Protein–RNA interactions for Protein: P62892

Rpl39, 60S ribosomal protein L39, mousemouse

Predictions only

Length 51 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl39P62892 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Rpl39P62892 Elp4-202ENSMUST00000122965 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Rpl39P62892 Kcnt1-211ENSMUST00000171268 3771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Rpl39P62892 Eps15l1-203ENSMUST00000212121 2686 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Rpl39P62892 Akr1d1-201ENSMUST00000040987 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Rpl39P62892 Fbxo48-201ENSMUST00000061327 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Rpl39P62892 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Rpl39P62892 Ppp1r15a-201ENSMUST00000042105 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Rpl39P62892 Zc3h18-201ENSMUST00000017622 3810 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Rpl39P62892 F2-202ENSMUST00000111335 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Rpl39P62892 Gm17435-202ENSMUST00000212699 1998 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Rpl39P62892 Tspan1-201ENSMUST00000030465 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Rpl39P62892 Gm43273-201ENSMUST00000199649 2594 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Rpl39P62892 Csrnp2-201ENSMUST00000061457 4126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Rpl39P62892 5830411N06Rik-202ENSMUST00000093984 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Rpl39P62892 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Rpl39P62892 Slc6a18-208ENSMUST00000222029 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Rpl39P62892 Gm20700-201ENSMUST00000176749 2206 ntTSL 3 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Rpl39P62892 Naaa-201ENSMUST00000113102 2414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Rpl39P62892 Ccdc81-201ENSMUST00000041195 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Rpl39P62892 Kdm4a-202ENSMUST00000097911 4550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Rpl39P62892 Smc5-202ENSMUST00000223934 3448 ntAPPRIS P2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Rpl39P62892 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Rpl39P62892 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Rpl39P62892 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Rpl39P62892 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Rpl39P62892 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Rpl39P62892 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Rpl39P62892 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Rpl39P62892 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Rpl39P62892 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Rpl39P62892 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Rpl39P62892 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Rpl39P62892 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Rpl39P62892 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Rpl39P62892 Pym1-203ENSMUST00000218218 1143 ntTSL 3 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Rpl39P62892 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Rpl39P62892 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Rpl39P62892 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Rpl39P62892 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Rpl39P62892 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Rpl39P62892 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Rpl39P62892 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Rpl39P62892 Myadm-203ENSMUST00000203328 1899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Rpl39P62892 Ttbk2-203ENSMUST00000085840 11152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Rpl39P62892 Pgm3-201ENSMUST00000070064 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Rpl39P62892 Eif4g3-204ENSMUST00000105830 3252 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Rpl39P62892 Gm37472-201ENSMUST00000192342 4052 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Rpl39P62892 Fbxo46-201ENSMUST00000053109 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Rpl39P62892 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Rpl39P62892 Brdt-201ENSMUST00000031215 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Rpl39P62892 Msh4-201ENSMUST00000005630 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Rpl39P62892 Gm34006-202ENSMUST00000216467 1918 ntTSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Rpl39P62892 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Rpl39P62892 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Rpl39P62892 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Rpl39P62892 Terf2ip-201ENSMUST00000052138 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Rpl39P62892 Pcdhb1-201ENSMUST00000052366 2588 ntAPPRIS P1 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Rpl39P62892 Gm38385-201ENSMUST00000194454 2351 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Rpl39P62892 Pik3r1-202ENSMUST00000055518 7113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Rpl39P62892 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Rpl39P62892 Rapgef2-201ENSMUST00000118100 6573 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Rpl39P62892 Slc16a12-201ENSMUST00000009522 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Rpl39P62892 Nek1-209ENSMUST00000211672 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Rpl39P62892 Set-202ENSMUST00000102866 2824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Rpl39P62892 Ankrd42-205ENSMUST00000138267 2827 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Rpl39P62892 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Rpl39P62892 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Rpl39P62892 Sox7-201ENSMUST00000079652 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Rpl39P62892 Astl-204ENSMUST00000179618 2236 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Rpl39P62892 Med25-211ENSMUST00000208551 2678 ntTSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Rpl39P62892 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Rpl39P62892 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Rpl39P62892 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Rpl39P62892 Pck2-205ENSMUST00000226352 2784 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Rpl39P62892 Ppfia4-205ENSMUST00000189361 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Rpl39P62892 Mib1-205ENSMUST00000165555 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Rpl39P62892 Ano1-201ENSMUST00000033393 4585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Rpl39P62892 Arhgap22-202ENSMUST00000111956 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Rpl39P62892 Dph2-201ENSMUST00000030265 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Rpl39P62892 Kcnt1-212ENSMUST00000197917 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Rpl39P62892 Sun2-202ENSMUST00000089311 3709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Rpl39P62892 Matn2-203ENSMUST00000226766 3252 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Rpl39P62892 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Rpl39P62892 Gm45643-201ENSMUST00000211364 1484 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Rpl39P62892 Tmem181a-201ENSMUST00000088940 4405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Rpl39P62892 Reps2-201ENSMUST00000101102 7630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Rpl39P62892 Zbtb16-201ENSMUST00000093852 5114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Rpl39P62892 F630040K05Rik-202ENSMUST00000180558 2633 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Rpl39P62892 Xkr8-201ENSMUST00000045550 4245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Rpl39P62892 Mir874-201ENSMUST00000104769 76 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Rpl39P62892 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Rpl39P62892 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Rpl39P62892 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Rpl39P62892 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Rpl39P62892 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Rpl39P62892 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Rpl39P62892 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Rpl39P62892 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Rpl39P62892 9330198N18Rik-201ENSMUST00000146702 1247 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.5 ms