Protein–RNA interactions for Protein: P83887

Tubg1, Tubulin gamma-1 chain, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubg1P83887 Rgs7bp-201ENSMUST00000063551 7077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Tubg1P83887 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Tubg1P83887 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Tubg1P83887 Glp2r-202ENSMUST00000051765 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Tubg1P83887 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Tubg1P83887 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Tubg1P83887 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Tubg1P83887 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Tubg1P83887 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Tubg1P83887 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Tubg1P83887 Arfip2-206ENSMUST00000131446 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Tubg1P83887 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tubg1P83887 Kcnt1-204ENSMUST00000114176 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tubg1P83887 Triobp-203ENSMUST00000109689 7187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tubg1P83887 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tubg1P83887 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tubg1P83887 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tubg1P83887 Ash2l-204ENSMUST00000110610 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tubg1P83887 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tubg1P83887 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Tubg1P83887 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tubg1P83887 Acat2-201ENSMUST00000007005 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tubg1P83887 Cdk13-207ENSMUST00000223490 12548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tubg1P83887 Gm10327-201ENSMUST00000105222 1002 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Tubg1P83887 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tubg1P83887 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tubg1P83887 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tubg1P83887 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tubg1P83887 Gm15917-201ENSMUST00000162771 487 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tubg1P83887 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tubg1P83887 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tubg1P83887 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tubg1P83887 Ighv5-13-201ENSMUST00000193550 290 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Tubg1P83887 Gm18307-201ENSMUST00000206864 949 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Tubg1P83887 Dkkl1-204ENSMUST00000210741 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tubg1P83887 AC155286.1-201ENSMUST00000218632 448 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Tubg1P83887 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tubg1P83887 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tubg1P83887 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tubg1P83887 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tubg1P83887 Senp5-201ENSMUST00000023457 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tubg1P83887 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tubg1P83887 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tubg1P83887 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tubg1P83887 2900097C17Rik-202ENSMUST00000192863 4915 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Tubg1P83887 Abcc5-202ENSMUST00000079158 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tubg1P83887 Mrgprh-201ENSMUST00000075296 1809 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tubg1P83887 Adam19-201ENSMUST00000011400 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tubg1P83887 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tubg1P83887 Mettl13-201ENSMUST00000028017 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tubg1P83887 Llgl2-201ENSMUST00000103032 3551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tubg1P83887 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tubg1P83887 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tubg1P83887 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Tubg1P83887 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tubg1P83887 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tubg1P83887 Bach2-201ENSMUST00000037416 3462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tubg1P83887 Cd34-202ENSMUST00000110815 2554 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tubg1P83887 G6pc3-201ENSMUST00000070334 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tubg1P83887 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tubg1P83887 4933434E20Rik-206ENSMUST00000160640 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tubg1P83887 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tubg1P83887 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tubg1P83887 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tubg1P83887 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tubg1P83887 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tubg1P83887 Armcx1-203ENSMUST00000113197 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tubg1P83887 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tubg1P83887 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tubg1P83887 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tubg1P83887 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tubg1P83887 Zmiz1-208ENSMUST00000162645 7482 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tubg1P83887 Smpd3-201ENSMUST00000067512 5148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tubg1P83887 Gm13886-201ENSMUST00000117876 1183 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Tubg1P83887 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tubg1P83887 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tubg1P83887 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Tubg1P83887 Gm38223-201ENSMUST00000194484 695 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Tubg1P83887 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tubg1P83887 Gm45668-201ENSMUST00000211271 493 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Tubg1P83887 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tubg1P83887 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tubg1P83887 Gm3695-201ENSMUST00000087222 1009 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Tubg1P83887 Olfr142-201ENSMUST00000099752 918 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tubg1P83887 Pbrm1-203ENSMUST00000052239 5065 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tubg1P83887 Slc25a14-201ENSMUST00000033431 1760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tubg1P83887 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tubg1P83887 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Tubg1P83887 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tubg1P83887 Sipa1l2-204ENSMUST00000212987 6690 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tubg1P83887 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tubg1P83887 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tubg1P83887 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Tubg1P83887 Jade2-203ENSMUST00000109091 6099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tubg1P83887 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tubg1P83887 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tubg1P83887 Dpp6-201ENSMUST00000071500 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tubg1P83887 Tmem41b-201ENSMUST00000094097 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tubg1P83887 Gabpb1-205ENSMUST00000110424 2613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tubg1P83887 Adprhl1-205ENSMUST00000204916 5228 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.5 ms