Protein–RNA interactions for Protein: P70388

Rad50, DNA repair protein RAD50, mousemouse

Predictions only

Length 1,312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad50P70388 Gm9816-201ENSMUST00000122292 1414 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Rad50P70388 Serpine3-201ENSMUST00000171692 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rad50P70388 Rnf19b-202ENSMUST00000097874 1992 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rad50P70388 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rad50P70388 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rad50P70388 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rad50P70388 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rad50P70388 Arfip2-206ENSMUST00000131446 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rad50P70388 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rad50P70388 Gtf2i-206ENSMUST00000172715 4114 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rad50P70388 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rad50P70388 Sv2c-203ENSMUST00000182289 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rad50P70388 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rad50P70388 Ptgdr2-201ENSMUST00000037261 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rad50P70388 Mogat2-201ENSMUST00000064231 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rad50P70388 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rad50P70388 6030458C11Rik-202ENSMUST00000227299 3206 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Rad50P70388 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rad50P70388 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rad50P70388 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rad50P70388 Adra1b-201ENSMUST00000067258 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rad50P70388 Med28-203ENSMUST00000119579 636 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rad50P70388 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rad50P70388 Ankzf1-201ENSMUST00000127625 1167 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rad50P70388 Pmepa1os-201ENSMUST00000150185 680 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rad50P70388 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rad50P70388 1700037F24Rik-201ENSMUST00000181254 973 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rad50P70388 Ube2a-205ENSMUST00000201068 1298 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rad50P70388 Myadm-203ENSMUST00000203328 1899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rad50P70388 Gm20219-201ENSMUST00000209718 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rad50P70388 Rpl18-208ENSMUST00000211061 552 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rad50P70388 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rad50P70388 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rad50P70388 Klhl30-201ENSMUST00000027533 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rad50P70388 Mcm6-201ENSMUST00000027601 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rad50P70388 Fam173b-201ENSMUST00000042702 1164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rad50P70388 Mta2-201ENSMUST00000096240 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rad50P70388 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rad50P70388 Gm43423-201ENSMUST00000198390 2094 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Rad50P70388 Sema6c-201ENSMUST00000090821 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rad50P70388 Nfe2-207ENSMUST00000134554 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rad50P70388 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rad50P70388 Nol10-201ENSMUST00000046011 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rad50P70388 Gm5779-202ENSMUST00000219564 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rad50P70388 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rad50P70388 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rad50P70388 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rad50P70388 Cyth2-208ENSMUST00000211783 1983 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rad50P70388 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rad50P70388 Fbxo34-205ENSMUST00000168833 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rad50P70388 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rad50P70388 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rad50P70388 Gm5989-201ENSMUST00000096092 2077 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Rad50P70388 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rad50P70388 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rad50P70388 Syngr2-202ENSMUST00000120928 1402 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rad50P70388 Gm37644-201ENSMUST00000192190 2270 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Rad50P70388 Mup-ps23-201ENSMUST00000118063 630 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Rad50P70388 Gm15966-201ENSMUST00000136853 480 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rad50P70388 Cux2-210ENSMUST00000168288 4697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rad50P70388 AY702102-202ENSMUST00000194651 1173 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Rad50P70388 4930438A08Rik-202ENSMUST00000208022 918 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rad50P70388 AC125350.2-201ENSMUST00000224737 727 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Rad50P70388 Txn1-201ENSMUST00000030051 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rad50P70388 Fau-201ENSMUST00000043074 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rad50P70388 Rnase2b-201ENSMUST00000075648 759 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rad50P70388 Tmem107-201ENSMUST00000075980 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rad50P70388 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rad50P70388 Omp-201ENSMUST00000098281 2144 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rad50P70388 Iffo2-201ENSMUST00000040023 5227 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rad50P70388 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rad50P70388 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rad50P70388 Commd1-201ENSMUST00000057843 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rad50P70388 Rnf14-202ENSMUST00000170811 2886 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rad50P70388 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rad50P70388 Lag3-201ENSMUST00000032217 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rad50P70388 Myl6-202ENSMUST00000217733 1668 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rad50P70388 Ccser2-202ENSMUST00000090024 7509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rad50P70388 Pde9a-203ENSMUST00000127929 1891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rad50P70388 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rad50P70388 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rad50P70388 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rad50P70388 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rad50P70388 Gm10433-202ENSMUST00000146364 1984 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rad50P70388 Acbd5-213ENSMUST00000227809 1986 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rad50P70388 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rad50P70388 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rad50P70388 Nepn-201ENSMUST00000067085 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rad50P70388 Ctdspl2-204ENSMUST00000110578 3386 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rad50P70388 Gm13716-201ENSMUST00000126401 808 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rad50P70388 Kctd17-202ENSMUST00000159771 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rad50P70388 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rad50P70388 Gm27839-201ENSMUST00000184242 106 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Rad50P70388 Gm45841-201ENSMUST00000207700 164 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Rad50P70388 AC192088.1-201ENSMUST00000227561 301 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Rad50P70388 Gm9899-201ENSMUST00000065519 555 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Rad50P70388 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rad50P70388 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rad50P70388 Angel2-203ENSMUST00000110899 3673 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rad50P70388 AC114008.2-201ENSMUST00000227699 1347 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.6 ms