Protein–RNA interactions for Protein: P84244

H3f3a, Histone H3.3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 136 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H3f3aP84244 Unc13a-201ENSMUST00000030170 10255 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
H3f3aP84244 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
H3f3aP84244 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
H3f3aP84244 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
H3f3aP84244 Ugt1a6a-201ENSMUST00000014263 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
H3f3aP84244 Dnajc30-201ENSMUST00000071263 1661 ntAPPRIS P1 BASIC11.9□□□□□ -0.5
H3f3aP84244 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
H3f3aP84244 Gm14371-201ENSMUST00000138925 1518 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
H3f3aP84244 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
H3f3aP84244 Mapt-201ENSMUST00000100347 1362 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
H3f3aP84244 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
H3f3aP84244 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
H3f3aP84244 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC11.9□□□□□ -0.51
H3f3aP84244 Fbxl19-202ENSMUST00000186116 3641 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.51
H3f3aP84244 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.51
H3f3aP84244 Lrp2bp-202ENSMUST00000110380 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
H3f3aP84244 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
H3f3aP84244 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
H3f3aP84244 Hspa8-202ENSMUST00000117557 2019 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
H3f3aP84244 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
H3f3aP84244 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
H3f3aP84244 Dhx37-201ENSMUST00000169485 4760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
H3f3aP84244 Gm36995-201ENSMUST00000126170 5727 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
H3f3aP84244 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
H3f3aP84244 Mau2-201ENSMUST00000050561 5369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
H3f3aP84244 Gm5912-201ENSMUST00000122282 1438 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
H3f3aP84244 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
H3f3aP84244 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
H3f3aP84244 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
H3f3aP84244 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
H3f3aP84244 Trav13d-2-201ENSMUST00000103596 264 ntAPPRIS P1 BASIC11.89□□□□□ -0.51
H3f3aP84244 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC11.89□□□□□ -0.51
H3f3aP84244 Gm12928-201ENSMUST00000117115 573 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
H3f3aP84244 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
H3f3aP84244 Gm10863-205ENSMUST00000148028 905 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
H3f3aP84244 Gm37047-201ENSMUST00000191992 533 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
H3f3aP84244 Gm34086-201ENSMUST00000196486 743 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
H3f3aP84244 Gm5276-201ENSMUST00000196683 1047 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
H3f3aP84244 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
H3f3aP84244 Hddc3-208ENSMUST00000206122 696 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
H3f3aP84244 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
H3f3aP84244 Ppp1r14d-201ENSMUST00000076084 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
H3f3aP84244 Gm16793-201ENSMUST00000181322 1680 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
H3f3aP84244 AI839979-202ENSMUST00000201790 1539 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
H3f3aP84244 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
H3f3aP84244 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
H3f3aP84244 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
H3f3aP84244 Gsn-201ENSMUST00000028239 2653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
H3f3aP84244 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
H3f3aP84244 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
H3f3aP84244 Csrnp1-201ENSMUST00000035101 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
H3f3aP84244 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
H3f3aP84244 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
H3f3aP84244 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
H3f3aP84244 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
H3f3aP84244 Spag8-202ENSMUST00000107870 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
H3f3aP84244 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC11.88□□□□□ -0.51
H3f3aP84244 Gm28386-201ENSMUST00000189147 1849 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
H3f3aP84244 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
H3f3aP84244 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
H3f3aP84244 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
H3f3aP84244 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
H3f3aP84244 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
H3f3aP84244 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
H3f3aP84244 Adsl-206ENSMUST00000168756 1439 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
H3f3aP84244 AC096628.2-201ENSMUST00000225443 1413 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
H3f3aP84244 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
H3f3aP84244 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
H3f3aP84244 Diaph1-204ENSMUST00000115631 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
H3f3aP84244 Acat2-201ENSMUST00000007005 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
H3f3aP84244 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
H3f3aP84244 Abcg4-208ENSMUST00000161354 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
H3f3aP84244 7420426K07Rik-201ENSMUST00000098460 1504 ntAPPRIS P1 BASIC11.88□□□□□ -0.51
H3f3aP84244 Acin1-219ENSMUST00000148754 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
H3f3aP84244 Cacnb4-206ENSMUST00000178799 7981 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
H3f3aP84244 Gm37844-201ENSMUST00000192473 4097 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
H3f3aP84244 Gm12138-201ENSMUST00000122180 951 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
H3f3aP84244 4930407G08Rik-201ENSMUST00000145831 698 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
H3f3aP84244 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
H3f3aP84244 Kctd17-202ENSMUST00000159771 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
H3f3aP84244 Prss54-202ENSMUST00000180075 1152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
H3f3aP84244 Myl10-204ENSMUST00000197186 607 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
H3f3aP84244 CT030657.3-201ENSMUST00000222707 1200 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
H3f3aP84244 Elane-201ENSMUST00000046091 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
H3f3aP84244 Ppil3-201ENSMUST00000081677 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
H3f3aP84244 Atp8a1-201ENSMUST00000037380 8178 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
H3f3aP84244 Gstt3-201ENSMUST00000001715 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
H3f3aP84244 Cct6a-202ENSMUST00000201414 2454 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
H3f3aP84244 Ankmy2-201ENSMUST00000041640 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
H3f3aP84244 Cnbp-209ENSMUST00000204890 1614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
H3f3aP84244 Zfp422-202ENSMUST00000079749 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
H3f3aP84244 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
H3f3aP84244 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
H3f3aP84244 N6amt1-203ENSMUST00000118310 1700 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
H3f3aP84244 Rnf40-202ENSMUST00000205694 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
H3f3aP84244 Mlx-202ENSMUST00000107302 1826 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
H3f3aP84244 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
H3f3aP84244 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
H3f3aP84244 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
H3f3aP84244 Ccdc92b-201ENSMUST00000100866 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
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