Protein–RNA interactions for Protein: P61969

Lmo4, LIM domain transcription factor LMO4, mousemouse

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Length 165 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmo4P61969 Gm2467-201ENSMUST00000182266 1010 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Lmo4P61969 Gm3890-201ENSMUST00000182416 207 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Lmo4P61969 Gm6981-201ENSMUST00000182467 1008 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Lmo4P61969 Gm29396-201ENSMUST00000185659 716 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Lmo4P61969 Gm5896-201ENSMUST00000189662 1024 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Lmo4P61969 Gm37042-201ENSMUST00000193816 581 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Lmo4P61969 Gm44127-201ENSMUST00000203565 291 ntTSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Lmo4P61969 Gm45720-201ENSMUST00000211881 484 ntTSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Lmo4P61969 Gm10608-202ENSMUST00000213924 676 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Lmo4P61969 AC139319.1-201ENSMUST00000223331 690 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Lmo4P61969 Olfr463-201ENSMUST00000081417 936 ntAPPRIS P1 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Lmo4P61969 Olfr1209-201ENSMUST00000099809 933 ntAPPRIS P1 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Lmo4P61969 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Lmo4P61969 Gm12626-201ENSMUST00000117339 1983 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Lmo4P61969 Gm12623-201ENSMUST00000119849 1983 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Lmo4P61969 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Lmo4P61969 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Lmo4P61969 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Lmo4P61969 Gm37885-201ENSMUST00000192568 1391 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Lmo4P61969 AC101945.2-201ENSMUST00000227886 1377 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Lmo4P61969 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Lmo4P61969 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Lmo4P61969 Slc25a14-201ENSMUST00000033431 1760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Lmo4P61969 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Lmo4P61969 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Lmo4P61969 Pacrg-201ENSMUST00000041463 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Lmo4P61969 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
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Lmo4P61969 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Lmo4P61969 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Lmo4P61969 Ppp6r1-201ENSMUST00000064099 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Lmo4P61969 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Lmo4P61969 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Lmo4P61969 Gm4782-201ENSMUST00000168705 2046 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Lmo4P61969 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Lmo4P61969 Stpg2-202ENSMUST00000106239 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Lmo4P61969 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Lmo4P61969 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Lmo4P61969 Rnf220-202ENSMUST00000094853 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Lmo4P61969 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Lmo4P61969 Gm10327-201ENSMUST00000105222 1002 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Lmo4P61969 Gm12241-201ENSMUST00000118330 726 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Lmo4P61969 Gm9431-201ENSMUST00000119765 1051 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Lmo4P61969 Gm13350-201ENSMUST00000120519 479 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Lmo4P61969 Mypopos-201ENSMUST00000124897 560 ntTSL 3 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Lmo4P61969 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Lmo4P61969 2010310C07Rik-202ENSMUST00000190889 842 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Lmo4P61969 Gm44364-201ENSMUST00000198368 141 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Lmo4P61969 Gm7783-201ENSMUST00000204795 781 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Lmo4P61969 Rad51d-202ENSMUST00000021033 1201 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Lmo4P61969 Gm45865-201ENSMUST00000211815 945 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Lmo4P61969 Gm8227-201ENSMUST00000223306 571 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Lmo4P61969 Mrap-201ENSMUST00000038197 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Lmo4P61969 Olfr91-201ENSMUST00000087144 939 ntAPPRIS P1 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Lmo4P61969 Trpt1-201ENSMUST00000088223 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Lmo4P61969 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Lmo4P61969 Pfkfb3-212ENSMUST00000170196 2163 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Lmo4P61969 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Lmo4P61969 Egfl7-201ENSMUST00000100290 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Lmo4P61969 Gucy1a2-201ENSMUST00000115733 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Lmo4P61969 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Lmo4P61969 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Lmo4P61969 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Lmo4P61969 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Lmo4P61969 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Lmo4P61969 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Lmo4P61969 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Lmo4P61969 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Lmo4P61969 Gemin2-201ENSMUST00000021379 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
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Lmo4P61969 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Lmo4P61969 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Lmo4P61969 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Lmo4P61969 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Lmo4P61969 Npepps-215ENSMUST00000167806 2307 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Lmo4P61969 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Lmo4P61969 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Lmo4P61969 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Lmo4P61969 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Lmo4P61969 Usf1-207ENSMUST00000160486 1878 ntTSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
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Lmo4P61969 Bcas1os1-201ENSMUST00000133586 1239 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Lmo4P61969 1700030C14Rik-201ENSMUST00000139912 756 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Lmo4P61969 C030047K22Rik-201ENSMUST00000150382 1164 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Lmo4P61969 Gm17208-201ENSMUST00000168388 535 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Lmo4P61969 Gm20457-201ENSMUST00000173374 682 ntTSL 3 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Lmo4P61969 A930009A15Rik-201ENSMUST00000173620 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Lmo4P61969 Gm7584-201ENSMUST00000175829 940 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Lmo4P61969 Tex9-206ENSMUST00000183574 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Lmo4P61969 Gm36937-201ENSMUST00000192957 429 ntTSL 3 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Lmo4P61969 Gm43758-201ENSMUST00000199500 367 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Lmo4P61969 Gm18584-201ENSMUST00000203098 964 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Lmo4P61969 CT033793.1-201ENSMUST00000216883 565 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Lmo4P61969 Dph3-201ENSMUST00000022461 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Lmo4P61969 Cts7-204ENSMUST00000225321 1257 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Lmo4P61969 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Lmo4P61969 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Lmo4P61969 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Lmo4P61969 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Lmo4P61969 Gm15897-201ENSMUST00000117770 1486 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
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