000057167 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gabpb1Q00420 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gabpb1Q00420 Armcx6-202ENSMUST00000113194 2120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gabpb1Q00420 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gabpb1Q00420 Erlin1-206ENSMUST00000170801 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gabpb1Q00420 Dlst-201ENSMUST00000053811 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gabpb1Q00420 Gm10433-202ENSMUST00000146364 1984 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gabpb1Q00420 Cyth2-208ENSMUST00000211783 1983 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gabpb1Q00420 Cd33-201ENSMUST00000004728 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gabpb1Q00420 Enpp5-203ENSMUST00000154166 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gabpb1Q00420 Gm8994-202ENSMUST00000204530 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gabpb1Q00420 Gm43423-201ENSMUST00000198390 2094 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Gabpb1Q00420 Rhbdd3-203ENSMUST00000109878 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gabpb1Q00420 Lrp2bp-202ENSMUST00000110380 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gabpb1Q00420 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gabpb1Q00420 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gabpb1Q00420 Gm15477-201ENSMUST00000140578 2130 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
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