Protein–RNA interactions for Protein: P62315

Snrpd1, Small nuclear ribonucleoprotein Sm D1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 119 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snrpd1P62315 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Snrpd1P62315 Ppp1r12b-201ENSMUST00000045665 8840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Snrpd1P62315 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Snrpd1P62315 Plaur-201ENSMUST00000002284 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Snrpd1P62315 Wapl-205ENSMUST00000169910 4066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Snrpd1P62315 Agbl3-202ENSMUST00000115012 790 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Snrpd1P62315 Agbl3-203ENSMUST00000115014 805 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Snrpd1P62315 Gm12945-201ENSMUST00000140080 674 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Snrpd1P62315 Haglr-202ENSMUST00000152462 443 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Snrpd1P62315 Alms1-ps2-201ENSMUST00000160606 1170 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Snrpd1P62315 6030498E09Rik-202ENSMUST00000168144 510 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Snrpd1P62315 Mturn-202ENSMUST00000187701 503 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Snrpd1P62315 Atp6v0c-ps1-201ENSMUST00000206596 463 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Snrpd1P62315 AC159474.1-201ENSMUST00000218454 374 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Snrpd1P62315 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Snrpd1P62315 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Snrpd1P62315 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Snrpd1P62315 Gpr19-204ENSMUST00000116515 2075 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Snrpd1P62315 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Snrpd1P62315 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Snrpd1P62315 1500009C09Rik-202ENSMUST00000143238 1552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Snrpd1P62315 Bscl2-210ENSMUST00000171649 1962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Snrpd1P62315 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Snrpd1P62315 Hyal1-204ENSMUST00000144392 1332 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Snrpd1P62315 Krt40-201ENSMUST00000074253 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Snrpd1P62315 Fsd1-201ENSMUST00000011733 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Snrpd1P62315 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
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Snrpd1P62315 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Snrpd1P62315 Tmed9-203ENSMUST00000224741 1450 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Snrpd1P62315 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Snrpd1P62315 Ntng1-208ENSMUST00000133268 5587 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Snrpd1P62315 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Snrpd1P62315 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Snrpd1P62315 4933434M16Rik-202ENSMUST00000153429 1940 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Snrpd1P62315 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Snrpd1P62315 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Snrpd1P62315 Draxin-201ENSMUST00000030862 5200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Snrpd1P62315 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Snrpd1P62315 Arpc3-203ENSMUST00000111713 708 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Snrpd1P62315 Gm16202-201ENSMUST00000117532 544 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Snrpd1P62315 Plekhd1os-201ENSMUST00000153297 944 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Snrpd1P62315 Gm8835-201ENSMUST00000173096 1169 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Snrpd1P62315 C430014B12Rik-201ENSMUST00000181720 1001 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Snrpd1P62315 1700094J05Rik-202ENSMUST00000190491 997 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Snrpd1P62315 3830422I06Rik-201ENSMUST00000200199 1181 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Snrpd1P62315 Gm44064-201ENSMUST00000204964 1087 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Snrpd1P62315 Chd3os-203ENSMUST00000218008 1026 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Snrpd1P62315 Pym1-203ENSMUST00000218218 1143 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Snrpd1P62315 AC134335.2-201ENSMUST00000227660 440 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Snrpd1P62315 Mdk-201ENSMUST00000028672 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Snrpd1P62315 Bst2-201ENSMUST00000051672 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Snrpd1P62315 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Snrpd1P62315 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Snrpd1P62315 Ppp6r1-201ENSMUST00000064099 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Snrpd1P62315 Pde9a-203ENSMUST00000127929 1891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Snrpd1P62315 Nr3c1-203ENSMUST00000115567 6436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Snrpd1P62315 Unc45bos-201ENSMUST00000156395 1306 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Snrpd1P62315 Med4-201ENSMUST00000022705 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Snrpd1P62315 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Snrpd1P62315 Necab1-201ENSMUST00000041606 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Snrpd1P62315 Otud4-203ENSMUST00000173286 7213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Snrpd1P62315 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Snrpd1P62315 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Snrpd1P62315 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
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Snrpd1P62315 Siglecg-201ENSMUST00000005592 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Snrpd1P62315 Rad54b-202ENSMUST00000095145 2403 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
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Snrpd1P62315 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Snrpd1P62315 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Snrpd1P62315 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Snrpd1P62315 Nap1l1-203ENSMUST00000217908 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Snrpd1P62315 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Snrpd1P62315 Nynrin-202ENSMUST00000168479 7511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Snrpd1P62315 Cidec-201ENSMUST00000032416 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Snrpd1P62315 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Snrpd1P62315 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Snrpd1P62315 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Snrpd1P62315 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Snrpd1P62315 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Snrpd1P62315 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Snrpd1P62315 Pde12-201ENSMUST00000052932 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Snrpd1P62315 Trim26-202ENSMUST00000123715 1406 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Snrpd1P62315 Lsm2-202ENSMUST00000114011 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Snrpd1P62315 Selenoh-203ENSMUST00000117299 747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Snrpd1P62315 Gm11618-201ENSMUST00000117946 267 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Snrpd1P62315 Ccdc169-203ENSMUST00000118963 740 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Snrpd1P62315 Pisd-ps2-202ENSMUST00000142526 1175 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Snrpd1P62315 Tnnt1-208ENSMUST00000166161 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Snrpd1P62315 Rims3-204ENSMUST00000171363 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Snrpd1P62315 Mhrt-201ENSMUST00000181782 828 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Snrpd1P62315 C030018K13Rik-202ENSMUST00000196829 712 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Snrpd1P62315 Dnd1-ps-201ENSMUST00000196992 964 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Snrpd1P62315 Cyct-201ENSMUST00000028430 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Snrpd1P62315 Gps2-201ENSMUST00000057884 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Snrpd1P62315 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Snrpd1P62315 Tmem107-201ENSMUST00000075980 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Snrpd1P62315 Nfat5-201ENSMUST00000075922 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Snrpd1P62315 Stpg2-202ENSMUST00000106239 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
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