Protein–RNA interactions for Protein: P70268

Pkn1, Serine/threonine-protein kinase N1, mousemouse

Predictions only

Length 946 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkn1P70268 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pkn1P70268 Cxadr-202ENSMUST00000114229 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pkn1P70268 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pkn1P70268 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pkn1P70268 AC153938.1-201ENSMUST00000220354 1425 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pkn1P70268 Gm18222-201ENSMUST00000202416 1387 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Pkn1P70268 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pkn1P70268 Spatc1l-202ENSMUST00000105414 1060 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pkn1P70268 Gm5940-201ENSMUST00000117582 1068 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Pkn1P70268 Rpl9-203ENSMUST00000120094 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pkn1P70268 Gm16229-201ENSMUST00000133270 1232 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pkn1P70268 Gm6152-201ENSMUST00000151704 340 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Pkn1P70268 Gm26542-201ENSMUST00000180443 1235 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pkn1P70268 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pkn1P70268 Gm18041-201ENSMUST00000218210 618 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Pkn1P70268 Gm9257-201ENSMUST00000221254 232 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Pkn1P70268 Net1-207ENSMUST00000223258 597 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pkn1P70268 Gm7399-201ENSMUST00000032395 858 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Pkn1P70268 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pkn1P70268 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pkn1P70268 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pkn1P70268 4933416C03Rik-201ENSMUST00000099261 2254 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pkn1P70268 Bag6-203ENSMUST00000172571 3599 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pkn1P70268 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pkn1P70268 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pkn1P70268 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pkn1P70268 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pkn1P70268 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pkn1P70268 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pkn1P70268 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pkn1P70268 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Pkn1P70268 Gnas-204ENSMUST00000087877 3947 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Pkn1P70268 Ackr4-204ENSMUST00000219146 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Pkn1P70268 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Pkn1P70268 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Pkn1P70268 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Pkn1P70268 Oprm1-214ENSMUST00000105605 1503 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Pkn1P70268 Oprm1-201ENSMUST00000000783 1500 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Pkn1P70268 Gm36445-201ENSMUST00000209344 1432 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Pkn1P70268 Prss47-204ENSMUST00000222769 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Pkn1P70268 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Pkn1P70268 Sema4a-214ENSMUST00000166237 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Pkn1P70268 Rps3-202ENSMUST00000107096 952 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Pkn1P70268 Cabp5-202ENSMUST00000117400 1258 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Pkn1P70268 4933427G23Rik-202ENSMUST00000126393 544 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Pkn1P70268 Tspan17-208ENSMUST00000163915 459 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Pkn1P70268 1700113H08Rik-202ENSMUST00000189456 974 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Pkn1P70268 CU024892.2-201ENSMUST00000224608 832 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Pkn1P70268 AC155237.1-201ENSMUST00000226196 1279 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Pkn1P70268 Tmem86b-201ENSMUST00000055085 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Pkn1P70268 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Pkn1P70268 Coro6-203ENSMUST00000079770 1298 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Pkn1P70268 Ces2e-202ENSMUST00000109410 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Pkn1P70268 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Pkn1P70268 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Pkn1P70268 Gns-201ENSMUST00000040344 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Pkn1P70268 Araf-203ENSMUST00000122312 2854 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Pkn1P70268 Rinl-201ENSMUST00000059857 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Pkn1P70268 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Pkn1P70268 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pkn1P70268 Igsf5-202ENSMUST00000081093 1554 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pkn1P70268 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pkn1P70268 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pkn1P70268 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pkn1P70268 Gm15477-201ENSMUST00000140578 2130 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pkn1P70268 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pkn1P70268 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Pkn1P70268 Pisd-202ENSMUST00000071829 1986 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pkn1P70268 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pkn1P70268 Senp5-201ENSMUST00000023457 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pkn1P70268 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pkn1P70268 4933409G03Rik-201ENSMUST00000102713 1263 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pkn1P70268 Arl5c-202ENSMUST00000107563 823 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pkn1P70268 Gm10156-201ENSMUST00000122364 462 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Pkn1P70268 Gm42420-201ENSMUST00000126621 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pkn1P70268 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pkn1P70268 Gm15635-202ENSMUST00000131160 917 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pkn1P70268 Ptgr2-205ENSMUST00000135001 1286 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pkn1P70268 Gm2639-201ENSMUST00000156881 1297 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Pkn1P70268 Gm3809-201ENSMUST00000180973 1006 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Pkn1P70268 Gm27331-201ENSMUST00000183705 60 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Pkn1P70268 1700065I16Rik-202ENSMUST00000185477 813 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pkn1P70268 Cryaa-201ENSMUST00000019192 1176 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pkn1P70268 Ssr2-202ENSMUST00000192495 620 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pkn1P70268 1600017P15Rik-202ENSMUST00000193960 890 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Pkn1P70268 Psmc3ip-201ENSMUST00000019447 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pkn1P70268 Gm29154-230ENSMUST00000215044 1165 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pkn1P70268 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pkn1P70268 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pkn1P70268 Gm13199-201ENSMUST00000071016 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pkn1P70268 Ppil3-201ENSMUST00000081677 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pkn1P70268 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pkn1P70268 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pkn1P70268 Stau2-215ENSMUST00000162435 2735 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pkn1P70268 Abhd6-202ENSMUST00000166497 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pkn1P70268 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pkn1P70268 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pkn1P70268 Ephb1-202ENSMUST00000085169 4101 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pkn1P70268 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pkn1P70268 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms