Protein–RNA interactions for Protein: P70398

Usp9x, Probable ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase FAF-X, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp9xP70398 Gm28693-202ENSMUST00000190758 331 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Usp9xP70398 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Usp9xP70398 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Usp9xP70398 AC079680.2-201ENSMUST00000219181 1306 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Usp9xP70398 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Usp9xP70398 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Usp9xP70398 Sema7a-201ENSMUST00000043059 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Usp9xP70398 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Usp9xP70398 Tom1-201ENSMUST00000078847 1769 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Usp9xP70398 D730001G18Rik-202ENSMUST00000191407 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Usp9xP70398 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Usp9xP70398 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Usp9xP70398 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Usp9xP70398 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Usp9xP70398 Prrt3-205ENSMUST00000205170 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
Usp9xP70398 Rpl28-ps1-201ENSMUST00000121497 414 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Usp9xP70398 Gm10051-201ENSMUST00000145209 414 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Usp9xP70398 Gm5597-201ENSMUST00000182353 1193 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Usp9xP70398 4930447N08Rik-203ENSMUST00000198879 1157 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Usp9xP70398 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Usp9xP70398 Ppie-201ENSMUST00000030404 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Usp9xP70398 Il1f10-201ENSMUST00000058056 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Usp9xP70398 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Usp9xP70398 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Usp9xP70398 Foxred2-202ENSMUST00000117725 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Usp9xP70398 Gm36635-201ENSMUST00000221152 1332 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Usp9xP70398 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Usp9xP70398 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Usp9xP70398 Tnk2os-201ENSMUST00000141256 1392 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
Usp9xP70398 Efemp2-209ENSMUST00000167371 1382 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Usp9xP70398 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Usp9xP70398 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Usp9xP70398 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Usp9xP70398 Fam71f1-203ENSMUST00000164560 1411 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Usp9xP70398 Evi5l-202ENSMUST00000176072 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Usp9xP70398 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Usp9xP70398 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Usp9xP70398 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Usp9xP70398 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Usp9xP70398 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Usp9xP70398 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Usp9xP70398 Gm12020-201ENSMUST00000119030 2042 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Usp9xP70398 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Usp9xP70398 Ccdc185-201ENSMUST00000060041 2055 ntAPPRIS P1 BASIC11□□□□□ -0.65
Usp9xP70398 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Usp9xP70398 Mogat2-201ENSMUST00000064231 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Usp9xP70398 Hcfc1r1-203ENSMUST00000180140 693 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
Usp9xP70398 Gm9211-201ENSMUST00000182882 975 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Usp9xP70398 0610005C13Rik-202ENSMUST00000209510 671 ntTSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
Usp9xP70398 AC125206.1-201ENSMUST00000214070 739 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Usp9xP70398 Olfr368-201ENSMUST00000053990 985 ntAPPRIS P1 BASIC11□□□□□ -0.65
Usp9xP70398 Gm11938-201ENSMUST00000072306 663 ntAPPRIS P1 BASIC11□□□□□ -0.65
Usp9xP70398 Nfyc-203ENSMUST00000118902 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Usp9xP70398 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Usp9xP70398 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Usp9xP70398 Stpg3-201ENSMUST00000043774 1430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Usp9xP70398 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Usp9xP70398 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Usp9xP70398 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Usp9xP70398 Slc36a1-202ENSMUST00000108867 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Usp9xP70398 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Usp9xP70398 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Usp9xP70398 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Usp9xP70398 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Usp9xP70398 Gm16202-201ENSMUST00000117532 544 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Usp9xP70398 Rap1a-ps2-201ENSMUST00000118467 559 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Usp9xP70398 Ggnbp1-202ENSMUST00000122106 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Usp9xP70398 Pcbd2-202ENSMUST00000124968 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Usp9xP70398 Gm14064-201ENSMUST00000134833 727 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Usp9xP70398 H1foo-203ENSMUST00000161969 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Usp9xP70398 Snrpa-206ENSMUST00000163311 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Usp9xP70398 Hsbp1l1-201ENSMUST00000166219 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Usp9xP70398 1700030M09Rik-202ENSMUST00000181679 964 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Usp9xP70398 Gm37666-201ENSMUST00000194110 866 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Usp9xP70398 Gm7207-201ENSMUST00000211575 1067 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Usp9xP70398 AC154276.3-201ENSMUST00000227643 998 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Usp9xP70398 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Usp9xP70398 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Usp9xP70398 Olfr56-204ENSMUST00000203149 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Usp9xP70398 Ptbp2-201ENSMUST00000029780 3364 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Usp9xP70398 Ugt1a6a-201ENSMUST00000014263 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Usp9xP70398 C1qtnf2-203ENSMUST00000173002 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Usp9xP70398 4930594M17Rik-201ENSMUST00000181204 1033 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Usp9xP70398 Gm33222-201ENSMUST00000193725 654 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Usp9xP70398 1810059H22Rik-208ENSMUST00000204941 642 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Usp9xP70398 AC159103.1-201ENSMUST00000228325 429 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Usp9xP70398 Tnfrsf17-201ENSMUST00000023140 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Usp9xP70398 Omt2b-201ENSMUST00000043734 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Usp9xP70398 Dbndd1-203ENSMUST00000177240 1463 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Usp9xP70398 Pir-201ENSMUST00000033749 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Usp9xP70398 AC126444.1-201ENSMUST00000225938 1768 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Usp9xP70398 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Usp9xP70398 Apol6-206ENSMUST00000149569 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Usp9xP70398 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Usp9xP70398 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Usp9xP70398 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Usp9xP70398 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Usp9xP70398 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Usp9xP70398 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Usp9xP70398 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.6 ms