Protein–RNA interactions for Protein: P97309

Mesp1, Mesoderm posterior protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 243 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mesp1P97309 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Mesp1P97309 Gm16342-201ENSMUST00000124025 1025 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Mesp1P97309 Gm13185-201ENSMUST00000131044 944 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Mesp1P97309 Gm15429-201ENSMUST00000151268 798 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Mesp1P97309 Kctd17-202ENSMUST00000159771 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Mesp1P97309 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Mesp1P97309 Gm27701-201ENSMUST00000184498 110 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Mesp1P97309 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Mesp1P97309 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Mesp1P97309 Gm17870-201ENSMUST00000219489 1174 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Mesp1P97309 Gm17330-201ENSMUST00000221047 165 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Mesp1P97309 AC155252.1-201ENSMUST00000226462 1208 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Mesp1P97309 Fuom-201ENSMUST00000026539 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Mesp1P97309 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Mesp1P97309 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Mesp1P97309 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Mesp1P97309 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Mesp1P97309 Cxadr-202ENSMUST00000114229 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Mesp1P97309 Cpne1-201ENSMUST00000079312 1683 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Mesp1P97309 Gm13003-201ENSMUST00000151040 2904 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Mesp1P97309 Rnf185-201ENSMUST00000064364 2906 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Mesp1P97309 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Mesp1P97309 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Mesp1P97309 Mau2-201ENSMUST00000050561 5369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Mesp1P97309 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Mesp1P97309 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Mesp1P97309 Gnas-204ENSMUST00000087877 3947 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Mesp1P97309 Ablim1-202ENSMUST00000099294 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Mesp1P97309 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Mesp1P97309 Ccdc92b-201ENSMUST00000100866 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Mesp1P97309 Atxn2l-201ENSMUST00000040202 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Mesp1P97309 Grin1-204ENSMUST00000114310 4276 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Mesp1P97309 Nrxn1-201ENSMUST00000054059 4697 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Mesp1P97309 Fam46a-201ENSMUST00000034802 5479 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Mesp1P97309 0610010F05Rik-208ENSMUST00000180260 4128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Mesp1P97309 Exd2-201ENSMUST00000038185 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Mesp1P97309 Bptf-202ENSMUST00000106762 11847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Mesp1P97309 Hdac5-203ENSMUST00000107151 4852 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Mesp1P97309 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Mesp1P97309 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Mesp1P97309 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Mesp1P97309 6030458C11Rik-202ENSMUST00000227299 3206 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Mesp1P97309 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Mesp1P97309 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Mesp1P97309 Pfkfb3-212ENSMUST00000170196 2163 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Mesp1P97309 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Mesp1P97309 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Mesp1P97309 Gm15755-201ENSMUST00000133698 659 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Mesp1P97309 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Mesp1P97309 Ube4bos1-202ENSMUST00000151896 1286 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Mesp1P97309 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Mesp1P97309 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Mesp1P97309 AC150560.1-201ENSMUST00000227731 1187 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Mesp1P97309 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Mesp1P97309 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Mesp1P97309 Hist1h2ah-201ENSMUST00000091742 405 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Mesp1P97309 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Mesp1P97309 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Mesp1P97309 Cad-206ENSMUST00000201838 3153 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Mesp1P97309 Frmpd4-204ENSMUST00000112149 8456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Mesp1P97309 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Mesp1P97309 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Mesp1P97309 Gm7899-201ENSMUST00000192935 1897 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Mesp1P97309 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Mesp1P97309 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Mesp1P97309 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Mesp1P97309 Evi5l-203ENSMUST00000176149 3938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Mesp1P97309 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Mesp1P97309 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Mesp1P97309 Gm14752-201ENSMUST00000120719 2075 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Mesp1P97309 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Mesp1P97309 Adcyap1r1-208ENSMUST00000172084 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Mesp1P97309 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Mesp1P97309 Nol9-201ENSMUST00000084116 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Mesp1P97309 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Mesp1P97309 AC154849.3-201ENSMUST00000223733 1660 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Mesp1P97309 Asb10-202ENSMUST00000117900 1432 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Mesp1P97309 Tjap1-203ENSMUST00000180283 2368 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Mesp1P97309 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Mesp1P97309 Galnt4-201ENSMUST00000161240 5089 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Mesp1P97309 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Mesp1P97309 Gk5-202ENSMUST00000122383 4455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Mesp1P97309 Cpeb3-204ENSMUST00000126188 4224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Mesp1P97309 Xlr-202ENSMUST00000067782 1860 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Mesp1P97309 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Mesp1P97309 Abcd1-201ENSMUST00000002084 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Mesp1P97309 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Mesp1P97309 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Mesp1P97309 Hdac11-201ENSMUST00000041736 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Mesp1P97309 Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 1647 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Mesp1P97309 Gpr19-208ENSMUST00000165392 1643 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Mesp1P97309 Gpr19-202ENSMUST00000066107 1647 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Mesp1P97309 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Mesp1P97309 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Mesp1P97309 Eogt-202ENSMUST00000113387 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Mesp1P97309 Cpne8-201ENSMUST00000014777 697 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Mesp1P97309 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Mesp1P97309 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Mesp1P97309 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Mesp1P97309 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.6 ms