Protein–RNA interactions for Protein: P70217

Hoxd13, Homeobox protein Hox-D13, mousemouse

Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd13P70217 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Hoxd13P70217 6330537M06Rik-201ENSMUST00000212384 1642 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Hoxd13P70217 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Hoxd13P70217 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Hoxd13P70217 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Hoxd13P70217 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Hoxd13P70217 Cant1-206ENSMUST00000164927 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Hoxd13P70217 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Hoxd13P70217 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Hoxd13P70217 Siglecg-201ENSMUST00000005592 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Hoxd13P70217 Gm24255-201ENSMUST00000104481 128 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Hoxd13P70217 Mir877-201ENSMUST00000104738 85 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Hoxd13P70217 Fgf18-202ENSMUST00000109363 991 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Hoxd13P70217 Ufc1-202ENSMUST00000111302 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Hoxd13P70217 Gm4986-201ENSMUST00000119731 549 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Hoxd13P70217 Gm20404-201ENSMUST00000174032 621 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Hoxd13P70217 Gm5896-201ENSMUST00000189662 1024 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Hoxd13P70217 CT485787.1-201ENSMUST00000225617 968 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Hoxd13P70217 AC093022.1-201ENSMUST00000226949 1072 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Hoxd13P70217 Tnfrsf4-201ENSMUST00000030952 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Hoxd13P70217 Fgl1-201ENSMUST00000034003 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Hoxd13P70217 n-R5s77-201ENSMUST00000083757 119 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Hoxd13P70217 Zfp384-202ENSMUST00000054553 2451 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Hoxd13P70217 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Hoxd13P70217 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Hoxd13P70217 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Hoxd13P70217 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Hoxd13P70217 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Hoxd13P70217 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Hoxd13P70217 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Hoxd13P70217 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Hoxd13P70217 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Hoxd13P70217 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Hoxd13P70217 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Hoxd13P70217 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Hoxd13P70217 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Hoxd13P70217 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Hoxd13P70217 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Hoxd13P70217 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Hoxd13P70217 Gria4-203ENSMUST00000163309 2338 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Hoxd13P70217 Gm26770-201ENSMUST00000180586 2237 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Hoxd13P70217 Commd1-201ENSMUST00000057843 1459 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Hoxd13P70217 Rpn1-201ENSMUST00000032143 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Hoxd13P70217 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Hoxd13P70217 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Hoxd13P70217 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Hoxd13P70217 Catsper3-202ENSMUST00000109898 1311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Hoxd13P70217 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Hoxd13P70217 Gm43273-201ENSMUST00000199649 2594 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Hoxd13P70217 Prkcd-203ENSMUST00000112203 1927 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Hoxd13P70217 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Hoxd13P70217 Mogat1-201ENSMUST00000012331 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Hoxd13P70217 Gm15966-201ENSMUST00000136853 480 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Hoxd13P70217 Pagr1b-201ENSMUST00000172958 693 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Hoxd13P70217 Gm28085-201ENSMUST00000189281 1137 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Hoxd13P70217 Gm28511-201ENSMUST00000191594 450 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Hoxd13P70217 Stambp-ps1-201ENSMUST00000209280 1208 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Hoxd13P70217 Gm45881-201ENSMUST00000210659 517 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Hoxd13P70217 AC152453.1-201ENSMUST00000218802 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Hoxd13P70217 Majin-201ENSMUST00000025699 1239 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Hoxd13P70217 1810062G17Rik-201ENSMUST00000029268 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Hoxd13P70217 Gm5773-201ENSMUST00000090853 1143 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Hoxd13P70217 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Hoxd13P70217 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Hoxd13P70217 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Hoxd13P70217 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Hoxd13P70217 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Hoxd13P70217 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Hoxd13P70217 Ccdc121-201ENSMUST00000058825 1819 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Hoxd13P70217 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Hoxd13P70217 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Hoxd13P70217 Pus7-201ENSMUST00000119946 3407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Hoxd13P70217 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Hoxd13P70217 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Hoxd13P70217 Inhba-201ENSMUST00000042603 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Hoxd13P70217 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Hoxd13P70217 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Hoxd13P70217 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Hoxd13P70217 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Hoxd13P70217 Mos-201ENSMUST00000105158 1449 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Hoxd13P70217 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Hoxd13P70217 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Hoxd13P70217 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Hoxd13P70217 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Hoxd13P70217 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Hoxd13P70217 Crym-201ENSMUST00000033198 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Hoxd13P70217 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Hoxd13P70217 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Hoxd13P70217 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Hoxd13P70217 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Hoxd13P70217 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Hoxd13P70217 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Hoxd13P70217 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Hoxd13P70217 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Hoxd13P70217 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Hoxd13P70217 Gm12539-201ENSMUST00000121549 1098 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Hoxd13P70217 Gm14508-201ENSMUST00000127049 901 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Hoxd13P70217 P2rx4-204ENSMUST00000139631 1030 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Hoxd13P70217 P2rx4-206ENSMUST00000142664 1111 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Hoxd13P70217 D230022J07Rik-201ENSMUST00000144735 1062 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.3 ms